pdbCrystalCreate

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2013年12月10日 (火) 02:41時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

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pdbCrystalCreateとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: [pdb] NULL
-I 必須 入力ファイル: [Crystal Information] NULL
-o 必須 出力ファイル: [pdb] NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 P1
1 らせん対称

-I のフォーマット

aAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
bAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
cAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
CellLength  %15.6g %15.6g %15.6g
Origin      %15.6g %15.6g %15.6g
N           %15d %15d %15d
StartN      %15d %15d %15d
SpaceGroup  %15d
HelixInfo   %10d %10d %10d
パラメータ設定が重要

CellLengthとAxisは依存している。
axisは単位ベクトルでなければならない。

HelixInfo t u n

実行例