mrcImageShapeOrientation

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mrcImageShapeOrientationは、3D画像(2D画像も可能)の粒子像などの向きを表現するために配向パラメータなどを求めるためのプログラムである。mrcImageShapePCAと同様の目的を別の手法を用いて求めるものである。

配向パラメータ

 配向パラメータとは、液晶などで分子の並びの秩序を示す際などに利用されている。ここでは密度の偏りを示すために用いている。

pi = <3cos(anglei) -1 >

であり、iは、x, y, zのそれぞの軸を示し、angleiは、その軸とのなす角を示している。画像の軸は、ピクセル値が閾値を超えた2点について、ピクセル値が小さい点から大きい点に画像のベクトル軸をとるとしている。結果として、粒子の位置には依存しない解析が可能となっている。平均をとる際には、二つの点の密度(ピクセル値ー閾値)及びベクトルの長さの積をウェイトとして利用している。結果として、密度が大きい二つの点が離れているベクトルの向きが優先される。