「mrcImageSinogramCorrelation」の版間の差分
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− | '''mrcImageSinogramCorrelation''' | + | '''mrcImageSinogramCorrelation'''とはシノグラムの相関を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイル設定(シノグラム | + | <td>入力ファイル設定: [[mrcImage]](シノグラム)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>参照ファイル設定(シノグラム | + | <td>参照ファイル設定: [[mrcImage]](シノグラム)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>threshold for Mode: 2</td> | <td>threshold for Mode: 2</td> | ||
<td>0.0</td> | <td>0.0</td> | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
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− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
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</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-LTR</td> | <td>-LTR</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>ratio of threshold for | + | <td>ratio of threshold for LengthMode: 1</td> |
<td>1.0</td> | <td>1.0</td> | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
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</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
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<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
<td>モードを設定</td> | <td>モードを設定</td> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>-LM</td> | ||
+ | <td>選択</td> | ||
+ | <td>Length Mode: for LengthCorrelation</td> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>-LCM</td> | ||
+ | <td>選択</td> | ||
+ | <td>Mode: for LengthCorrelationMode</td> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>-LTM</td> | ||
+ | <td>選択</td> | ||
+ | <td>Length Threshold Mode: for LengthCorrelation</td> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>-M</td> | ||
+ | <td>選択</td> | ||
+ | <td>Mode: for Correlation</td> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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</table> | </table> | ||
− | === | + | ===-m の詳細=== |
<table border="1"> | <table border="1"> | ||
<tr> | <tr> | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
− | <td>addition to Length Correlation (- | + | <td>addition to Length Correlation (-LCM)</td> |
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
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</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | + | <br> | |
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
− | === | + | ===[[Media:Input-B120-M-sin.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Input- | + | <td>[[画像:Input-B120-M-sin.png]]</td> |
+ | <td><p align="center">[[画像:Input-B120-M.png]]<br> | ||
+ | シノグラム変換前<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 65535 (12, 1, 0)<br> | |
− | + | 22776.7<br> | |
− | + | 23232.9<br> | |
− | + | 136.901<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
+ | <br> | ||
− | === | + | ===[[Media:Input-B120-sin.mrc | 参照ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像: | + | <td>[[画像:Input-B120-sin.png]]</td> |
+ | <td><p align="center">[[画像:Input-B120.png]]<br> | ||
+ | シノグラム変換前<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
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標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> |
− | + | 65535 (77, 34, 0)<br> | |
− | + | 22776.7<br> | |
− | + | 23232.9<br> | |
− | + | 136.901<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
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標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">-0. | + | <td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br> |
− | 1<br> | + | 1 (179, 1, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.0891167<br> |
− | 0. | + | 0.276684<br> |
− | 0. | + | 0.000768567<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <div>入力ファイルは参照ファイルの鏡像であるので、180度回転のところで相関値は1になる</div> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -LM=== | ||
+ | ====LM=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプションなし===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.820738 (267, 196, 0)<br> | ||
+ | 2 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.55432<br> | ||
+ | 0.524071<br> | ||
+ | 0.00145575<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | =====LTR=0.5で実行===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.0534014 (297, 316, 0)<br> | ||
+ | 2 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 0.993997<br> | ||
+ | 0.295261<br> | ||
+ | 0.000820169<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | =====wL=2で実行===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.787405 (267, 196, 0)<br> | ||
+ | 3 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.01952<br> | ||
+ | 0.928614<br> | ||
+ | 0.00257948<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -LCM=== | ||
+ | ====LCM=1, LM=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプションなし===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LCM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 1 (179, 1, 0)<br> | ||
+ | 0.0431111<br> | ||
+ | 0.18601<br> | ||
+ | 0.000516696<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | =====LTR=0.5で実行===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LCM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 1 (179, 1, 0)<br> | ||
+ | 0.0832207<br> | ||
