「mrcImageInverseRadonTransform」の版間の差分

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(同じ利用者による、間の4版が非表示)
行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>入力ファイル設定</td>  
+
<td>入力ファイル設定: [[mrcImage]](Radon)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>出力ファイル設定</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行65: 行65:
 
<td>　</td>  
 
<td>　</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
−
</table>  
+
</table>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
行99: 行99:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>4</td>  
 
<td>4</td>  
−
<td>CountRWeightedBackProjection         (-Rmax, -Rmin)</td>  
+
<td>NearestCountRWeightedBackProjection         (-Rmax, -Rmin)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行150: 行150:
 
</td>
 
</td>
 
</tr>
 
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-121P.mrc | ラドン変換前]]のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input2-121P.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 236)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input3-121P.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 236)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3500.79 (49, 53, 30)<br>
 +
11.0585<br>
 +
118.123<br>
 +
0.118123<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 
</table>
 
</table>
 
<br>
 
<br>
行261: 行314:
  
 
====bpm=3で実行====  
 
====bpm=3で実行====  
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行313: 行367:
 
<br>
 
<br>
  
−
====bpm=3, Rmin=0.01, Rmax=0.05で実行====  
+
=====Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-bpm3RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 17078)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-bpm3RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 17078)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-bpm3Rmin0.01Rmax0.05-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行323: 行410:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-52149.4 (7, 0, 5)<br>  
+
<td><p align="left">-35554.3 (41, 46, 60)<br>  
−
59946.8 (10, 15, 7)<br>  
+
42895.3 (43, 63, 56)<br>  
−
7185.35<br>  
+
71.5918<br>  
−
29715.4<br>  
+
6441.25<br>  
−
332.229<br></p>  
+
6.44125<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行334: 行421:
  
 
====bpm=4で実行====  
 
====bpm=4で実行====  
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行386: 行474:
 
<br>
 
<br>
  
−
====bpm=4, Rmin=0.001, Rmax=0.005で実行====  
+
=====Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-bpm4RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 5543168)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-bpm4RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 5543168)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-bpm4RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行396: 行517:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-8069.65 (13, 7, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-4.30597e+06 (44, 51, 0)<br>  
−
9323.26 (11, 0, 0)<br>  
+
7.79371e+06 (52, 47, 52)<br>  
−
129.04<br>  
+
98305.6<br>  
−
1807.14<br>  
+
1.27414e+06<br>  
−
20.2045<br></p>  
+
1274.14<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
 +
<br>
  
 
====bpm=5で実行====  
 
====bpm=5で実行====  
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行458: 行581:
 
<br>
 
<br>
  
−
====bpm=5, Rmin=0, Rmax=0.007, T=0で実行====  
+
=====Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行=====  
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-bpm5RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 4345185)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-bpm5RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 4345185)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-bpm5Rmin0Rmax0.007T0-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行468: 行624:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">765386 (3, 0, 7)<br>  
+
<td><p align="left">-2.40589e+06 (44, 51, 0)<br>  
−
1.86515e+06 (10, 10, 10)<br>  
+
6.43175e+06 (51, 47, 52)<br>  
−
1.19327e+06<br>  
+
119547<br>  
−
280104<br>  
+
871588<br>  
−
3131.66<br></p>  
+
871.588<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
 +
<br>
 +
 +
=====T=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-bpm5T-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 2.57e+07)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-bpm5T-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 2.57e+07)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">2.70513e+06 (99, 0, 18)<br>
 +
3.08546e+07 (46, 53, 54)<br>
 +
9.04412e+06<br>
 +
4.59295e+06<br>
 +
4592.95<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
  
 
====bpm=6で実行====  
 
====bpm=6で実行====  
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行530: 行741:
 
<br>
 
<br>
  
−
====bpm=6, Rmin=0.01, Rmax=0.05で実行====  
+
=====Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行=====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-bpm6RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 253658)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
0<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-bpm6RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 +
<td><p align="left">使用ツール<br>
 +
スタイル<br>
 +
ボクセルサイズ<br>
 +
回転軸<br>
 +
角度<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">Chimera<br>
 +
surface(Level: 253658)<br>
 +
(1, 1, 1)<br>
 +
(1, 0, 0)<br>
 +
90<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-bpm6Rmin0.01Rmax0.05-mrcImageInverseRadonTransform.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行540: 行784:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">-5227.94 (6, 0, 5)<br>  
+
<td><p align="left">-195434 (41, 45, 1)<br>  
−
6459.5 (10, 11, 10)<br>  
+
477868 (53, 48, 52)<br>  
−
-5.13069e-07<br>  
+
4.01732e-05<br>  
−
3160.58<br>  
+
66425<br>  
−
35.3363<br></p>  
+
66.425<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2014年7月25日 (金) 03:46時点における最新版

mrcImageInverseRadonTransformとは逆ラドン変換を行うEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage(Radon) NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage NULL
-Rmax 選択 Input: Rmax 1.0
-Rmin 選択 Input: Rmin 1.0
-bpm 選択 逆投影モード 1
-T 選択 Threshold 1
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0

