「mrcImageSinogramCorrelation」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
 
(同じ利用者による、間の8版が非表示)
行1: 行1:
'''mrcImageSinogramCorrelation'''とは[[Eos]]の[[コマンド]]である。
+
'''mrcImageSinogramCorrelation'''とはシノグラムの相関を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。
  
  
行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>入力ファイル設定(シノグラム: mrc)</td>  
+
<td>入力ファイル設定: [[mrcImage]](シノグラム)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-r</td>  
 
<td>-r</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>参照ファイル設定(シノグラム: mrc)</td>  
+
<td>参照ファイル設定: [[mrcImage]](シノグラム)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>出力ファイル設定</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行40: 行40:
 
<td>threshold for Mode: 2</td>  
 
<td>threshold for Mode: 2</td>  
 
<td>0.0</td>  
 
<td>0.0</td>  
</tr>
 
<tr>
 
<td>-M</td>
 
<td>選択</td>
 
<td>Mode: for Correlation</td>
 
<td>0</td>
 
</tr>
 
<tr>
 
<td>-LM</td>
 
<td>選択</td>
 
<td>Length Mode: for LengthCorrelation</td>
 
<td>0</td>
 
</tr>
 
<tr>
 
<td>-LTM</td>
 
<td>選択</td>
 
<td>Length Threshold Mode: for LengthCorrelation</td>
 
<td>0</td>
 
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-LTR</td>  
 
<td>-LTR</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>ratio of threshold for LenthMode: 1</td>  
+
<td>ratio of threshold for LengthMode: 1</td>  
 
<td>1.0</td>  
 
<td>1.0</td>  
</tr>
 
<tr>
 
<td>-LCM</td>
 
<td>選択</td>
 
<td>Mode: for LengthCorrelationMode</td>
 
<td>0</td>
 
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行93: 行69:
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>モードを設定</td>  
 
<td>モードを設定</td>  
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-LM</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Length Mode: for LengthCorrelation</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-LCM</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Mode: for LengthCorrelationMode</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-LTM</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Length Threshold Mode: for LengthCorrelation</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-M</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Mode: for Correlation</td>
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行103: 行103:
 
</table>  
 
</table>  
  
===モードの詳細===
+
===-m の詳細===
 
<table border="1">
 
<table border="1">
 
<tr>  
 
<tr>  
行139: 行139:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
<td>addition to Length Correlation (-LT)</td>  
+
<td>addition to Length Correlation (-LCM)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
行178: 行178:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 
+
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
+
===[[Media:Input-B120-M-sin.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Input-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Input-B120-M-sin.png]]</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-B120-M.png]]<br>
 +
シノグラム変換前<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行191: 行194:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left">-31.5059<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
4214<br>  
+
65535 (12, 1, 0)<br>  
2971.37<br>  
+
22776.7<br>  
7.47705<br>  
+
23232.9<br>  
5.28731<br></p>  
+
136.901<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
</table>  
+
</table>
 +
<br>
  
===参照ファイルの画像===
+
===[[Media:Input-B120-sin.mrc | 参照ファイル]]の画像===
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Refer-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Input-B120-sin.png]]</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-B120.png]]<br>
 +
シノグラム変換前<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行210: 行217:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left">-3.09955e-06<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
4214<br>  
+
65535 (77, 34, 0)<br>  
2969.22<br>  
+
22776.7<br>  
841.924<br>  
+
23232.9<br>  
7.50045<br></p>  
+
136.901<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
===オプション必須項目のみの場合===
行229: 行237:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left">-0.452528<br>  
+
<td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br>  
1<br>  
+
1 (179, 1, 0)<br>
0.692786<br>  
+
0.0891167<br>
0.305965<br>  
+
0.276684<br>
0.00169981<br></p>  
+
0.000768567<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<div>入力ファイルは参照ファイルの鏡像であるので、180度回転のところで相関値は1になる</div>
 +
<br>
 +
 
 +
===オプション -LM===
 +
====LM=1で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.820738 (267, 196, 0)<br>
 +
2 (180, 0, 0)<br>
 +
0.55432<br>
 +
0.524071<br>
 +
0.00145575<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 
 +
=====LTR=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.0534014 (297, 316, 0)<br>
 +
2 (180, 0, 0)<br>  
 +
0.993997<br>  
 +
0.295261<br>  
 +
0.000820169<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
 +
 +
=====wL=2で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.787405 (267, 196, 0)<br>
 +
3 (180, 0, 0)<br>
 +
1.01952<br>
 +
0.928614<br>
 +
0.00257948<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション -LCM===
 +
====LCM=1, LM=1で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LCM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br>
 +
1 (179, 1, 0)<br>
 +
0.0431111<br>
 +
0.18601<br>
 +
0.000516696<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====LTR=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LCM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.876087 (197, 162, 0)<br>
 +
1 (179, 1, 0)<br>
 +
0.0832207<br>
 +
0.253434<br>
 +
0.000703982<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====LCM=2, LM=1, LTM=1で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LCM2-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.352012 (197, 162, 0)<br>
 +
1.41421 (180, 0, 0)<br>
 +
1.03461<br>
 +
0.136719<br>
 +
0.000379775<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====w=(1.0, 0.5, 0)で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LCM2w-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.433757 (197, 162, 0)<br>
 +
1.31951 (179, 1, 0)<br>
 +
1.02611<br>
 +
0.109535<br>
 +
0.000304265<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション -LTM===
 +
====LTM=1, LM=1で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LTM1-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.123913 (197, 162, 0)<br>
 +
2 (180, 0, 0)<br>
 +
1.08912<br>
 +
0.276684<br>
 +
0.000768567<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====wL=2で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-LTM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">1.12391 (197, 162, 0)<br>
 +
3 (180, 0, 0)<br>
 +
2.08912<br>
 +
0.276684<br>
 +
0.000768567<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
 +
===オプション -m===
 +
====m=3, LCM=2, LM=1, LTM=1で実行====
 +
=====その他のオプションなし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m3-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.352012 (197, 162, 0)<br>
 +
1.41421 (180, 0, 0)<br>
 +
1.03461<br>
 +
0.136719<br>
 +
0.000379775<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
  
