「pdbWaterAdd」の版間の差分
行187: | 行187: | ||
<br> | <br> | ||
− | ====m=1, height= | + | ====m=1, height=50, r=30で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
行196: | 行196: | ||
最大半径(座標)<br> </p> | 最大半径(座標)<br> </p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">9.900170e+00 2.835893e+01 1.610196e+01<br> |
− | + | 3.983113e+01<br> | |
− | + | 29.49 29.53 26.50<br> </p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | <br> | ||
====m=2で実行==== | ====m=2で実行==== |
2014年1月28日 (火) 03:28時点における版
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: [pdb] | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: [pdb] | NULL |
-d | 選択 | 水の密度: [M] | 55.55555 |
-r | 選択 | 水の半径(m=0, 1で使用) | 100 |
-height | 選択 | 水の高さ(m=1で使用) | 100 |
-cube | 選択 | (X, Y, Z): [A](m=3で使用) | (100, 100, 100) |
-edge | 選択 | layer number(m=2で使用) | 3 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 球 |
1 | 円筒 |
2 | エッジ |
3 | 立方体 |
実行例
入力ファイルの画像
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
オプション必須項目のみの場合
重心 最大半径 |
9.330483e+00 2.794594e+01 1.553714e+01 1.010862e+02 |
オプション -r
r=30で実行
重心 最大半径 |
1.013427e+01 2.852403e+01 1.641233e+01 3.179522e+01 |
オプション -d
d=100, r=30で実行
重心 最大半径 |
1.088372e+01 2.846397e+01 1.583489e+01 3.126308e+01 |
オプション -m
m=1で実行
|
重心 最大半径 |
9.336175e+00 2.794978e+01 1.554270e+01 1.124455e+02 |
m=1, height=50, r=30で実行
重心 最大半径 |
9.900170e+00 2.835893e+01 1.610196e+01 3.983113e+01 |
m=2で実行
重心 最大半径 |
2.351263e+01 3.752831e+01 4.991955e+01 5.244210e+01 |
m=2, edge=11で実行
重心 最大半径 |
2.275528e+01 3.777079e+01 5.054808e+01 8.021160e+01 |
m=3で実行
重心 最大半径 |
2.657380e+01 3.896318e+01 4.788873e+01 8.453592e+01 |
m=3, cube=(150, 50, 25)で実行
重心 最大半径 |
2.680180e+01 3.562480e+01 4.810106e+01 7.877402e+01 |