pdbSecondaryStructurePrint
提供: Eospedia
pdbSecondaryStructurePrintは二次構造を表示するEosのコマンド。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル設定 | stdin |
-o | 必須 | 出力ファイル設定 | stdout |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
実行例
入力ファイルの詳細
オプション必須項目のみの場合
下記の内容が出力される
HELIX 1 A1 LYS A 16 GLN A 25 1 10 HELIX 2 A2 SER A 65 THR A 74 1 10 HELIX 3 A3 THR A 87 VAL A 103 1 17 HELIX 4 A4 SER A 127 TYR A 137 1 11 HELIX 5 A5 VAL A 152 ARG A 164 1 13 SHEET 1 S 6 GLU A 37 ILE A 46 0 SHEET 2 S 6 GLU A 49 THR A 58 -1 O LEU A 53 N LYS A 42 SHEET 3 S 6 THR A 2 VAL A 9 1 N LEU A 6 O ASP A 54 SHEET 4 S 6 GLY A 77 ALA A 83 1 N LEU A 79 O VAL A 7 SHEET 5 S 6 MET A 111 ASN A 116 1 N VAL A 114 O CYS A 80 SHEET 6 S 6 TYR A 141 GLU A 143 1 N ILE A 142 O LEU A 113