pdbProteinIDSet

pdbProteinIDSetとはPDBファイルの識別コードを変更するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: PDB	NULL
-o	必須	出力ファイル: PDB	NULL
-ID	必須	Chain ID	A
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

重心 最大半径 最大半径(座標)

6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 24.77 23.85 28.04

エディタで見た場合

-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00 14.06           N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00 17.27           C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00 16.41           C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00 16.12           O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00 17.94           C  
ATOM      6  CG  MET A   1      -4.594  33.420  -4.990  1.00 19.41           C  
ATOM      7  SD  MET A   1      -3.193  34.558  -4.899  1.00 21.82           S  
ATOM      8  CE  MET A   1      -4.325  35.886  -4.618  1.00 23.68           C  
ATOM      9  N   THR A   2      -4.966  29.934  -5.760  1.00 15.08           N  
ATOM     10  CA  THR A   2      -4.759  28.930  -4.751  1.00 16.71           C  

-後略-

オプション必須項目のみの場合

ID=Bで実行

エディタで見た場合

-前略-

ATOM      1  N   MET B   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00 14.06   0       N  
ATOM      2  CA  MET B   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00 17.27   0       C  
ATOM      3  C   MET B   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00 16.41   0       C  
ATOM      4  O   MET B   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00 16.12   0       O  
ATOM      5  CB  MET B   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00 17.94   0       C  
ATOM      6  CG  MET B   1      -4.594  33.420  -4.990  1.00 19.41   0       C  
ATOM      7  SD  MET B   1      -3.193  34.558  -4.899  1.00 21.82   0       S  
ATOM      8  CE  MET B   1      -4.325  35.886  -4.618  1.00 23.68   0       C  
ATOM      9  N   THR B   2      -4.966  29.934  -5.760  1.00 15.08   0       N  
ATOM     10  CA  THR B   2      -4.759  28.930  -4.751  1.00 16.71   0       C  

-後略-