===オプション -===
+
=====w=(2, 0, 0)で実行=====  
====で実行====  
+
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Outdata--mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>  
+
<td>[[画像:Outdata-m3w-mrcImageSinogramCorrelation.png]]</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行249: 行467:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left"><br>  
+
<td><p align="left">1 (310, 0, 0)<br>  
<br>  
+
1.25992 (180, 0, 0)<br>  
<br>  
+
1.0262<br>  
<br>  
+
0.0346682<br>  
<br></p>  
+
9.63005e-05<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2014年1月21日 (火) 03:35時点における最新版

mrcImageSinogramCorrelationとはシノグラムの相関を行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage(シノグラム) NULL
-r 必須 参照ファイル設定: mrcImage(シノグラム) NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage NULL
-w 選択 Weigth for Mode: 1(w0th, w1st, w2nd) (1.0, 0.0, 0.0)
-T 選択 threshold for Mode: 2 0.0
-LTR 選択 ratio of threshold for LengthMode: 1 1.0
-LCT 選択 Optional  :threshold for LengthCorrelation 0.0
-wL 選択 Weight for LengthCorrelation 1.0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-LM 選択 Length Mode: for LengthCorrelation 0
-LCM 選択 Mode: for LengthCorrelationMode 0
-LTM 選択 Length Threshold Mode: for LengthCorrelation 0
-M 選択 Mode: for Correlation 0
-h 選択 ヘルプを表示  

-m の詳細

モード 説明
0 simple Correlation
1 weight Correlation (addition to derivation)
2 threshold Correlation (addition to derivation)
3 power weight Correlation (addition to derivation : -LM=1 -LCM=2)

-LM の詳細

モード 説明
0 without Length Correlation
1 addition to Length Correlation (-LCM)

-LCM の詳細

モード 説明
0 weight (-wL , -LTM , -LTR)
1 threshold (-LTM , -LTR , -LCT)
2 power weight (-LTM , -LTR , -wL)

-LTM の詳細

モード 説明
0 Multiply derivationMax and ratio(-LTR)
1 Average of all derivation


実行例

入力ファイルの画像

Input-B120-M-sin.png

Input-B120-M.png
シノグラム変換前

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

65535 (12, 1, 0)
22776.7
23232.9

136.901


参照ファイルの画像

Input-B120-sin.png

Input-B120.png
シノグラム変換前

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

65535 (77, 34, 0)
22776.7
23232.9

136.901


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.876087 (197, 162, 0)

1 (179, 1, 0)
0.0891167
0.276684

0.000768567

入力ファイルは参照ファイルの鏡像であるので、180度回転のところで相関値は1になる


オプション -LM

LM=1で実行

その他のオプションなし
Outdata-LM1-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.820738 (267, 196, 0)

2 (180, 0, 0)
0.55432
0.524071

0.00145575


LTR=0.5で実行
Outdata-LM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.0534014 (297, 316, 0)

2 (180, 0, 0)
0.993997
0.295261

0.000820169


wL=2で実行
Outdata-LM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.787405 (267, 196, 0)

3 (180, 0, 0)
1.01952
0.928614

0.00257948


オプション -LCM

LCM=1, LM=1で実行

その他のオプションなし
Outdata-LCM1-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.876087 (197, 162, 0)

1 (179, 1, 0)
0.0431111
0.18601

0.000516696


LTR=0.5で実行
Outdata-LCM1LTR-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.876087 (197, 162, 0)

1 (179, 1, 0)
0.0832207
0.253434

0.000703982


LCM=2, LM=1, LTM=1で実行

その他のオプションなし
Outdata-LCM2-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.352012 (197, 162, 0)

1.41421 (180, 0, 0)
1.03461
0.136719

0.000379775


w=(1.0, 0.5, 0)で実行
Outdata-LCM2w-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.433757 (197, 162, 0)

1.31951 (179, 1, 0)
1.02611
0.109535

0.000304265


オプション -LTM

LTM=1, LM=1で実行

その他のオプションなし
Outdata-LTM1-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.123913 (197, 162, 0)

2 (180, 0, 0)
1.08912
0.276684

0.000768567


wL=2で実行
Outdata-LTM1wL-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.12391 (197, 162, 0)

3 (180, 0, 0)
2.08912
0.276684

0.000768567



オプション -m

m=3, LCM=2, LM=1, LTM=1で実行

その他のオプションなし
Outdata-m3-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.352012 (197, 162, 0)

1.41421 (180, 0, 0)
1.03461
0.136719

0.000379775

w=(2, 0, 0)で実行
Outdata-m3w-mrcImageSinogramCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1 (310, 0, 0)

1.25992 (180, 0, 0)
1.0262
0.0346682

9.63005e-05