mrcImageShapeOrientation

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mrcImageShapeOrientationは、3D画像(2D画像も可能)の粒子像などの向きを表現するために配向パラメータなどを求めるためのプログラムである。mrcImageShapePCAと同様の目的を別の手法を用いて求めるものである。

配向パラメータ

 配向パラメータとは、液晶などで分子の並びの秩序を示す際などに利用されている。ここでは密度の偏りを示すために用いている。

pi = <3cos(anglei) -1 >

であり、iは、x, y, zのそれぞの軸を示し、angleiは、その軸とのなす角を示している。