mrcImageShapePCA

mrcImageShapePCAとはmrcImageファイルの３次元画像の外形の向きを決めるためのEosのコマンドである。

アルゴリズム

　主成分分析を用いて、３次元物体の外形を決定することが出来ます。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	選択	出力ファイル: ASCII	stdout(設定しなければ標準出力）
-C	選択	可変入力: C1 C2... Ci: それぞれの場所にi個の点を置く	0.0 ...
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 5 (35, 42, 36) 0.00451895 0.0913615 0.000155997

オプション　-C

C=0で実行

# PCA ResultsConvariace Matrix: 2 3 3 
   14505.161133      198.588654     2422.490479 
     198.588654    14068.363281     -839.463379 
    2422.490479     -839.463379    13960.040039 
UnitVector: one unit vector per line, from 1st 2 3 3 
       0.719602       -0.159090        0.675917 
       0.313963        0.942763       -0.112358 
      -0.619354        0.293066        0.728363 
Lambda: 1st 2nd 3rd1 3 
   16736.683594    14234.544922    11562.336914 
Average: 1 3 
      37.617535       45.253372       38.918110 

C=(0, 1, 2, 3, 4)で実行

# PCA ResultsConvariace Matrix: 2 3 3 
   20669.468750      417.175446     3364.196045 
     417.175446    20182.199219    -1254.394897 
    3364.196045    -1254.394897    20143.558594 
UnitVector: one unit vector per line, from 1st 2 3 3 
       0.706418       -0.155129        0.690586 
       0.333752        0.933412       -0.131727 
      -0.624166        0.323539        0.711153 
Lambda: 1st 2nd 3rd1 3 
   23866.658203    20508.390625    16620.177734 
Average: 1 3 
      37.495483       45.239353       38.885162