「画像フォーマット変換」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
(EosにおけるMRCファイルフォーマット)
(EosにおけるMRCファイルフォーマット)
行30: 行30:
  
 
[[Eos]]の場合には、下記の点に注意しましょう。
 
[[Eos]]の場合には、下記の点に注意しましょう。
 +
 
1.Lengthの取り扱いが、通常、Voxel辺りのサンプリング間隔になっています。他のフォーマットと異なっていますので、ご注意下さい。
 
1.Lengthの取り扱いが、通常、Voxel辺りのサンプリング間隔になっています。他のフォーマットと異なっていますので、ご注意下さい。
  

2012年9月9日 (日) 23:57時点における版

電子顕微鏡で撮影したデータは、それぞれ異なります。Eosの中では、MRC型のフォーマットを採用して変換するために、MRC型のフォーマットに変換する必要があります。


Eosにおけるファイル変換

  • TIFからMRCの変換(グレースケール):tiff2mrc
  • MRCからTIFへの変換(グレースケール):mrc2tiff

EosにおけるMRCファイルフォーマット

注意:同じMRC型のフォーマットでも、少しずつ違います。注意しましょう。

  • Willy Wriggers:Situs, CCP4 and MRC 3D Density Map File Formats and Format Conventionsレポート

Eosの場合には、下記の点に注意しましょう。

1.Lengthの取り扱いが、通常、Voxel辺りのサンプリング間隔になっています。他のフォーマットと異なっていますので、ご注意下さい。

2.CCP4−2000(MRC2000)に少しずつ対応させています。現在、読み取り側には対応しています。書き出し側は完全には対応できていません。

3.コマンドによっては、一部の内容がきちんとなっていない場合があります。振る舞いがおかしいときは、mrcInfoで確認した後、mrcInfoSetで設定して下さい。