「mrcRadon2Dto3D」の版間の差分
(→メインオプション) |
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(同じ利用者による、間の7版が非表示) | |||
行14: | 行14: | ||
<td>-I</td> | <td>-I</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>入力ファイルリスト設定</td> | + | <td>入力ファイルリスト設定: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行38: | 行38: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定(radon3D)</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](radon3D)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行44: | 行44: | ||
<td>-ow</td> | <td>-ow</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
− | <td>出力ファイル設定(weight)</td> | + | <td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](weight)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行74: | 行74: | ||
<td>-InterpolationMode</td> | <td>-InterpolationMode</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>[[補間]]のモード</td> |
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行90: | 行90: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
+ | |||
+ | ===-InterpolationMode の詳細=== | ||
+ | [[補間]]の仕方を指定する。 | ||
+ | <table border="1"> | ||
+ | <div align="left"> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>モード</th> | ||
+ | <th>説明</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>0</td> | ||
+ | <td>最近傍法</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>1</td> | ||
+ | <td>線形補間法</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>2</td> | ||
+ | <td>3次補間法</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>3</td> | ||
+ | <td>2次曲面補間法</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </div> | ||
+ | </table> | ||
+ | <br> | ||
===-m の詳細=== | ===-m の詳細=== | ||
行109: | 行138: | ||
===-I のフォーマット=== | ===-I のフォーマット=== | ||
<pre> | <pre> | ||
− | + | 2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3 | |
− | + | . . . . . | |
− | + | . . . . . | |
− | + | . . . . . | |
</pre> | </pre> | ||
− | |||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
− | === | + | ===[[Media:Input-2DRadonSet0.zip | 入力ファイル]]のデータ=== |
<pre> | <pre> | ||
− | /Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc | + | /Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0 |
− | /Eos/2DRadonSet0/ | + | /Eos/2DRadonSet0/Set1.mrc ZOYS 0 45 0 |
− | /Eos/2DRadonSet0/ | + | /Eos/2DRadonSet0/Set2.mrc ZOYS 0 90 0 |
− | + | ||
− | + | ||
-中略- | -中略- | ||
− | /Eos/2DRadonSet0/ | + | /Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc ZOYS 0 360 0 |
− | /Eos/2DRadonSet0/ | + | /Eos/2DRadonSet0/Set9.mrc ZOYS 45 0 0 |
− | /Eos/2DRadonSet0/ | + | /Eos/2DRadonSet0/Set10.mrc ZOYS 45 90 0 |
− | + | ||
− | + | ||
− | + | -中略- | |
− | + | /Eos/2DRadonSet0/Set17.mrc ZOYS 45 360 0 | |
+ | /Eos/2DRadonSet0/Set18.mrc ZOYS 90 0 0 | ||
+ | /Eos/2DRadonSet0/Set19.mrc ZOYS 90 90 0 | ||
+ | |||
+ | -中略- | ||
+ | |||
+ | /Eos/2DRadonSet0/Set78.mrc ZOYS 360 270 0 | ||
+ | /Eos/2DRadonSet0/Set79.mrc ZOYS 360 315 0 | ||
+ | /Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0 | ||
+ | </pre> | ||
===オプション必須項目のみの場合=== | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
− | ==== | + | ====dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行==== |
+ | <div>-o の画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
行155: | 行189: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">-2.57165 (24, 86, 135)<br> |
− | + | 2746.57 (15, 90, 6)<br> | |
− | + | 82.8658<br> | |
− | + | 360.577<br> | |
− | + | 0.283296<br></p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
− | + | <div>-ow の画像</div> | |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td><p align="Center">[[画像:Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | <td><p align="Center">[[画像:Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0 (0, 2, 1)<br> | ||
+ | 180 (0, 0, 90)<br> | ||
+ | 2.79444<br> | ||
+ | 16.1952<br> | ||
+ | 0.0127241<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====dp=4, dtheta=2, dphi=2で実行==== | ||
+ | <div>-o の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata3-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
xy平面<br></p> | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata4-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-0.158943 (0, 66, 169)<br> | ||
