pdbTwoProteinFit
提供: Eospedia
pdbTwoProteinFitとは二つのタンパク質の位置を合わせるEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル | NULL |
-ires | 選択 | 入力ファイル: [ResidueInformation] | NULL |
-isel | 選択 | Output: Selected residue of in after fitting | NULL |
-r | 必須 | 参照ファイル | NULL |
-rres | 選択 | 参照ファイル: [ResidueInformation] | NULL |
-rsel | 選択 | Output: Selected residue of in after fitting | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル | NULL |
-oMatrix | 選択 | 出力: Matrix | stdout |
-oParam | 選択 | 出力: Param | stdout |
-oDis | 選択 | 出力: PDB Distance as Temp | stdout |
-oDis2 | 選択 | 出力: Distance List for Ca | stdout |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
入力ファイルと参照ファイルのフォーマット
ResidueNumberToBeFitted ... If |, all residules are sellected till the residue in the next line