「mrcImageTiltAxisSearchHelp」の版間の差分
(ページの作成:「'''mrcImageTiltAxisSearchHelp'''とはEosのコマンドである。 == オプション一覧 == ===メインオプション=== <table border="1"> <tr> ...」) |
(→オプション一覧) |
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(同じ利用者による、間の2版が非表示) | |||
行14: | 行14: | ||
<td>-I</td> | <td>-I</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td> | + | <td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行20: | 行20: | ||
<td>-o1d</td> | <td>-o1d</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](1D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行26: | 行26: | ||
<td>-o1de</td> | <td>-o1de</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](1DEnlarged)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行32: | 行32: | ||
<td>-o2d</td> | <td>-o2d</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]](2D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-aP</td> | <td>-aP</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>入力: 軸の位置: (OriginX, OriginY, OriginZ)</td> |
<td>(0.0, 0.0, 0.0)</td> | <td>(0.0, 0.0, 0.0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-a</td> | <td>-a</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>入力: AxisAngleYaw/Pitch[degree](AxisAngleYaw , AxisAnglePitch)</td> |
<td>(0.0, 0.0)</td> | <td>(0.0, 0.0)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行50: | 行50: | ||
<td>-R</td> | <td>-R</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>入力: LowPathFiltering(Rmin, Rmax)</td> |
<td>(0.05, 0.1)</td> | <td>(0.05, 0.1)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行56: | 行56: | ||
<td>-Interp</td> | <td>-Interp</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>入力: InterpolationMode</td> |
<td>2</td> | <td>2</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行91: | 行91: | ||
</table> | </table> | ||
− | === | + | ===入力ファイルリストのフォーマット=== |
<pre> | <pre> | ||
− | filename tiltAngle[degree] relativeTiltAxisYaw[degree] relativeTiltAxisPitch[degree] relativePosX[pixel] relativePosY[pixel] relativePosZ[pixel] | + | filename tiltAngle[degree] relativeTiltAxisYaw[degree] relativeTiltAxisPitch[degree] relativePosX[pixel] relativePosY[pixel] relativePosZ[pixel] |
</pre> | </pre> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
+ | ===入力ファイルのデータ=== | ||
+ | <div>-i のデータ</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | /Eos/img/Input.mrc 45 45 0 35 35 0 | ||
+ | |||
+ | </pre> | ||
+ | |||
+ | <div>Input.mrc の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Input-mrcImageTiltAxisSearch.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 65535 (49, 32, 0)<br> | ||
+ | 5410.81<br> | ||
+ | 12251.4<br> | ||
+ | 153.143<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
+ | ====-o1d の画像==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata2-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-57.1324 (60, 0, 0)<br> | ||
+ | 53955.1 (39, 0, 0)<br> | ||
+ | 15702.1<br> | ||
+ | 17807.4<br> | ||
+ | 1990.93<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====-o1de の画像==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata3-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-110.257 (63, 0, 0)<br> | ||
+ | 53729.6 (39, 0, 0)<br> | ||
+ | 18143.8<br> | ||
+ | 17959.2<br> | ||
+ | 2007.9<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====-o2d の画像==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-251.342 (75, 32, 0)<br> | ||
+ | 53881.2 (78, 0, 0)<br> | ||
+ | 19043.4<br> | ||
+ | 18687.1<br> | ||
+ | 233.589<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -aP=== | ||
+ | ====aP=(0.2, 0.4, 0)で実行==== | ||
+ | =====-o1d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata2-aP-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-106.416 (60, 0, 0)<br> | ||
+ | 51712.2 (39, 0, 0)<br> | ||
+ | 16012.3<br> | ||
+ | 17809.6<br> | ||
+ | 1991.18<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o1de の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata3-aP-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-134.835 (63, 0, 0)<br> | ||
+ | 51598.4 (41, 0, 0)<br> | ||
+ | 18498<br> | ||
+ | 17904.5<br> | ||
