「mrcRefImageCorrelation」の版間の差分
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===参照ファイルの画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Refer-mrcRefImageCorrelation.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-1.12463 (7, 0, 62)<br> | ||
| + | 15 (11, 0, 0)<br> | ||
| + | 4.18957<br> | ||
| + | 3.05256<br> | ||
| + | 0.016127<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -i=== | ||
| + | ====入力ファイルを指定して実行==== | ||
| + | <div>-i で使用する画像</div> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-mrcRefImageCorrelation.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-1.00808 (6, 8, 69)<br> | ||
| + | 15 (8, 0, 0)<br> | ||
| + | 0.485274<br> | ||
| + | 0.601436<br> | ||
| + | 0.00330719<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | <div>出力結果 </div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0 0.0162739 | ||
| + | 1 0.0184617 | ||
| + | 2 0.0142153 | ||
| + | 3 0.0110854 | ||
| + | 4 0.0163822 | ||
| + | 5 0.0217035 | ||
| + | 6 0.0224571 | ||
| + | 7 0.0193035 | ||
| + | 8 0.0175828 | ||
| + | 9 0.0174063 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + | 97 0.0299795 | ||
| + | 98 0.0211237 | ||
| + | 99 0.0200098 | ||
| + | 100 0.0215208 | ||
| + | 101 0.0193045 | ||
| + | 102 0.024879 | ||
| + | 103 0.0295699 | ||
| + | 104 0.0285726 | ||
| + | min 38 0.0100648 | ||
| + | max 62 0.0303784 | ||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -I=== | ||
| + | ====入力ファイルを指定して実行==== | ||
| + | <div>-I で使用するデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input.mrc | ||
| + | /Eos/img/Input.mrc | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | <div>Inputの画像</div> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-mrcRefImageCorrelation.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-1.00808 (6, 8, 69)<br> | ||
| + | 15 (8, 0, 0)<br> | ||
| + | 0.485274<br> | ||
| + | 0.601436<br> | ||
| + | 0.00330719<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | <div>出力結果 </div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input.mrc min 38 0.0100648 max 62 0.0303784 | ||
| + | /Eos/img/Input.mrc min 38 0.0100648 max 62 0.0303784 | ||
| + | </pre> | ||
2013年12月4日 (水) 05:07時点における版
mrcRefImageCorrelationとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 選択 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -r | 必須 | 参照ファイル: mrcImage | NULL |
| -I | 選択 | InputDataFiles | stdin |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | To find the images in the reference file of min and max correlation. Correlation is calclated in the real space. |
| 1 | To calculate the correlation between one image of the reference file and input file. The calculation is performed in the fourier space and the output is a mrc image file. |
実行例
参照ファイルの画像
 |
最小 最大 |
-1.12463 (7, 0, 62) 15 (11, 0, 0) |
オプション -i
入力ファイルを指定して実行
-i で使用する画像
 |
最小 最大 |
-1.00808 (6, 8, 69) 15 (8, 0, 0) |
出力結果
0 0.0162739 1 0.0184617 2 0.0142153 3 0.0110854 4 0.0163822 5 0.0217035 6 0.0224571 7 0.0193035 8 0.0175828 9 0.0174063 -中略- 97 0.0299795 98 0.0211237 99 0.0200098 100 0.0215208 101 0.0193045 102 0.024879 103 0.0295699 104 0.0285726 min 38 0.0100648 max 62 0.0303784
オプション -I
入力ファイルを指定して実行
-I で使用するデータ
/Eos/img/Input.mrc /Eos/img/Input.mrc
Inputの画像
|
最小 最大 |
-1.00808 (6, 8, 69) 15 (8, 0, 0) |
出力結果
/Eos/img/Input.mrc min 38 0.0100648 max 62 0.0303784 /Eos/img/Input.mrc min 38 0.0100648 max 62 0.0303784