逆投影モードの詳細

モード 説明
1 SimpleBackProjection
2 WeightedBackProjection
3 RWeightedBackProjectioni (-Rmax, -Rmin)
4 NearestCountRWeightedBackProjection (-Rmax, -Rmin)
5 WeightedCountRWeightedBackProjection (-Rmax, -Rmin, -T)
6 SimpleBackProjectionRWeight (-Rmax, -Rmin)


実行例

入力ファイルのデータ

Input-121P-radon.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

solid(Level: 0)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

サイズ

モード
最小
最大
平均値
標準偏差

標準誤差

( 100, 6, 12)

mrcFloatRadonImage
0 (0, 0, 0)
548332 (43, 5, 5)
110585
157847

1860.25


Input2-121P.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 236)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Input3-121P.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 236)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (49, 53, 30)
11.0585
118.123

0.118123


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 2.57e+07)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 2.57e+07)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.70513e+06 (99, 0, 18)

3.08546e+07 (46, 53, 54)
9.04412e+06
4.59295e+06

4592.95


オプション　-bpm

bpm=2で実行

Outdata-bpm2-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 147432)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm2-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 147432)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

548332 (43, 5, 5)
110585
157847

1860.25


bpm=3で実行

その他のオプション設定なし
Outdata-bpm3-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 11225)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm3-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 11225)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-25501.4 (58, 57, 50)

25807.4 (33, 56, 47)
18.921
4069.39

4.06939


Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行
Outdata-bpm3RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 17078)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm3RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 17078)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-35554.3 (41, 46, 60)

42895.3 (43, 63, 56)
71.5918
6441.25

6.44125


bpm=4で実行

その他のオプション設定なし
Outdata-bpm4-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 39203)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm4-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 39203)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.38318e+06 (44, 51, 0)

7.95502e+06 (53, 48, 52)
98305.6
1.27742e+06

1277.42


Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行
Outdata-bpm4RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

スタイル
ボクセルサイズ
回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 5543168)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm4RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

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回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 5543168)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.30597e+06 (44, 51, 0)

7.79371e+06 (52, 47, 52)
98305.6
1.27414e+06

1274.14


bpm=5で実行

その他のオプション設定なし
Outdata-bpm5-mrcImageInverseRadonTransform.png

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Chimera

surface(Level: 4347459)
(1, 1, 1)
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0
Outdata1-bpm5-mrcImageInverseRadonTransform.png

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角度

Chimera

surface(Level: 4347459)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.47747e+06 (44, 51, 0)

6.61758e+06 (50, 56, 55)
119547
875859

875.859


Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行
Outdata-bpm5RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

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Chimera

surface(Level: 4345185)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm5RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

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角度

Chimera

surface(Level: 4345185)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.40589e+06 (44, 51, 0)

6.43175e+06 (51, 47, 52)
119547
871588

871.588


T=0.5で実行
Outdata-bpm5T-mrcImageInverseRadonTransform.png

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Chimera

surface(Level: 2.57e+07)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm5T-mrcImageInverseRadonTransform.png

使用ツール

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角度

Chimera

surface(Level: 2.57e+07)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

2.70513e+06 (99, 0, 18)

3.08546e+07 (46, 53, 54)
9.04412e+06
4.59295e+06

4592.95


bpm=6で実行

その他のオプション設定なし
Outdata-bpm6-mrcImageInverseRadonTransform.png

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角度

Chimera

surface(Level: 279548)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm6-mrcImageInverseRadonTransform.png

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角度

Chimera

surface(Level: 279548)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-358661 (39, 64, 0)

596169 (53, 48, 52)
4.82695e-06
80685.1

80.6851


Rmin=0.1, Rmax=0.5で実行
Outdata-bpm6RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

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角度

Chimera

surface(Level: 253658)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

0
Outdata1-bpm6RminRmax-mrcImageInverseRadonTransform.png

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回転軸

角度

Chimera

surface(Level: 253658)
(1, 1, 1)
(1, 0, 0)

90

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-195434 (41, 45, 1)

477868 (53, 48, 52)
4.01732e-05
66425

66.425

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