「mrcImageSymmetryFind」の版間の差分
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<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
<td>出力: [Average]</td> | <td>出力: [Average]</td> | ||
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2013年11月13日 (水) 07:03時点における版
mrcImageSymmetryFindとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -O | 選択 | 出力: [Symmetry Infomation] | stdout |
| -A | 選択 | 出力: [Average] | NULL |
| -centreMode | 選択 | centreMode | 1 |
| -t1 | 選択 | Threshold of CheckByAdd | 1.8 |
| -t2 | 選択 | Threshold in deciding the symmetry number | 0.9 |
| -m1 | 選択 | Mode of Check | 3 |
| -m2 | 選択 | Mode of Substruction | 2 |
| -dr | 選択 | Delta r of outputfile. | 1 |
| -dtheta | 選択 | Delta theta of outputfile. [degree] | 1 |
| -n | 選択 | Check to the number | 10 |
| -nRange | 選択 | Checkto the number: (nmin, nmax) | (2, 10) |
| -In | 選択 | 入力ファイル: (Image, Back) | (NULL, NULL) |
| -rangex | 選択 | 入力: (minx, maxx, delx) | (-3, 3, 1) |
| -rangey | 選択 | 入力: (miny, maxy, dely) | (-3, 3, 1) |
| -rangez | 選択 | 入力: (minz, maxz, delz) | (0, 0, 1) |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-centreMode の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Centre is GC (gravity of centre) |
| 1 | Centre is Rotational Symmetry |
-m1 の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 1 | Check by Add |
| 2 | Check by Correlation |
| 4 | Check by Fourier |
| 8 | Check by TTest |
| 16 | Check by SRP |
-m2 の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | No Subtraction |
| 1 | Mean Subtraction |
| 2 | Min Subtraction |
