「mrcImageGaussSphere」の版間の差分

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'''mrcImageGaussSphere'''。
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'''mrcImageGaussSphere'''とはガウス球の作成を行う[[Eos]]の[[コマンド]]である。。
  
 
==オプション一覧==
 
==オプション一覧==
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<td>-o</td>
 
<td>-o</td>
 
<td>必須</td>
 
<td>必須</td>
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<td>出力ファイル設定</td>
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td>
 
<td>NULL</td>
 
<td>NULL</td>
 
</tr>
 
</tr>
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<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行126: 行126:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行146: 行146:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行161: 行161:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行182: 行182:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行199: 行199:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-sigma_range2-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-sigma_range2-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行219: 行219:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行237: 行237:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行258: 行258:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行273: 行273:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行294: 行294:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行309: 行309:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行331: 行331:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行346: 行346:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行365: 行365:
 
<table>
 
<table>
 
<tr>
 
<tr>
−
<td>[[画像:outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>
行380: 行380:
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
<td>ｚ軸の中央部分の切断面を表示<br>
 
　　－－－－－－＞</td>
 
　　－－－－－－＞</td>
−
<td>[[画像:outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
+
<td>[[画像:Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png]]</td>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
<td><p align="left">最小<br>
 
最大<br>
 
最大<br>

2014年7月25日 (金) 00:16時点における最新版

mrcImageGaussSphereとはガウス球の作成を行うEosのコマンドである。。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage NULL
-sigmax 選択 物体のｘ軸の幅を設定 10
-sigmay 選択 物体のｙ軸の幅を設定 20
-sigmaz 選択 物体のz軸の幅を設定 30
-sigma_range 選択 画像データの大きさを設定 3
-weight 選択 物体の高さを設定 10
-size 選択 ピクセルのサイズを設定 5
-W 選択 画像データの幅（ｘ軸）を設定 0
-H 選択 画像データの高さ（ｙ軸）を設定 0
-S 選択 画像データの奥行き（ｚ軸）を設定 0
-m 選択 モード 2
-h 選択 ヘルプを表示 　
ファイルサイズ＝(sigma_range*sigmax*2) x (sigma_range*sigmay*2) x (sigma_range*sigmaz*2)

モードの詳細

モード 説明
0 char（１バイト）
2 float（４バイト）


実行例

------必須項目のオプションのみの場合------

Outdata-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.222265
0.858162

0.00782576

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.773306
1.80792

0.100285

------オプション　-sigmax,-sigmay,-sigmaz------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行

Outdata-xyz50-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.24531
0.898424

0.00188576

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdataoutdata-xyz50-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.84426
1.87314

0.0307072

------オプション　-sigma_range------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-sigma_range=3（デフォルト）の場合
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05
-sigma_range=2の場合
Outdata-xy50z1-sigma range2-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.00335463

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05

------オプション　-weight------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-weight=10（デフォルト）の場合
Outdata-xy50z1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.94008e-10

0.0193046
0.00162981
0.00361602

4.19165e-05
-weight=30の場合
Outdata-xy50z1-weight30-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

8.82023e-10

0.0579137
0.00488942
0.010848

0.00012575

------オプション　-size------

-sigmaz=1で実行

-size=1で実行
Outdata-z1-size1-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.87953e-11

10
0.215562
0.852389

0.00375

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-z1-size1-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.523e-07

10
0.851235
1.87929

0.0218744

------オプション　-W,-H------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=1で実行

-W=500,-H=500,-S=500に設定する
Outdata-xy50z1-WHS500-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

0.0192083
1.21294e-05
0.000341949

3.41949e-07

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xy50z1-WHS500-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.00707e-23

0.0192083
0.00060647
0.00234222

2.34222e-05
※ピクセルサイズがデフォルト（５）となっているので、ｘ軸およびｙ軸の幅は100となる

------オプション　-m------

-sigmax=50,-sigmay=50,-sigmaz=50で実行

モード：０
Outdata-xyz50-WHS500m0-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

9
0.0378
0.38963

0.00038963

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xyz50-WHS500m0-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

9
0.2476
1.10666

0.0110666
モード：２
Outdata-xyz50-WHS500m2-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.19151e-31

9.92528
0.0556833
0.440193

0.000440193

 ｚ軸の中央部分の切断面を表示
　　－－－－－－＞		 Outdata-xyz50-WHS500m2-SectionGet-mrcImageGaussSphere.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

5.20371e-21

9.92528
0.313375
1.21027

0.0121027

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