mrcSinogramFETcalcSDforNormalize

mrcSinogramFETcalcSDforNormalizeとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	選択	入力ファイル: mrcImage(FET)	NULL
-s	選択	selectFETfile	1
-l	必須	SDlibraryFile: mrcImage	NULL
-o	選択	出力ファイル: mrcImage(SD)	NULL
-ow	選択	出力ファイル: mrcImage(Weight)
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	SDlibraryFileから読み出して-o, -owへ出力する(必須オプション: -l)
1	SDlibraryFileを上書きする(必須オプション: -s, -i, -l)

SDlibraryFileはarray2mrcにて作成できる(サイズ: x=(特徴量の数 + 1), y=6, z=0, データ: 全て0.0

-s の詳細

モード	説明
0	noise-free refarence FETdata
1	no-smoothing FET data
それ以外	smoothed FET data

実行例

入力ファイルのデータ

-iファイルのデータ

mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合

              0           65535               0 
              0               0               0 
              1               0               1 

-lファイルのデータ

mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合

        28299.7         7382.14         20943.9 
        20706.4         10440.1         15260.5 

オプション必須項目のみの場合

-o のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合

        7382.14         20943.9 

-ow のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合

              0         9.09091