mrcImageVarianceAnalysis

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mrcImageVarianceAnalysisとは分散解析を行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力リスト: テキスト NULL
-r 選択 参照: 入力リスト NULL
-o 選択 出力: 分散率 NULL
-v 選択 出力: 分散解析 NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0

入力リストのフォーマット

入力1
入力2
   .
   .
   .

入力1, 2, ... のフォーマット

ファイル名		A	B
	. 			.	.
	.			.	.
A + B*density


分散分析のアルゴリズム

   VarianceRatio := VarinceBetweenClasses/(SumOfVarianceWithinEachClass)
                  VarinceBetweenClasses: variance between classes
                  VarinceWithClasses:    variance within each class 

General Information

   Kai-distribution: Kai^2 = SumOf (Xi - AvgOfXi)^2/sigma^2  
                           = s^2*(n-1)/sigma^2  : degree of freedom n-1 
                             when variables Xi are due to N(u, sigma^2)
   Kai-distribution: Kai^2 = Kai1^2 + Kai2^2 : degree of freedom m1 + m2
   F-distribution: F = (Kai1^2/k1)/(Kai2^2/k2)           : degree of freedom : (k1, k2)
                       (s1^2/sigma1^2)/(s2^2/sigma2^2)   : degree of freedom : (k1-1, k2-1)
   If sigma1 == sigma2, then                    
                       s1^2/s2^2  (Variance Ratio)       : degree of freedom : (k1-1, k2-1)


実行例

入力ファイルのデータ

/Eos/data/Input1.txt
/Eos/data/Input2.txt
/Eos/data/Input3.txt

Input1のデータ
/Eos/img/1VOM-40.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-45.mrc 1 1

1VOM-40.mrcの画像
1VOM-40.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3077.54 (41, 49, 0)
126.786
387.323

4.84154

1VOM-45.mrcの画像
1VOM-45.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3099.59 (17, 62, 0)
123.791
381.654

4.77068

Input2のデータ
/Eos/img/1VOM-50.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-55.mrc 0 1

1VOM-50.mrcの画像
1VOM-50.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3095.88 (33, 57, 0)
143.393
399.986

4.99982

1VOM-55.mrcの画像
1VOM-55.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3044.97 (51, 58, 0)
148.952
413.856

5.1732

Input3のデータ
/Eos/img/1VOM-60.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-65.mrc 0 1

1VOM-60.mrcの画像
1VOM-60.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3026.91 (50, 47, 0)
129.875
386.428

4.83035

1VOM-65.mrcの画像
1VOM-65.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3308.47 (26, 42, 0)
105.169
351.901

4.39877


入力ファイルのみの場合

-o の画像
Outdata-mrcImageVarianceAnalysis.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

50.0673 (30, 27, 0)

100 (14, 67, 0)
887.0022
7.68589

0.0960736

-v の画像

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.00134705 (30, 27, 0)

165008 (14, 67, 0)
44.5458
2086.16

26.077

mrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 3 
1 0 3 
2 0 3 
3 0 3 
4 0 3 

-中略-

28 27 1.06282 
29 27 1.17063 
30 27 0.00134705 
31 27 0.0869645 
32 27 0.158319 

-中略-

12 67 4.90624 
13 67 4.19018 
14 67 165008 
15 67 3.26777 
16 67 2.0586 

-中略-

75 79 3 
76 79 3 
77 79 3 
78 79 3 
79 79 3