pdbCAOnly

pdbCAOnlyとはPDBからα炭素だけを抜き出すEosのコマンドである。

オプション一覧

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: PDB	NULL
-o	選択	出力ファイル: PDB	NULL
-oCoord	選択	出力ファイル: 座標(x, y, z): ASCII	NULL
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの詳細

実行結果

-o の画像

-oCoord のデータ

  -5.913,   31.928,   -6.676
  -4.759,   28.930,   -4.751
  -4.531,   29.674,   -1.062
  -2.465,   27.513,    1.336
  -3.586,   27.580,    4.978
  -0.458,   26.983,    7.005
  -0.267,   26.691,   10.787
   2.893,   27.179,   12.917
   2.792,   25.223,   16.192
   5.273,   24.275,   18.922

-中略-

   8.007,   26.321,    0.697
   8.752,   22.660,    1.449
   5.506,   22.633,    3.471
   3.622,   24.164,    0.512
   5.079,   21.428,   -1.780
   3.951,   18.742,    0.732
   0.404,   20.135,    0.490
   0.711,   20.050,   -3.346
   1.520,   16.308,   -3.145
  -1.217,   15.280,   -0.638