「pdbSecondaryStructurePrint」の版間の差分

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(入力ファイルの詳細)
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==実行例==
 
==実行例==
 
===[[:Media:Input-121P.pdb.zip|入力ファイル]]の詳細===
 
===[[:Media:Input-121P.pdb.zip|入力ファイル]]の詳細===
<div>[[画像:Inputdata-pdbSecondaryStructurePrint.png]]<br>
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<div>[[画像:121p.png]]<br>
 
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[[画像:Inputdata-Info-pdbSecondaryStructurePrint.png]]</div>
+
[[画像:121p-Info.png]]</div>
 
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2014年8月18日 (月) 00:18時点における版

pdbSecondaryStructurePrintは二次構造を表示するEosコマンド

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: PDB stdin
-o 必須 出力ファイル設定: ASCII stdout
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの詳細

121p.png


121p-Info.png


オプション必須項目のみの場合

下記の内容が出力される
HELIX    1  A1 LYS A   16  GLN A   25  1                                 10
HELIX    2  A2 SER A   65  THR A   74  1                                 10
HELIX    3  A3 THR A   87  VAL A  103  1                                 17
HELIX    4  A4 SER A  127  TYR A  137  1                                 11
HELIX    5  A5 VAL A  152  ARG A  164  1                                 13
SHEET    1   S 6 GLU A  37  ILE A  46  0                             
SHEET    2   S 6 GLU A  49  THR A  58 -1  O  LEU A  53   N  LYS A  42 
SHEET    3   S 6 THR A   2  VAL A   9  1  N  LEU A   6   O  ASP A  54 
SHEET    4   S 6 GLY A  77  ALA A  83  1  N  LEU A  79   O  VAL A   7 
SHEET    5   S 6 MET A 111  ASN A 116  1  N  VAL A 114   O  CYS A  80 
SHEET    6   S 6 TYR A 141  GLU A 143  1  N  ILE A 142   O  LEU A 113