mrcImageAutoRotationAverage
提供: Eospedia
mrcImageAutoRotationAverageとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | stdin |
| -o | 必須 | 出力ファイル: 平均画像: mrcImage | NULL |
| -r | 選択 | 参照ファイル: mrcImage | NULL |
| -range | 選択 | (Min, Max, Delta, Iter) | (0.0, 360.0, 5.0, 2) |
| -iter | 選択 | iteration for rotation | 2 |
| -M | 選択 | Mode: Correlation | 16 |
| -Method | 選択 | Method: Correlation | 0 |
| -Periodic | 選択 | Periodic | |
| -maxIter | 選択 | MaxIteration | 10 |
| -rmsd | 選択 | rmsd | 1e-2 |
| -log | 選択 | logFile | stdout |
| -thres | 選択 | threshold: Linear Correlation | 0.2 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-Mの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Normal Correlation FxG* |
| 1 | Phase Correlation FxG*/ |FxG*| |
| 2 | Phase Correlation FxG*/sqrt(|FxG*|) |
| 3 | Normalized Normal Correlation FxG*/|F||G|) |
-mの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | sqrt(Sum |Fi-Gi|^2 / Sum |Gi|^2) |
| 1 | Sum |Gi||phaseFi - phaseGi| / Sum |Gi| |
| 2 | sqrt(Sum |Gi||phaseFi - phaseGi|^2 / Sum |Gi| ) |
