「mrcImageFourierNeighborCorrelation」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
 
(同じ利用者による、間の61版が非表示)
行1: 行1:
−
'''mrcImageFourierNeighborCorrelation'''は、[[フーリエ空間]]の冗長性を利用した分解能をチェックする為の[[Eos]]のコマンドです。
+
'''mrcImageFourierNeighborCorrelation'''は、[[フーリエ空間]]の冗長性を利用した分解能をチェックする為の[[Eos]]の[[コマンド]]です。
  
  
行46: 行46:
 
<td>予測した[[FSC]]の出力フラグ</td>  
 
<td>予測した[[FSC]]の出力フラグ</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-Cref</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>Crefの出力フラグ</td>
 +
<td></td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-FSCfull</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>[[FSC]] fullの出力フラグ</td>
 +
<td></td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-NoiseWeighted</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>NoiseWeighted: Cref*exp(-Brestore/(4*d^2)</td>
 +
<td>-100.0</td>
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行78: 行96:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
 +
 +
=== -maskの詳細 ===
 +
-i のファイルと同じ形状の二値化ファイルを使用します。<br>
 +
<br>
 +
(作成例)<br>
 +
-i のファイルを元に[[mrcImageLowPassFilter]]にて低周波成分を得て、<br>
 +
[[mrcImageBinalization]](m=32)にて二値化する。<br>
 +
<br>
 +
 +
=== -maskBackの詳細 ===
 +
-i のファイルと同じサイズで全てのデータが1のファイルを使用します。<br>
 +
但し、-i のファイルがWindowingされている場合は同じ窓関数を掛けるようにします。<br>
 +
<br>
 +
(作成例)<br>
 +
-iの入力ファイルを[[mrcInfo]]にてサイズを調べ、<br>
 +
[[mrcImageNullImageCreate]](v=1)にて全てのファイルが1の画像を作成し、<br>
 +
[[mrcImageWindowing]]にて同じ窓関数を掛ける。<br>
 
