「mrcRefImageCorrelation」の版間の差分

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'''mrcRefImageCorrelation'''とは単一もしくは複数の[[mrcImage]]ファイルと参照像(2D)のセットを比較し、<br>
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'''mrcRefImageCorrelation'''とは単一もしくは複数の[[mrcImage]]ファイルと参照像(2Dセット)を比較し、<br>
 
相関値の最大値と最小値を出力する[[Eos]]の[[コマンド]]である。
 
相関値の最大値と最小値を出力する[[Eos]]の[[コマンド]]である。
  
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<td>-r</td>  
 
<td>-r</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
<td>参照ファイル: [[mrcImage]]</td>  
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<td>参照ファイル: [[mrcImage]](2Dセット)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
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<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
<td>入力ファイル: テキスト(2Dセット)</td>  
+
<td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td>  
 
<td>stdin</td>  
 
<td>stdin</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
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<td> </td>  
 
<td> </td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
</table>  
+
</table>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===

2014年8月6日 (水) 02:22時点における最新版

mrcRefImageCorrelationとは単一もしくは複数のmrcImageファイルと参照像(2Dセット)を比較し、
相関値の最大値と最小値を出力するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: mrcImage(2D) NULL
-r 必須 参照ファイル: mrcImage(2Dセット) NULL
-I 選択 入力ファイルリスト: ASCII stdin
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 相関の最小と最大となる画像を参照ファイルから探す
実空間で計算する
1 参照ファイルと入力ファイルを単一画像間で相関を計算する

フーリエ空間で計算し、出力ファイルはmrcImageとなる

オプション -z が必要

-I のフォーマット

mrcファイル1
mrcファイル2
.
.
.


実行例

参照ファイルの画像

Input-121P1-R163.png
z=163

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 56, 27, 326)

mrcFloatImage
-1503.16 (14, 25, 131)
36873.4 (28, 20, 158)
6082.23
6479.76

9.22942


オプション -i

入力ファイルを指定して実行

-i で使用する画像
Input-121P1-R163-N.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-11845.8 (6, 13, 0)

35379.1 (26, 16, 0)
5971.45
7299.77

187.73

出力結果
0 0.74104
1 0.758584
2 0.773967
3 0.78247
4 0.779196

-中略-

160 0.819107
161 0.867341
162 0.937789
163 0.866901
164 0.803931

-中略-

320 0.74582
321 0.756335
322 0.768114
323 0.782429
324 0.785562
min 205 0.729216
max 162 0.937789


オプション -I

入力ファイルを指定して実行

-I で使用するデータ
/Eos/img/Input-121P1-R162.mrc
/Eos/img/Input-121P1-R163-N.mrc
/Eos/img/Input-121P1-R164-N.mrc

Input-121P1-R162.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1191.36 (16, 25, 0)

28576.9 (15, 16, 0)
6076.13
6529.7

167.926


Input-121P1-R163-N.mrcは-i の入力ファイルを使用する


Input-121P1-R164-N.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-20586.3 (8, 8, 0)

38227.9 (16, 18, 0)
6292.81
9386.21

241.387

出力結果
/Eos/img/Input-121P1-R162.mrc min 270 0.787533 max 161 1
/Eos/img/Input-121P1-R163-N.mrc min 205 0.729216 max 162 0.937789
/Eos/img/Input-121P1-R164-N.mrc min 5 0.62733 max 163 0.816337