「pdb2ucd」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル</td> | + | <td>入力ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| − | |||
===[[:Media:Input-121P.pdb.zip|入力ファイル]]の画像=== | ===[[:Media:Input-121P.pdb.zip|入力ファイル]]の画像=== | ||
<table> | <table> | ||
2014年2月13日 (木) 08:04時点における最新版
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
 |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
オプション必須項目のみの場合
出力結果
nNodeComponent 4nElement 1 nElement 1 nElement 1 nElement 1 0 TemperatureFactor A2 1 ChainID 2 ResNum 3 CA
-o のデータ
166 165 4 0 0 0 -5.913000 31.927999 -6.676000 1 -4.759000 28.930000 -4.751000 2 -4.531000 29.674000 -1.062000 3 -2.465000 27.513000 1.336000 4 -3.586000 27.580000 4.978000 -中略- 161 3.951000 18.742001 0.732000 162 0.404000 20.135000 0.490000 163 0.711000 20.049999 -3.346000 164 1.520000 16.308001 -3.145000 165 -1.217000 15.280000 -0.638000 0 1 line 0 1 1 1 line 1 2 2 1 line 2 3 3 1 line 3 4 4 1 line 4 5 -中略- 160 1 line 160 161 161 1 line 161 162 162 1 line 162 163 163 1 line 163 164 164 1 line 164 165 4 1 1 1 1 TemperatureFactor, A2 ChainID, ResNum, CA, 0 17.270000 65.000000 1.000000 1.000000 1 16.709999 65.000000 2.000000 1.000000 2 19.320000 65.000000 3.000000 1.000000 3 15.130000 65.000000 4.000000 1.000000 4 16.799999 65.000000 5.000000 1.000000 -中略- 161 14.550000 65.000000 162.000000 1.000000 162 15.140000 65.000000 163.000000 1.000000 163 19.200001 65.000000 164.000000 1.000000 164 26.920000 65.000000 165.000000 1.000000 165 28.840000 65.000000 166.000000 1.000000
