mrcImageToNAMDConstantForces
提供: Eospedia
mrcImageToNAMDConstantForcesとは3次元画像の微分画像を使って、PDB画像のモデリングを施すEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-ip | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
-o | 選択 | 出力: PDB with Constant Force | stdout |
-w | 選択 | 入力: Weight for Constant Force | 1.0 |
-s | 選択 | 入力: Scaling Factor for Constant Force | 1.0 |
-C | 選択 | 入力: Contour[if density>Contour, force=0] | 0.0 |
-R | 選択 | 入力: RotateMode | 0 |
-RW | 選択 | 入力: RotateWeight | 0.1 |
-S | 選択 | 入力: Seed | 0.0 |
-nowat | 選択 | No force for WAT (water residue) | |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
More Density is lower potential.
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |