pdbProteinIDSet

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pdbProteinIDSetとはPDBファイルの識別コードを変更するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: PDB NULL
-o 必須 出力ファイル: PDB NULL
-ID 必須 Chain ID A
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P-PDB.png

重心

最大半径

最大半径(座標)

6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01

3.286664e+01

24.77 23.85 28.04


エディタで見た場合
-前略-

ATOM      1  N   MET A   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00 14.06           N  
ATOM      2  CA  MET A   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00 17.27           C  
ATOM      3  C   MET A   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00 16.41           C  
ATOM      4  O   MET A   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00 16.12           O  
ATOM      5  CB  MET A   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00 17.94           C  
ATOM      6  CG  MET A   1      -4.594  33.420  -4.990  1.00 19.41           C  
ATOM      7  SD  MET A   1      -3.193  34.558  -4.899  1.00 21.82           S  
ATOM      8  CE  MET A   1      -4.325  35.886  -4.618  1.00 23.68           C  
ATOM      9  N   THR A   2      -4.966  29.934  -5.760  1.00 15.08           N  
ATOM     10  CA  THR A   2      -4.759  28.930  -4.751  1.00 16.71           C  

-後略-

オプション必須項目のみの場合

ID=Bで実行

エディタで見た場合
-前略-

ATOM      1  N   MET B   1      -7.176  32.630  -6.655  1.00 14.06   0       N  
ATOM      2  CA  MET B   1      -5.913  31.928  -6.676  1.00 17.27   0       C  
ATOM      3  C   MET B   1      -5.903  30.860  -5.600  1.00 16.41   0       C  
ATOM      4  O   MET B   1      -6.703  30.881  -4.654  1.00 16.12   0       O  
ATOM      5  CB  MET B   1      -4.712  32.869  -6.415  1.00 17.94   0       C  
ATOM      6  CG  MET B   1      -4.594  33.420  -4.990  1.00 19.41   0       C  
ATOM      7  SD  MET B   1      -3.193  34.558  -4.899  1.00 21.82   0       S  
ATOM      8  CE  MET B   1      -4.325  35.886  -4.618  1.00 23.68   0       C  
ATOM      9  N   THR B   2      -4.966  29.934  -5.760  1.00 15.08   0       N  
ATOM     10  CA  THR B   2      -4.759  28.930  -4.751  1.00 16.71   0       C  

-後略-