+ | 2001.78<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o2d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-aP-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-266.286 (52, 55, 0)<br> | ||
+ | 51448.8 (74, 7, 0)<br> | ||
+ | 19320.6<br> | ||
+ | 18594.9<br> | ||
+ | 232.436<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -a=== | ||
+ | ====a=(0.2, 0.8)で実行==== | ||
+ | =====-o1d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata2-a-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-118.858 (8, 0, 0)<br> | ||
+ | 59400.1 (32, 0, 0)<br> | ||
+ | 17676.5<br> | ||
+ | 18991.8<br> | ||
+ | 2123.34<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o1de の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata3-a-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-59.9404 (73, 0, 0)<br> | ||
+ | 59851.4 (27, 0, 0)<br> | ||
+ | 28866.2<br> | ||
+ | 17322.5<br> | ||
+ | 1936.71<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o2d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-a-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-183.744 (35, 0, 0)<br> | ||
+ | 60837.2 (68, 1, 0)<br> | ||
+ | 20601.8<br> | ||
+ | 19509.2<br> | ||
+ | 243.865<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ===オプション -Interp=== | ||
+ | ====Interp=3で実行==== | ||
+ | =====-o1d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata2-Interp-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-2669.23 (60, 0, 0)<br> | ||
+ | 3.71077e+07 (40, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.16912e+07<br> | ||
+ | 1.3051e+07<br> | ||
+ | 1.45915e+06<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o1de の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata3-Interp-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-3385.51 (63, 0, 0)<br> | ||
+ | 3.7112e+07 (40, 0, 0)<br> | ||
+ | 1.34889e+07<br> | ||
+ | 1.31573e+07<br> | ||
+ | 1.47104e+06<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====-o2d の画像===== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>[[画像:Outdata-Interp-mrcImageTiltAxisSearchHelp.png]]</td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-2.52088e+06 (49, 60, 0)<br> | ||
+ | 1.06573e+10 (71, 10, 0)<br> | ||
+ | 3.75889e+09<br> | ||
+ | 4.07181e+09<br> | ||
+ | 5.08976e+07<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> |
2014年8月4日 (月) 02:17時点における最新版
mrcImageTiltAxisSearchHelpとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-I | 必須 | 入力ファイルリスト: ASCII | NULL |
-o1d | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(1D) | NULL |
-o1de | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(1DEnlarged) | NULL |
-o2d | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(2D) | NULL |
-aP | 選択 | 入力: 軸の位置: (OriginX, OriginY, OriginZ) | (0.0, 0.0, 0.0) |
-a | 選択 | 入力: AxisAngleYaw/Pitch[degree](AxisAngleYaw , AxisAnglePitch) | (0.0, 0.0) |
-R | 選択 | 入力: LowPathFiltering(Rmin, Rmax) | (0.05, 0.1) |
-Interp | 選択 | 入力: InterpolationMode | 2 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
入力ファイルリストのフォーマット
filename tiltAngle[degree] relativeTiltAxisYaw[degree] relativeTiltAxisPitch[degree] relativePosX[pixel] relativePosY[pixel] relativePosZ[pixel]
実行例
入力ファイルのデータ
/Eos/img/Input.mrc 45 45 0 35 35 0
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (49, 32, 0) |
オプション必須項目のみの場合
-o1d の画像
最小 最大 |
-57.1324 (60, 0, 0) 53955.1 (39, 0, 0) |
-o1de の画像
最小 最大 |
-110.257 (63, 0, 0) 53729.6 (39, 0, 0) |
-o2d の画像
最小 最大 |
-251.342 (75, 32, 0) 53881.2 (78, 0, 0) |
オプション -aP
aP=(0.2, 0.4, 0)で実行
-o1d の画像
最小 最大 |
-106.416 (60, 0, 0) 51712.2 (39, 0, 0) |
-o1de の画像
最小 最大 |
-134.835 (63, 0, 0) 51598.4 (41, 0, 0) |
-o2d の画像
最小 最大 |
-266.286 (52, 55, 0) 51448.8 (74, 7, 0) |
オプション -a
a=(0.2, 0.8)で実行
-o1d の画像
最小 最大 |
-118.858 (8, 0, 0) 59400.1 (32, 0, 0) |
-o1de の画像
最小 最大 |
-59.9404 (73, 0, 0) 59851.4 (27, 0, 0) |
-o2d の画像
最小 最大 |
-183.744 (35, 0, 0) 60837.2 (68, 1, 0) |
オプション -Interp
Interp=3で実行
-o1d の画像
最小 最大 |
-2669.23 (60, 0, 0) 3.71077e+07 (40, 0, 0) |
-o1de の画像
最小 最大 |
-3385.51 (63, 0, 0) 3.7112e+07 (40, 0, 0) |
-o2d の画像
最小 最大 |
-2.52088e+06 (49, 60, 0) 1.06573e+10 (71, 10, 0) |