「mrcImageZPad」の版間の差分

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行32: 行32:
 
<td>-w</td>  
 
<td>-w</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Width of slope. For mode 1. Usually w>=3 is good enough.</td>  
+
<td>スロープの幅(m=1で使用)(通常は3以上推奨)</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-v</td>  
 
<td>-v</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Value of out of threshold.</td>  
+
<td>範囲外の値</td>  
−
<td>0</td>  
+
<td>範囲内の平均値</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-Nx</td>  
 
<td>-Nx</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Number of x.Default is inputfile.</td>  
+
<td>出力ファイルのサイズ x</td>  
−
<td>0</td>  
+
<td>入力ファイルのサイズ x</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-Ny</td>  
 
<td>-Ny</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Number of y.Default is inputfile.</td>  
+
<td>出力ファイルのサイズ y</td>  
−
<td>0</td>  
+
<td>入力ファイルのサイズ y</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-Nz</td>  
 
<td>-Nz</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Number of z.Default is inputfile.</td>  
+
<td>出力ファイルのサイズ z</td>  
−
<td>0</td>  
+
<td>入力ファイルのサイズ z</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行93: 行93:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
−
<td>Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.</td>  
+
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
−
<td>Mulplying cos function. Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.</td>  
+
<td>余弦関数を掛ける</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
行103: 行103:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルの画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2 (35, 35, 5)<br>
 +
0.384947<br>
 +
0.605556<br>
 +
0.00086508<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1, r=20で実行====
 +
=====他のオプション設定なし=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1r-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br>
 +
パディング値<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 31)<br>
 +
2 (33, 6, 31)<br>
 +
0.533207<br>
 +
0.421141<br>
 +
0.00060163<br>
 +
0.494184<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
=====w=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1w-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br>
 +
パディング値<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 40)<br>
 +
2 (32, 4, 40)<br>
 +
0.454927<br>
 +
0.460374<br>
 +
0.000657677<br>
 +
0.350265<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
=====v=0, w=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1v-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br>
 +
パディング値<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2 (32, 4, 40)<br>
 +
0.289411<br>
 +
0.515718<br>
 +
0.000736739<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
=====Floating, w=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1Floating-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br>
 +
パディング値<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.350265 (0, 0, 40)<br>
 +
1.64973 (32, 4, 40)<br>
 +
0.104662<br>
 +
0.460374<br>
 +
0.000657677<br>
 +
0.350265<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
=====Nx=50, Ny=100, Nz=120, w=10で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-m1NxNyNz-mrcImageZPad.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br>
 +
パディング値<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2 (22, 19, 50)<br>
 +
0.332903<br>
 +
0.46817<br>
 +
0.000604405<br>
 +
0.350265<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>

2013年11月29日 (金) 07:00時点における版

mrcImageZPadとはパディングを行うEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-r 選択 rmax = height of z window * 0.5. 0
-w 選択 スロープの幅(m=1で使用)(通常は3以上推奨) 1
-v 選択 範囲外の値 範囲内の平均値
-Nx 選択 出力ファイルのサイズ x 入力ファイルのサイズ x
-Ny 選択 出力ファイルのサイズ y 入力ファイルのサイズ y
-Nz 選択 出力ファイルのサイズ z 入力ファイルのサイズ z
-Floating 選択 Floating
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

-m の詳細

モード 説明
0
1 余弦関数を掛ける


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2 (35, 35, 5)
0.384947
0.605556

0.00086508


オプション　-m

m=1, r=20で実行

他のオプション設定なし
Outdata-m1r-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差
標準誤差

パディング値

0 (0, 0, 31)

2 (33, 6, 31)
0.533207
0.421141
0.00060163

0.494184
w=10で実行
Outdata-m1w-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差
標準誤差

パディング値

0 (0, 0, 40)

2 (32, 4, 40)
0.454927
0.460374
0.000657677

0.350265
v=0, w=10で実行
Outdata-m1v-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差
標準誤差

パディング値

0 (0, 0, 0)

2 (32, 4, 40)
0.289411
0.515718
0.000736739

0
Floating, w=10で実行
Outdata-m1Floating-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差
標準誤差

パディング値

-0.350265 (0, 0, 40)

1.64973 (32, 4, 40)
0.104662
0.460374
0.000657677

0.350265
Nx=50, Ny=100, Nz=120, w=10で実行
Outdata-m1NxNyNz-mrcImageZPad.png

最小

最大
平均値
標準偏差
標準誤差

パディング値

0 (0, 0, 0)

2 (22, 19, 50)
0.332903
0.46817
0.000604405

0.350265

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