「mrcImageSpatialFrequencyFilter」の版間の差分
提供: Eospedia
(→-filter, -filterCol の実行例) |
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=== -filter, -filterCol の実行例 === | === -filter, -filterCol の実行例 === | ||
− | [[:Media:Input-1VOM.FNC.zip|-filter のファイル]]のデータ([[ | + | [[:Media:Input-1VOM.FNC.zip|-filter のファイル]]のデータ([[mrcImageFourierNeighborCorrelation]]で作成)<br> |
<pre> | <pre> | ||
0.000000 0.991796 1 FSC 9.519133 SNR -2.234766e+00 FNCF 0.887094 FNCN 0.921272 FSCfull 1.809870 Cref 1.345314 NoiseWeighted 1.345314 | 0.000000 0.991796 1 FSC 9.519133 SNR -2.234766e+00 FNCF 0.887094 FNCN 0.921272 FSCfull 1.809870 Cref 1.345314 NoiseWeighted 1.345314 |
2014年10月28日 (火) 03:40時点における版
mrcImageSpatialFrequencyFilterは、設定した空間周波数毎の重みに応じて、フィルタをかけるためのEosのツールである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-filter | 必須 | 入力: フィルタファイル: ASCII | NULL |
-filterCol | 選択 | Filter Column: (R, Weight) | (1, 2) |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-L | 選択 | LowCut: [/A] | -0.1 |
-H | 選択 | HighCut: [/A] | 1.0 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
-2390.42 (77, 14, 69) 4374.62 (17, 62, 46) |
-filter, -filterCol の実行例
-filter のファイルのデータ(mrcImageFourierNeighborCorrelationで作成)
0.000000 0.991796 1 FSC 9.519133 SNR -2.234766e+00 FNCF 0.887094 FNCN 0.921272 FSCfull 1.809870 Cref 1.345314 NoiseWeighted 1.345314 0.003906 0.982392 18 FSC 5.915698 SNR -2.406860e+00 FNCF 0.882438 FNCN 0.813045 FSCfull 1.710803 Cref 1.307977 NoiseWeighted 1.308476 0.007812 0.963411 62 FSC 3.088757 SNR -2.957507e+00 FNCF 0.864149 FNCN 0.779968 FSCfull 1.510854 Cref 1.229168 NoiseWeighted 1.231045 0.011719 0.934883 98 FSC 1.532664 SNR -5.754709e+00 FNCF 0.841882 FNCN 0.823140 FSCfull 1.210318 Cref 1.100144 NoiseWeighted 1.103928 0.015625 0.902410 210 FSC 0.767160 SNR 6.589575e+00 FNCF 0.843278 FNCN 0.833989 FSCfull 0.868240 Cref 0.931794 NoiseWeighted 0.937499 -中略- 0.078125 0.874788 5034 FSC 0.405730 SNR 1.365474e+00 FNCF 0.918267 FNCN 0.805186 FSCfull 0.577252 Cref 0.759771 NoiseWeighted 0.885015 0.082031 0.881223 5714 FSC 0.476054 SNR 1.817189e+00 FNCF 0.920790 FNCN 0.818042 FSCfull 0.645036 Cref 0.803142 NoiseWeighted 0.950282 0.085938 0.887642 5982 FSC 0.553597 SNR 2.480260e+00 FNCF 0.918410 FNCN 0.819727 FSCfull 0.712665 Cref 0.844195 NoiseWeighted 1.015377 0.089844 0.888627 6602 FSC 0.566220 SNR 2.610627e+00 FNCF 0.914992 FNCN 0.811965 FSCfull 0.723040 Cref 0.850317 NoiseWeighted 1.040449 0.093750 0.887771 7130 FSC 0.555237 SNR 2.496775e+00 FNCF 0.913122 FNCN 0.820130 FSCfull 0.714022 Cref 0.844998 NoiseWeighted 1.052645 0.097656 0.892122 8034 FSC 0.612713 SNR 3.164125e+00 FNCF 0.914968 FNCN 0.817642 FSCfull 0.759854 Cref 0.871696 NoiseWeighted 1.106391 0.101562 0.896910 8606 FSC 0.681085 SNR 4.271264e+00 FNCF 0.915875 FNCN 0.815180 FSCfull 0.810292 Cref 0.900162 NoiseWeighted 1.164968 0.105469 0.889562 9066 FSC 0.578393 SNR 2.743754e+00 FNCF 0.913390 FNCN 0.816582 FSCfull 0.732888 Cref 0.856089 NoiseWeighted 1.130557 0.109375 0.879936 9962 FSC 0.461431 SNR 1.713548e+00 FNCF 0.915444 FNCN 0.824100 FSCfull 0.631479 Cref 0.794656 NoiseWeighted 1.071679 0.113281 0.873392 10550 FSC 0.391352 SNR 1.285974e+00 FNCF 0.917362 FNCN 0.826946 FSCfull 0.562550 Cref 0.750033 NoiseWeighted 1.033735 -中略- 0.652344 0.820764 101724 FSC 0.004082 SNR 8.197289e-03 FNCF 0.914716 FNCN 0.819407 FSCfull 0.008131 Cref 0.090170 NoiseWeighted 3762.170730 0.656250 0.821992 98396 FSC 0.010648 SNR 2.152460e-02 FNCF 0.915023 FNCN 0.819700 FSCfull 0.021071 Cref 0.145159 NoiseWeighted 6882.065383 0.660156 0.820556 94632 FSC 0.002979 SNR 5.976104e-03 FNCF 0.915374 FNCN 0.820679 FSCfull 0.005941 Cref 0.077075 NoiseWeighted 4155.485366 0.664062 0.819228 90908 FSC -0.004008 SNR -7.984459e-03 FNCF 0.916605 FNCN 0.819217 FSCfull -0.008049 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000 0.667969 0.819197 86684 FSC -0.004168 SNR -8.302339e-03 FNCF 0.917529 FNCN 0.816882 FSCfull -0.008372 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000 -中略- 0.847656 0.821916 392 FSC 0.010239 SNR 2.068939e-02 FNCF 0.910826 FNCN 0.841365 FSCfull 0.020270 Cref 0.142373 NoiseWeighted 0.000000 0.851562 0.765112 200 FSC -0.224245 SNR -3.663394e-01 FNCF 0.922496 FNCN 0.812100 FSCfull -0.578132 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000 0.855469 0.812369 72 FSC -0.038602 SNR -7.433483e-02 FNCF 0.958576 FNCN 0.817161 FSCfull -0.080304 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000 0.859375 0.777638 8 FSC -0.182399 SNR -3.085238e-01 FNCF 0.982674 FNCN 0.748480 FSCfull -0.446181 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000 0.863281 0.000000 0 FSC -0.811999 SNR -8.962464e-01 FNCF 0.000000 FNCN 0.000000 FSCfull -8.638216 Cref 0.000000 NoiseWeighted 0.000000
このファイルではRが1列目、Weightが17列目に書かれているので、filterCol=(1, 17)で指定して実行する。
その他オプションなしで実行
最小 最大 |
-2.59766e+06 (8, 70, 17) 2.64186e+06 (43, 75, 36) |
そのままでは高周波数成分内でSN比が小さい重みが非常に大きくなってしまうので、ノイズ部分が強調され入力ファイルとは全く違う形が出来上がる。
H=0.105469 で実行
フィルタファイルにおいて、FSCが0.5を上回りSN比が3であるR=0.105469を基準にして実行する。
最小 最大 |
-178.789 (1, 26, 29) 798.082 (42, 35, 41) |
入力ファイルに対して周辺のノイズが軽減されている。