+ | 0.253434<br> | ||
+ | 0.000703982<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ====LCM=2, LM=1, LTM=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプションなし===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LCM2-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.352012 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 1.41421 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.03461<br> | ||
+ | 0.136719<br> | ||
+ | 0.000379775<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | =====w=(1.0, 0.5, 0)で実行===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LCM2w-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.433757 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 1.31951 (179, 1, 0)<br> | ||
+ | 1.02611<br> | ||
+ | 0.109535<br> | ||
+ | 0.000304265<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -LTM=== | ||
+ | ====LTM=1, LM=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプションなし===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LTM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.123913 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 2 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.08912<br> | ||
+ | 0.276684<br> | ||
+ | 0.000768567<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | =====wL=2で実行===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-LTM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">1.12391 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 3 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 2.08912<br> | ||
+ | 0.276684<br> | ||
+ | 0.000768567<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ===オプション -m=== | ||
+ | ====m=3, LCM=2, LM=1, LTM=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプションなし===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-m3-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0.352012 (197, 162, 0)<br> | ||
+ | 1.41421 (180, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.03461<br> | ||
+ | 0.136719<br> | ||
+ | 0.000379775<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
− | === | + | =====w=(2, 0, 0)で実行===== |
− | = | + | |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata--mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> | + | <td>[[画像:Outdata-m3w-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td> |
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行249: | 行467: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"><br> | + | <td><p align="left">1 (310, 0, 0)<br> |
− | <br> | + | 1.25992 (180, 0, 0)<br> |
− | <br> | + | 1.0262<br> |
− | <br> | + | 0.0346682<br> |
− | <br></p> | + | 9.63005e-05<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> |
2014年1月21日 (火) 03:35時点における最新版
mrcImageSinogramCorrelationとはシノグラムの相関を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage(シノグラム) | NULL |
-r | 必須 | 参照ファイル設定: mrcImage(シノグラム) | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage | NULL |
-w | 選択 | Weigth for Mode: 1(w0th, w1st, w2nd) | (1.0, 0.0, 0.0) |
-T | 選択 | threshold for Mode: 2 | 0.0 |
-LTR | 選択 | ratio of threshold for LengthMode: 1 | 1.0 |
-LCT | 選択 | Optional :threshold for LengthCorrelation | 0.0 |
-wL | 選択 | Weight for LengthCorrelation | 1.0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-LM | 選択 | Length Mode: for LengthCorrelation | 0 |
-LCM | 選択 | Mode: for LengthCorrelationMode | 0 |
-LTM | 選択 | Length Threshold Mode: for LengthCorrelation | 0 |
-M | 選択 | Mode: for Correlation | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | simple Correlation |
1 | weight Correlation (addition to derivation) |
2 | threshold Correlation (addition to derivation) |
3 | power weight Correlation (addition to derivation : -LM=1 -LCM=2) |
-LM の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | without Length Correlation |
1 | addition to Length Correlation (-LCM) |
-LCM の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | weight (-wL , -LTM , -LTR) |
1 | threshold (-LTM , -LTR , -LCT) |
2 | power weight (-LTM , -LTR , -wL) |
-LTM の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | Multiply derivationMax and ratio(-LTR) |
1 | Average of all derivation |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (12, 1, 0) |
参照ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (77, 34, 0) |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
-0.876087 (197, 162, 0) 1 (179, 1, 0) |
オプション -LM
LM=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
-0.820738 (267, 196, 0) 2 (180, 0, 0) |
LTR=0.5で実行
最小 最大 |
-0.0534014 (297, 316, 0) 2 (180, 0, 0) |
wL=2で実行
最小 最大 |
-0.787405 (267, 196, 0) 3 (180, 0, 0) |
オプション -LCM
LCM=1, LM=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
-0.876087 (197, 162, 0) 1 (179, 1, 0) |
LTR=0.5で実行
最小 最大 |
-0.876087 (197, 162, 0) 1 (179, 1, 0) |
LCM=2, LM=1, LTM=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
0.352012 (197, 162, 0) 1.41421 (180, 0, 0) |
w=(1.0, 0.5, 0)で実行
最小 最大 |
0.433757 (197, 162, 0) 1.31951 (179, 1, 0) |
オプション -LTM
LTM=1, LM=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
0.123913 (197, 162, 0) 2 (180, 0, 0) |
wL=2で実行
最小 最大 |
1.12391 (197, 162, 0) 3 (180, 0, 0) |
オプション -m
m=3, LCM=2, LM=1, LTM=1で実行
その他のオプションなし
最小 最大 |
0.352012 (197, 162, 0) 1.41421 (180, 0, 0) |
w=(2, 0, 0)で実行
最小 最大 |
1 (310, 0, 0) 1.25992 (180, 0, 0) |