<br>
 
<br>
  
行118: 行154:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[Media:Input-1VOM-N.mrc|入力ファイル]]の画像で実行===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-1VOM-N.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2390.42 (77, 14, 69)<br>
 +
4374.62 (17, 62, 46)<br>
 +
72.1487<br>
 +
577.82<br>
 +
0.722275<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<pre>
 +
  0.000000  0.863711          1
 +
  0.012500  0.553876        18
 +
  0.025000  0.170684        64
 +
  0.037500  0.221808        146
 +
  0.050000  0.230874        266
 +
  0.062500  0.280359        382
 +
  0.075000  0.269777        588
 +
  0.087500  0.280955        746
 +
  0.100000  0.322332      1002
 +
  0.112500  0.249747      1294
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.750000  -0.005313      2256
 +
  0.762500  0.036957      1688
 +
  0.775000  0.021723      1264
 +
  0.787500  0.010364        864
 +
  0.800000  -0.026498        568
 +
  0.812500  -0.009259        312
 +
  0.825000  -0.009356        144
 +
  0.837500  0.030291        72
 +
  0.850000  -0.109028          8
 +
  0.862500  0.000000          0
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
[[画像:Outdata-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
この画像は冗長性がほとんどないためにFNCがすぐに下がってしまっている。<br>
 +
<br>
 +
 +
=== 入力ファイル(パディング) ===
 +
上記のファイルを0でパディングして、冗長性を持たせます。<br>
 +
このファイルは[[チュートリアル一覧#mrcImage]]にて作成できます。<br>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N-P.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-1VOM-N-P.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2390.42 (165, 102, 147)<br>
 +
4374.62 (105, 150, 124)<br>
 +
2.75226<br>
 +
113.698<br>
 +
0.0277584<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
実行結果<br>
 +
<pre>
 +
  0.000000  0.991796          1
 +
  0.003906  0.982392        18
 +
  0.007812  0.963411        62
 +
  0.011719  0.934883        98
 +
  0.015625  0.902410        210
 +
  0.019531  0.864067        350
 +
  0.023438  0.841587        450
 +
  0.027344  0.856990        602
 +
  0.031250  0.887424        762
 +
  0.035156  0.887318      1142
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.828125  0.811470      1320
 +
  0.832031  0.812934      1352
 +
  0.835938  0.823354      1152
 +
  0.839844  0.817772        800
 +
  0.843750  0.824257        288
 +
  0.847656  0.821916        392
 +
  0.851562  0.765112        200
 +
  0.855469  0.812369        72
 +
  0.859375  0.777638          8
 +
  0.863281  0.000000          0
 +
</pre>
 +
<br>
 +
[[画像:Outdata1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
冗長性を持つ画像の場合、FNCが高周波成分でも高い値になる。<br>
 +
<br>
 +
 +
==== オプション -d ====
 +
=====d=0.025で実行=====
 +
<pre>
 +
  0.000000  0.961060        147
 +
  0.025000  0.884961      3596
 +
  0.050000  0.876699      13334
 +
  0.075000  0.884583      30012
 +
  0.100000  0.888691      53048
 +
  0.125000  0.873868      82634
 +
  0.150000  0.860938    118688
 +
  0.175000  0.862499    161322
 +
  0.200000  0.875542    211496
 +
  0.225000  0.882194    266468
 +
  0.250000  0.874374    330126
 +
  0.275000  0.868385    398912
 +
  0.300000  0.861123    473858
 +
  0.325000  0.852294    557496
 +
  0.350000  0.846181    647132
 +
  0.375000  0.842054    739454
 +
  0.400000  0.836904    845340
 +
  0.425000  0.836800    950870
 +
  0.450000  0.834607    1068284
 +
  0.475000  0.831828    1190048
 +
  0.500000  0.829300    1284690
 +
  0.525000  0.827369    1227836
 +
  0.550000  0.824926    1141760
 +
  0.575000  0.824884    1043124
 +
  0.600000  0.823838    930008
 +
  0.625000  0.822523    803708
 +
  0.650000  0.821119    663864
 +
  0.675000  0.820229    512012
 +
  0.700000  0.819524    348596
 +
  0.725000  0.818723    217808
 +
  0.750000  0.820472    135048
 +
  0.775000  0.825089      77288
 +
  0.800000  0.815167      38120
 +
  0.825000  0.816419      13488
 +
  0.850000  0.814605      1760
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
[[画像:Outdata-d-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
<br>
 +
 +
==== -FSCと-mask, -maskBack ファイルを指定して実行 ====
 +
-maskのファイル: このファイルは[[チュートリアル一覧#mrcImage]]にて作成できます。<br>
