「mrcRadon2Dto3D」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
(メインオプション)
 
(同じ利用者による、間の5版が非表示)
行14: 行14:
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>入力ファイルリスト設定</td>  
+
<td>入力ファイルリスト設定: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>出力ファイル設定(radon3D)</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](radon3D)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行44: 行44:
 
<td>-ow</td>  
 
<td>-ow</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>出力ファイル設定(weight)</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](weight)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行74: 行74:
 
<td>-InterpolationMode</td>  
 
<td>-InterpolationMode</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>InterpolationMode</td>  
+
<td>[[補間]]のモード</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行90: 行90:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
 +
 +
===-InterpolationMode の詳細===
 +
[[補間]]の仕方を指定する。
 +
<table border="1">
 +
<div align="left">
 +
<tr>
 +
<th>モード</th>
 +
<th>説明</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>0</td>
 +
<td>最近傍法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>1</td>
 +
<td>線形補間法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>2</td>
 +
<td>3次補間法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>3</td>
 +
<td>2次曲面補間法</td>
 +
</tr>
 +
</div>
 +
</table>
 +
<br>
  
 
===-m の詳細===
 
===-m の詳細===
行109: 行138:
 
===-I のフォーマット===
 
===-I のフォーマット===
 
<pre>
 
<pre>
ファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
+
2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
  
 
</pre>
 
</pre>
 
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
===入力ファイルのデータ===
+
===[[Media:Input-2DRadonSet0.zip | 入力ファイル]]のデータ===
 
<pre>
 
<pre>
 
/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0
 
/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0
行142: 行170:
 
/Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0
 
/Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0
 
</pre>
 
</pre>
 
[[Media:Input-2DRadonSet0.zip | 入力ファイル]]
 
  
  

2014年8月6日 (水) 00:19時点における最新版

mrcRadon2Dto3Dとは2次元ラドン空間の画像セットから3次元ラドン空間の画像を求めるEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I 必須 入力ファイルリスト設定: ASCII NULL
-Ib 選択 InputDataFileListBefore NULL
-ib 選択 InputDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D NULL
-iwb 選択 InputWeightDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage(radon3D) NULL
-ow 必須 出力ファイル設定: mrcImage(weight) NULL
-dp 必須 Input: deltaP 2.0
-dtheta 必須 Input: deltaTheta 1
-dphi 必須 Input: deltaPhi 1
-T 選択 Threshold 1.0
-InterpolationMode 選択 補間のモード 0
-m 選択 Radon2Dto3D Intepolation Mode 0
-h 選択 ヘルプを表示  


-InterpolationMode の詳細

補間の仕方を指定する。

モード 説明
0 最近傍法
1 線形補間法
2 3次補間法
3 2次曲面補間法


-m の詳細

モード 説明
0 NearestNeighbor
1 HigherOrder (-T)

-I のフォーマット

2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
               .                      .           .       .       .
               .                      .           .       .       .
               .                      .           .       .       .

実行例

入力ファイルのデータ

/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set1.mrc ZOYS 0 45 0
/Eos/2DRadonSet0/Set2.mrc ZOYS 0 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc ZOYS 0 360 0
/Eos/2DRadonSet0/Set9.mrc ZOYS 45 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set10.mrc ZOYS 45 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set17.mrc ZOYS 45 360 0
/Eos/2DRadonSet0/Set18.mrc ZOYS 90 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set19.mrc ZOYS 90 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set78.mrc ZOYS 360 270 0
/Eos/2DRadonSet0/Set79.mrc ZOYS 360 315 0
/Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0


オプション必須項目のみの場合

dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行

-o の画像

Outdata-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57165 (24, 86, 135)

2746.57 (15, 90, 6)
82.8658
360.577

0.283296

-ow の画像

Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 2, 1)

180 (0, 0, 90)
2.79444
16.1952

0.0127241

dp=4, dtheta=2, dphi=2で実行

-o の画像

Outdata3-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata4-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.158943 (0, 66, 169)

2536.8 (5, 59, 0)
217.308
556.358

1.26184

-ow の画像

Outdata5-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 2, 1)

1260 (11, 0, 0)
19.1204
66.4953

0.150814


オプション -m

m=1, dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行

その他のオプション設定なし
-oの画像

Outdata-m-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-m-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57166 (24, 86, 136)

2746.57 (15, 91, 6)
172.326
504.539

0.396404

-ow の画像

Outdata2-m-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 3, 1)

156 (0, 0, 0)
2.98641
10.0724

0.0079136

T=0.3で実行
-oの画像

Outdata-T-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-T-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57165 (24, 86, 135)

2746.57 (15, 91, 6)
68.1399
327.812

0.257553

-ow の画像

Outdata2-T-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 90, 0)

156 (0, 0, 0)
1.5178
9.05289

0.00711262