mrcImageToNAMDConstantForces

提供: Eospedia
2013年12月10日 (火) 02:50時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

移動: 案内検索

mrcImageToNAMDConstantForcesとは3次元画像の微分画像を使って、PDB画像のモデリングを施すEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-ip 必須 入力ファイル: PDB NULL
-o 選択 出力: PDB with Constant Force stdout
-w 選択 入力: Weight for Constant Force 1.0
-s 選択 入力: Scaling Factor for Constant Force 1.0
-C 選択 入力: Contour[if density>Contour, force=0] 0.0
-R 選択 入力: RotateMode 0
-RW 選択 入力: RotateWeight 0.1
-S 選択 入力: Seed 0.0
-nowat 選択 No force for WAT (water residue)
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
More Density is lower potential.

モードの詳細

モード 説明
0


実行例