+ | 2536.8 (5, 59, 0)<br> | ||
+ | 217.308<br> | ||
+ | 556.358<br> | ||
+ | 1.26184<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>-ow の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata5-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0 (0, 2, 1)<br> | ||
+ | 1260 (11, 0, 0)<br> | ||
+ | 19.1204<br> | ||
+ | 66.4953<br> | ||
+ | 0.150814<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ===オプション -m=== | ||
+ | ====m=1, dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプション設定なし===== | ||
+ | <div>-oの画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-2.57166 (24, 86, 136)<br> | ||
+ | 2746.57 (15, 91, 6)<br> | ||
+ | 172.326<br> | ||
+ | 504.539<br> | ||
+ | 0.396404<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>-ow の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata2-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">0 (0, 3, 1)<br> | ||
+ | 156 (0, 0, 0)<br> | ||
+ | 2.98641<br> | ||
+ | 10.0724<br> | ||
+ | 0.0079136<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | =====T=0.3で実行===== | ||
+ | <div>-oの画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | xy平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata1-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">-2.57165 (24, 86, 135)<br> | ||
+ | 2746.57 (15, 91, 6)<br> | ||
+ | 68.1399<br> | ||
+ | 327.812<br> | ||
+ | 0.257553<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>-ow の画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="Center">[[画像:Outdata2-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br> | ||
+ | yz平面<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
行176: | 行351: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0 ( | + | <td><p align="left">0 (0, 90, 0)<br> |
− | + | 156 (0, 0, 0)<br> | |
− | + | 1.5178<br> | |
− | + | 9.05289<br> | |
− | 0. | + | 0.00711262<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> |
2014年8月6日 (水) 00:19時点における最新版
mrcRadon2Dto3Dとは2次元ラドン空間の画像セットから3次元ラドン空間の画像を求めるEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-I | 必須 | 入力ファイルリスト設定: ASCII | NULL |
-Ib | 選択 | InputDataFileListBefore | NULL |
-ib | 選択 | InputDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D | NULL |
-iwb | 選択 | InputWeightDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage(radon3D) | NULL |
-ow | 必須 | 出力ファイル設定: mrcImage(weight) | NULL |
-dp | 必須 | Input: deltaP | 2.0 |
-dtheta | 必須 | Input: deltaTheta | 1 |
-dphi | 必須 | Input: deltaPhi | 1 |
-T | 選択 | Threshold | 1.0 |
-InterpolationMode | 選択 | 補間のモード | 0 |
-m | 選択 | Radon2Dto3D Intepolation Mode | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-InterpolationMode の詳細
補間の仕方を指定する。
モード | 説明 |
---|---|
0 | 最近傍法 |
1 | 線形補間法 |
2 | 3次補間法 |
3 | 2次曲面補間法 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | NearestNeighbor |
1 | HigherOrder (-T) |
-I のフォーマット
2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3 . . . . . . . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルのデータ
/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0 /Eos/2DRadonSet0/Set1.mrc ZOYS 0 45 0 /Eos/2DRadonSet0/Set2.mrc ZOYS 0 90 0 -中略- /Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc ZOYS 0 360 0 /Eos/2DRadonSet0/Set9.mrc ZOYS 45 0 0 /Eos/2DRadonSet0/Set10.mrc ZOYS 45 90 0 -中略- /Eos/2DRadonSet0/Set17.mrc ZOYS 45 360 0 /Eos/2DRadonSet0/Set18.mrc ZOYS 90 0 0 /Eos/2DRadonSet0/Set19.mrc ZOYS 90 90 0 -中略- /Eos/2DRadonSet0/Set78.mrc ZOYS 360 270 0 /Eos/2DRadonSet0/Set79.mrc ZOYS 360 315 0 /Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0
オプション必須項目のみの場合
dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行
最小 最大 |
-2.57165 (24, 86, 135) 2746.57 (15, 90, 6) |
最小 最大 |
0 (0, 2, 1) 180 (0, 0, 90) |
dp=4, dtheta=2, dphi=2で実行
最小 最大 |
-0.158943 (0, 66, 169) 2536.8 (5, 59, 0) |
最小 最大 |
0 (0, 2, 1) 1260 (11, 0, 0) |
オプション -m
m=1, dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行
その他のオプション設定なし
最小 最大 |
-2.57166 (24, 86, 136) 2746.57 (15, 91, 6) |
最小 最大 |
0 (0, 3, 1) 156 (0, 0, 0) |
T=0.3で実行
最小 最大 |
-2.57165 (24, 86, 135) 2746.57 (15, 91, 6) |
最小 最大 |
0 (0, 90, 0) 156 (0, 0, 0) |