mrcSinogramFETcalcSDforNormalize

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mrcSinogramFETcalcSDforNormalizeとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: mrcImage(FET) NULL
-s 選択 selectFETfile 1
-l 必須 SDlibraryFile: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: mrcImage(SD) NULL
-ow 選択 出力ファイル: mrcImage(Weight)
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  


モードの詳細

モード 説明
0 SDfile writeout from liblary file

Library(option -l) is Essential

weightfile writeout from liblary file when mode 0
1 to overwrite data library

Essential options are: -sm, -i, -l
if you want to make new data library,
you have to make 2Dmrc-format pre-library file using tool "array2mrc"

Array: x=(number of feature + 1), y=6, z=0, data: all 0.0


-s の詳細

モード 説明
0 noise-free refarence FETdata
1 no-smoothing FET data
それ以外 smoothed FET data


実行例

入力ファイルのデータ

-iファイルのデータ
mrcImageMakeDumpで見た場合
      0.0528259        0.287465         2.43992 
      0.0530244        0.293207         2.43615 
      0.0531626        0.296749          2.4324 
      0.0536801        0.289733         2.40744 
      0.0538179        0.298354         2.41023 
      0.0545124        0.322229         2.39943 
      0.0546532        0.328165         2.39395 
       0.054684        0.334097         2.39568 
      0.0545885        0.333984         2.39575 
      0.0543876         0.33627         2.40106 

-中略-

      0.0518319       -0.232946         2.44283 
      0.0522862       -0.247554         2.43665 
      0.0525356       -0.256483         2.43349 
      0.0525809        -0.26767         2.43681 
      0.0527164       -0.282587         2.43866 
      0.0528259       -0.287465         2.43992 
      0.0530244       -0.293207         2.43615 
      0.0531626       -0.296749          2.4324 
      0.0536801       -0.289733         2.40744 
      0.0538179       -0.298354         2.41023 

-中略-

      0.0502116        0.210372         2.45587 
      0.0505199        0.218583         2.45832 
      0.0508604        0.223915         2.45576 
      0.0510345        0.229516         2.45911 
      0.0512054         0.23358         2.46195 
      0.0518319        0.232946         2.44283 
      0.0522862        0.247554         2.43665 
      0.0525356        0.256483         2.43349 
      0.0525809         0.26767         2.43681 
      0.0527164        0.282587         2.43866 


-lファイルのデータ
mrcImageMakeDumpで見た場合
        28299.7         7382.14         20943.9 
        20706.4         10440.1         15260.5 


オプション必須項目のみの場合

-o のデータをmrcImageMakeDumpで見た場合
        7382.14         20943.9 


-ow のデータをmrcImageMakeDumpで見た場合
              0         9.09091