mrcImageSimilarityEstimate

mrcImageSimilarityEstimateとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル	NULL
-o	選択	出力ファイル	NULL
-oCor	選択	出力ファイル	NULL
-ref	必須	参照ファイルリスト: ASCII	stdin
-corfilename	選択	相関ファイルリスト: ASCII	stdin
-cormode	選択	cormode	0
-ctfinfo	選択	CTF情報: ASCII	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

-cormode の詳細

モード	説明
0	Normal Correlation FxG*
1	Phase Correlation FxG*/ |FxG*|
2	Phase Correlation FxG*/sqrt(|FxG*|)
3	Normalized Normal Correlation FxG*/|F||G|)
16	(0, 0)=0

-ref のフォーマット

2Dファイル1
2Dファイル2
.
.

-ctfinfo のフォーマット

defocus Cs kV AmplitudeContrast

実行例

入力ファイルの画像

mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

57.2237 (78, 32, 0) 520564 (0, 0, 0) 4898.64 12077.5 150.969

参照ファイルのデータ

Input-1VOM-2D.mrc
Input-1VOM-Rot-2D.mrc
Input-1VOM-Rot1-2D.mrc
Input-1VOM-Rot2-2D.mrc
Input-1VOM-Rot3-2D.mrc
Input-1VOM-Rot4-2D.mrc

Input-1VOM-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 49749.7 (27, 28, 0) 7212.9 8827.15 110.339

Input-1VOM-Rot-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-609.552 (68, 18, 0) 43476 (45, 47, 0) 6507.15 7376.01 92.2001

Input-1VOM-Rot1-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-2.31309e-06 (29, 7, 0) 49749.2 (52, 51, 0) 6572.32 8769.91 109.624

Input-1VOM-Rot2-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 49749.2 (28, 52, 0) 6572.32 8769.91 109.624

Input-1VOM-Rot3-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-1.70846e-06 (56, 57, 0) 40287.6 (43, 43, 0) 6509.38 8494.21 106.178

Input-1VOM-Rot4-2D.mrcの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 40287.6 (43, 36, 0) 6509.38 8494.21 106.178