「mrcImageNormalizing」の版間の差分
提供: Eospedia
(→オプション一覧) |
|||
| 行72: | 行72: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行103: | 行104: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>4</td> | <td>4</td> | ||
| − | <td> | + | <td>直接演算する<br> |
data = A*data + B </td> | data = A*data + B </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | </table> | + | <tr> |
| − | + | <td>5</td> | |
| + | <td>ガウシアンとして密度を仮定する<br> | ||
| + | data = A*Normalized(data) + B<br> | ||
| + | Normalized(data): 平均値: 0, 標準偏差: 1としたもの</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
2014年10月3日 (金) 04:35時点における版
mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -A | 選択 | A | 1.0 |
| -B | 選択 | B | 0.0 |
| -ContourMin | 選択 | 輪郭の最小値 | 0.0 |
| -ContourMax | 選択 | 輪郭の最大値 | 1.0 |
| -ContourSolvent | 選択 | 溶媒の輪郭 | 0.0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Double Exponential: Solvent and Object Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object |
| 1 | Min-Max: Background and Object data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B |
| 2 | Contour data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B |
| 3 | Contour and Solvent if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below. |
| 4 | 直接演算する data = A*data + B |
| 5 | ガウシアンとして密度を仮定する data = A*Normalized(data) + B |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
オプション必須項目のみの場合
 |
最小 最大 |
-0.00221962 (10, 1, 0) 0.00448009 (24, 39, 0) |
オプション -A, -B
A=1000, B=3で実行
 |
最小 最大 |
0.780381 (10, 1, 0) 7.48009 (24, 39, 0) |
