「mrcImageNormalizing」の版間の差分
(→実行例) |
(→A=2, B=3 のとき) |
||
| (同じ利用者による、間の4版が非表示) | |||
| 行196: | 行196: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| − | + | 平均値が0、標準偏差が1になるように正規化されている。 | |
| + | |||
| + | ===== A=3, B=2 のとき ===== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata1-m5-mrcImageNormalizing.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-5.70789 (10, 1, 0)<br> | ||
| + | 15.6263 (24, 39, 0)<br> | ||
| + | 2<br> | ||
| + | 3<br> | ||
| + | 0.0375<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | 平均値が2、標準偏差が3になるように正規化されている。 | ||
2014年10月3日 (金) 04:55時点における最新版
mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -A | 選択 | A | 1.0 |
| -B | 選択 | B | 0.0 |
| -ContourMin | 選択 | 輪郭の最小値 | 0.0 |
| -ContourMax | 選択 | 輪郭の最大値 | 1.0 |
| -ContourSolvent | 選択 | 溶媒の輪郭 | 0.0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Double Exponential: Solvent and Object Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object |
| 1 | Min-Max: Background and Object data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B |
| 2 | Contour data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B |
| 3 | Contour and Solvent if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below. |
| 4 | 直接演算する data = A*data + B |
| 5 | ガウシアンとして密度を仮定する data = A*Normalized(data) + B |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
オプション必須項目のみの場合
 |
最小 最大 |
-0.00221962 (10, 1, 0) 0.00448009 (24, 39, 0) |
オプション -A, -B
A=1000, B=3で実行
 |
最小 最大 |
0.780381 (10, 1, 0) 7.48009 (24, 39, 0) |
オプション -m
m=5で実行
A=1, B=0 のとき
 |
最小 最大 |
-2.5693 (10, 1, 0) 4.5421 (24, 39, 0) |
平均値が0、標準偏差が1になるように正規化されている。
A=3, B=2 のとき
 |
最小 最大 |
-5.70789 (10, 1, 0) 15.6263 (24, 39, 0) |
平均値が2、標準偏差が3になるように正規化されている。
