mrcSinogramFET
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mrcSinogramFETとはシノグラムの特徴量を算出するEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage(シノグラム) | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage(シノグラムFET) | NULL |
-ch | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(シノグラムFET) | NULL |
-sm | 選択 | SmoothingFilter(move range of column smoothing by moving-average) | 1 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-ch のファイルは正規化のために使用する
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
出力ファイルのフォーマット
シノグラムの各θ毎に以下の値を出力する
幅 対称度 尖度 . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (77, 34, 0) |
オプション必須項目のみの場合
-oのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0614942 0.0325917 1.78762 0.0605712 0.0632562 1.93108 0.0639257 0.0789107 1.95908 0.0634946 -0.0737892 2.01836 0.0608277 0.202078 1.89107 0.0542547 0.144344 1.85886 0.0521331 0.10485 1.82517 0.0616536 0.0753629 1.8386 0.0620365 0.00882033 1.76001 0.0609849 -0.178435 1.8612 -中略- 0.0594001 0.0137078 1.69186 0.0641533 -0.0104053 1.8428 0.0666817 -0.0237231 1.73576 0.0679321 0.135993 1.93031 0.0616724 0.0270474 1.75367 0.0614942 -0.0325917 1.78763 0.0605712 -0.0632519 1.93109 0.0639255 -0.0789105 1.95908 0.0634947 0.0737856 2.01836 0.0608276 -0.202075 1.89107 -中略- 0.0577482 -0.05145 1.85321 0.060355 0.0692867 1.93637 0.0553964 0.0399175 1.82433 0.0564827 0.121926 1.75859 0.0580604 -0.00824017 1.65152 0.0594001 -0.0137042 1.69186 0.0640352 0.0111142 1.84374 0.0664901 0.0239018 1.73636 0.0676839 -0.135384 1.93055 0.0616659 -0.0268808 1.75356
-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.161654 0.264188 -0.499746 -0.23463 0.540136 0.936777 0.0305907 0.68101 1.21714 -0.00349375 -0.693129 1.81068 -0.214353 1.78939 0.536106 -0.734039 1.26984 0.213555 -0.901784 0.91444 -0.123757 -0.149048 0.649083 0.010706 -0.118778 0.0502702 -0.776229 -0.201925 -1.63483 0.237015 -中略- -0.327226 0.0942524 -1.45864 0.0485876 -0.12274 0.0527388 0.248493 -0.242586 -1.01904 0.347354 1.19469 0.929017 -0.147568 0.214295 -0.839686 -0.161656 -0.322394 -0.49972 -0.234634 -0.598304 0.9368 0.030576 -0.739215 1.21713 -0.00348786 0.634889 1.81067 -0.214361 -1.84757 0.536089 -中略- -0.457831 -0.492099 0.156978 -0.25172 0.594404 0.98975 -0.643776 0.330112 -0.132139 -0.557883 1.0681 -0.790415 -0.433148 -0.103256 -1.86261 -0.327223 -0.152427 -1.45862 0.0392519 0.0709124 0.0621676 0.233343 0.185987 -1.01302 0.327728 -1.24742 0.931392 -0.148078 -0.271002 -0.84082
オプション -sm
sm=2で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0918657 0.0344836 2.73613 0.0913183 0.0795521 2.8249 0.0925341 0.102712 2.91063 0.0939957 0.0341889 2.95426 0.0924467 0.0957727 2.92026 0.0878268 0.204839 2.84051 0.0834795 0.156225 2.80756 0.087179 0.121735 2.79743 0.0921307 0.0737197 2.76485 0.0917963 -0.0531793 2.77615 -中略- 0.0890158 0.0426021 2.63723 0.0920623 0.0332794 2.73287 0.0957031 0.0145639 2.75482 0.0975925 0.0877632 2.79858 0.0950878 0.113149 2.80753 0.0918689 0.028856 2.73619 0.0913183 -0.0162937 2.8249 0.0925339 -0.0394531 2.91063 0.0939957 0.0290656 2.95426 0.0924467 -0.0325166 2.92026 -中略- 0.0912556 -0.0290791 2.76966 0.0906757 -0.0484107 2.77224 0.0893372 0.0405465 2.86033 0.0881613 0.0862302 2.8459 0.0862251 0.11255 2.75701 0.0875571 0.0884708 2.6706 0.0890158 0.0206559 2.63723 0.0920033 0.0303331 2.73334 0.0955483 0.0491361 2.75559 0.0973726 -0.024113 2.799 0.0949605 -0.0495043 2.8076
-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.157651 -0.0041597 -0.843173 -0.201705 0.490999 0.274878 -0.103854 0.745449 1.35475 0.0137921 -0.00739793 1.9044 -0.110882 0.669213 1.47605 -0.482721 1.86751 0.471514 -0.832616 1.33339 0.0564812 -0.534862 0.954453 -0.0711068 -0.136321 0.42692 -0.481491 -0.163234 -0.967296 -0.339148 -中略- -0.387022 0.0850372 -2.08895 -0.141824 -0.0173904 -0.884264 0.151211 -0.223014 -0.607772 0.30328 0.581214 -0.0566197 0.101689 0.860117 0.0561869 -0.157392 -0.0659893 -0.842443 -0.201708 -0.56204 0.274908 -0.103864 -0.816489 1.35476 0.0137873 -0.0636858 1.90439 -0.110883 -0.740279 1.47604 -中略- -0.253423 -0.914905 -0.388412 -0.361154 0.062452 0.721254 -0.455798 0.564371 0.539412 -0.611632 0.853537 -0.580257 -0.504425 0.588987 -1.66867 -0.387021 -0.156082 -2.08894 -0.146574 -0.0497604 -0.878321 0.138748 0.156824 -0.598054 0.285579 -0.64795 -0.0513402 0.0914399 -0.926919 0.0569677