「mrcRefCorrelation」の版間の差分
行20: | 行20: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>参照ファイル: [[mrcImage]] ( | + | <td>参照ファイル: [[mrcImage]] (m=1のみ使用)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行32: | 行32: | ||
<td>-n</td> | <td>-n</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>ランダムにピックアップする画像数(M=1のみ使用)</td> |
<td>(入力ファイルのz) / 10</td> | <td>(入力ファイルのz) / 10</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行85: | 行85: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
− | <td> | + | <td>全ての画像から算出</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
− | <td> | + | <td>ランダムにピックアップして算出</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>2</td> | <td>2</td> | ||
− | <td> | + | <td>Omega=0,Alpha=0成分のみで算出</td> |
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
行125: | 行125: | ||
− | === | + | ===オプション必須項目のみの場合=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td><p align="center">[[画像: | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-mrcRefCorrelation.png]]<br> |
− | z= | + | z=1<br></p> |
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">最小<br> |
− | + | ||
− | + | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行139: | 行137: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">0.235765 (44, 2, 0)<br> |
− | + | 1 (0, 0, 0)<br> | |
− | + | 0.339868<br> | |
− | + | 0.0484346<br> | |
− | + | 0.00014903<br></p> | |
− | + | ||
− | + | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行151: | 行147: | ||
− | === | + | ===オプション -M=== |
+ | ====M=1で実行==== | ||
+ | =====その他のオプション設定なし===== | ||
+ | <div>出力結果</div> | ||
+ | <pre> | ||
+ | 175 201 285 278 294 81 107 50 192 238 296 15 111 12 160 167 241 41 174 257 | ||
+ | 71 96 277 264 116 261 8 78 233 58 273 309 | ||
+ | </pre> | ||
+ | |||
+ | <div>出力ファイルの画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td><p align="center">[[画像:Outdata-mrcRefCorrelation.png]]<br> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-M1-mrcRefCorrelation.png]]<br> |
− | z=1<br></p> | + | y=0, z=1<br></p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
行163: | 行168: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0. | + | <td><p align="left">0.286348 (0, 14, 0)<br> |
− | + | 0.393364 (0, 26, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.33098<br> |
− | 0. | + | 0.0300609<br> |
− | 0. | + | 0.00531407<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | </table> |
− | === | + | ====n=100で実行==== |
− | + | <div>出力結果</div> | |
+ | <pre> | ||
+ | 140 190 268 234 175 233 231 290 303 269 148 15 211 175 239 293 245 158 117 178 | ||
+ | 244 265 303 94 64 96 70 156 28 256 12 209 107 195 31 137 148 75 183 29 113 76 248 | ||
+ | 89 143 12 169 312 313 273 100 162 281 292 192 209 210 267 29 280 265 203 62 158 | ||
+ | 288 208 213 172 66 285 316 200 185 186 136 90 35 65 316 298 239 261 230 149 285 | ||
+ | 252 304 142 34 64 86 97 317 107 150 49 82 154 322 59 | ||
+ | </pre> | ||
+ | |||
+ | <div>出力ファイルの画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td><p align="center">[[画像:Outdata- | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-M1n-mrcRefCorrelation.png]]<br> |
− | z=1<br></p> | + | y=0, z=1<br></p> |
</td> | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
行186: | 行200: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0. | + | <td><p align="left">0.271516 (0, 39, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.497358 (0, 68, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.334499<br> |
− | 0. | + | 0.0342472<br> |
− | 0. | + | 0.00342472<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行196: | 行210: | ||
− | + | ====M=2で実行==== | |
− | ====M= | + | |
<div>出力結果</div> | <div>出力結果</div> | ||
<pre> | <pre> | ||
− | + | 133 138 143 148 153 158 163 168 173 178 183 188 193 | |
</pre> | </pre> | ||
+ | |||
+ | <div>出力ファイルの画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td><p align="center">[[画像:Outdata- | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-M2-mrcRefCorrelation.png]]<br> |
y=0, z=1<br></p> | y=0, z=1<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
行213: | 行228: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0. | + | <td><p align="left">0.293275 (0, 9, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.406869 (0, 12, 0)<br> |
− | 0. | + | 0.341384<br> |
− | 0. | + | 0.0358905<br> |
− | 0. | + | 0.00995423<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行223: | 行238: | ||
− | ==== | + | ===オプション -m=== |
+ | ====m=1で実行==== | ||
+ | <div>[[Media:Input-121P1-R.mrc | 参照ファイル]]の画像</div> | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata- | + | <td><p align="center">[[画像:Input-121P1-R.png]]<br> |
+ | z=156 〜 170<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
+ | 最大<br> | ||
+ | 平均値<br> | ||
+ | 標準偏差<br> | ||
+ | 標準誤差<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> | ||
+ | mrcFloatImage <br> | ||
+ | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | ||
+ | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | ||
+ | 6082.23<br> | ||
+ | 6479.76<br> | ||
+ | 9.22942<br></p> | ||
+ | </td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>出力ファイルの画像</div> | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m1-mrcRefCorrelation.png]]<br> | ||
+ | z=1<br></p> | ||
+ | </td> | ||
<td><p align="left">最小<br> | <td><p align="left">最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
行233: | 行277: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">0 ( | + | <td><p align="left">0.366595 (44, 5, 0)<br> |
− | + | 0.746259 (65, 65, 0)<br> | |
− | 0. | + | 0.478463<br> |
− | + | 0.0394641<br> | |
− | 0. | + | 0.000121428<br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> |
2013年12月27日 (金) 02:02時点における版
mrcRefCorrelationとは参照ファイルの相関図を作成するEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-r | 選択 | 参照ファイル: mrcImage (m=1のみ使用) | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-n | 選択 | ランダムにピックアップする画像数(M=1のみ使用) | (入力ファイルのz) / 10 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モード1 | 0 |
-M | 選択 | モード2 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | AutoCorrelation |
1 | CrossCorrelation |
-M の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 全ての画像から算出 |
1 | ランダムにピックアップして算出 |
2 | Omega=0,Alpha=0成分のみで算出 |
実行例
入力ファイルの画像
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション必須項目のみの場合
最小 最大 |
0.235765 (44, 2, 0) 1 (0, 0, 0) |
オプション -M
M=1で実行
その他のオプション設定なし
175 201 285 278 294 81 107 50 192 238 296 15 111 12 160 167 241 41 174 257 71 96 277 264 116 261 8 78 233 58 273 309
最小 最大 |
0.286348 (0, 14, 0) 0.393364 (0, 26, 0) |
n=100で実行
140 190 268 234 175 233 231 290 303 269 148 15 211 175 239 293 245 158 117 178 244 265 303 94 64 96 70 156 28 256 12 209 107 195 31 137 148 75 183 29 113 76 248 89 143 12 169 312 313 273 100 162 281 292 192 209 210 267 29 280 265 203 62 158 288 208 213 172 66 285 316 200 185 186 136 90 35 65 316 298 239 261 230 149 285 252 304 142 34 64 86 97 317 107 150 49 82 154 322 59
最小 最大 |
0.271516 (0, 39, 0) 0.497358 (0, 68, 0) |
M=2で実行
133 138 143 148 153 158 163 168 173 178 183 188 193
最小 最大 |
0.293275 (0, 9, 0) 0.406869 (0, 12, 0) |
オプション -m
m=1で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
最小 最大 |
0.366595 (44, 5, 0) 0.746259 (65, 65, 0) |