 +
<br>
 +
Makefile内の設定<br>
 +
<pre>
 +
MASK_VALUE=0.0125
 +
</pre>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-Noise1-P.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-Noise1-P.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
1 (111, 135, 84)<br>
 +
0.0158784<br>
 +
0.125005<br>
 +
3.05189e-05<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
-maskBackのファイル: このファイルは[[チュートリアル一覧#mrcImage]]にて作成できます。<br>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-Null1-P.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-Null1-P.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">1 (0, 0, 0)<br>
 +
1 (88, 88, 78)<br>
 +
0.038147<br>
 +
0.191551<br>
 +
4.67654e-05<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
出力結果<br>
 +
<pre>
 +
FNCF 0.894073 FNCN 0.820233
 +
  0.000000  0.991796          1 FSC  -7.183377 SNR -1.755602e+00 FNCF  0.951711 FNCN  -0.366379
 +
  0.003906  0.982392        18 FSC -11.199417 SNR -1.836058e+00 FNCF  0.903913 FNCN  0.595703
 +
  0.007812  0.963411        62 FSC  31.808857 SNR -2.064916e+00 FNCF  0.844130 FNCN  0.798653
 +
  0.011719  0.934883        98 FSC  3.471075 SNR -2.809364e+00 FNCF  0.845211 FNCN  0.799688
 +
  0.015625  0.902410        210 FSC  1.254576 SNR -9.856209e+00 FNCF  0.886035 FNCN  0.734901
 +
  0.019531  0.864067        350 FSC  0.422099 SNR  1.460802e+00 FNCF  0.893608 FNCN  0.787841
 +
  0.023438  0.841587        450 FSC  0.169033 SNR  4.068355e-01 FNCF  0.889512 FNCN  0.827210
 +
  0.027344  0.856990        602 FSC  0.331378 SNR  9.912261e-01 FNCF  0.873868 FNCN  0.811905
 +
  0.031250  0.887424        762 FSC  0.834791 SNR  1.010589e+01 FNCF  0.889606 FNCN  0.818398
 +
  0.035156  0.887318      1142 FSC  0.832380 SNR  9.931723e+00 FNCF  0.897804 FNCN  0.824152
 +
  0.039062  0.879608      1250 FSC  0.672387 SNR  4.104771e+00 FNCF  0.894009 FNCN  0.803585
 +
  0.042969  0.874892      1458 FSC  0.587592 SNR  2.849572e+00 FNCF  0.887004 FNCN  0.803368
 +
  0.046875  0.874435      1814 FSC  0.579834 SNR  2.760026e+00 FNCF  0.884325 FNCN  0.816900
 +
  0.050781  0.877405      2178 FSC  0.631676 SNR  3.429994e+00 FNCF  0.896430 FNCN  0.821318
 +
  0.054688  0.875931      2498 FSC  0.605536 SNR  3.070172e+00 FNCF  0.908684 FNCN  0.828866
 +
  0.058594  0.876247      2622 FSC  0.611065 SNR  3.142250e+00 FNCF  0.910457 FNCN  0.831098
 +
  0.062500  0.884193      3338 FSC  0.763974 SNR  6.473637e+00 FNCF  0.898597 FNCN  0.823882
 +
  0.066406  0.890079      3722 FSC  0.897373 SNR  1.748804e+01 FNCF  0.888997 FNCN  0.820916
 +
  0.070312  0.888096      4170 FSC  0.850229 SNR  1.135368e+01 FNCF  0.896541 FNCN  0.822739
 +
  0.074219  0.881947      4358 FSC  0.717896 SNR  5.089588e+00 FNCF  0.897502 FNCN  0.819764
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.789062  0.821038      8592 FSC  0.005476 SNR  1.101324e-02 FNCF  0.888864 FNCN  0.821332
 +
  0.792969  0.813430      7208 FSC  -0.044041 SNR -8.436653e-02 FNCF  0.889662 FNCN  0.818472
 +
  0.796875  0.813393      6296 FSC  -0.044265 SNR -8.477789e-02 FNCF  0.890629 FNCN  0.815216
 +
  0.800781  0.812815      5544 FSC  -0.047832 SNR -9.129702e-02 FNCF  0.894048 FNCN  0.808839
 +
  0.804688  0.814086      5360 FSC  -0.039964 SNR -7.685736e-02 FNCF  0.892404 FNCN  0.813711
 +
  0.808594  0.814528      4344 FSC  -0.037196 SNR -7.172486e-02 FNCF  0.886577 FNCN  0.828553
 +
  0.812500  0.813960      3272 FSC  -0.040749 SNR -7.830638e-02 FNCF  0.887005 FNCN  0.826397
 +
  0.816406  0.816745      3096 FSC  -0.023074 SNR -4.510691e-02 FNCF  0.895393 FNCN  0.818955
 +
  0.820312  0.823611      2840 FSC  0.023408 SNR  4.793880e-02 FNCF  0.898811 FNCN  0.825501
 +
  0.824219  0.810629      2240 FSC  -0.061066 SNR -1.151032e-01 FNCF  0.895444 FNCN  0.827601
 +
  0.828125  0.811470      1320 FSC  -0.056018 SNR -1.060935e-01 FNCF  0.903966 FNCN  0.820170
 +
  0.832031  0.812934      1352 FSC  -0.047100 SNR -8.996210e-02 FNCF  0.908462 FNCN  0.826379
 +
  0.835938  0.823354      1152 FSC  0.021585 SNR  4.412220e-02 FNCF  0.887402 FNCN  0.824615
 +
  0.839844  0.817772        800 FSC  -0.016396 SNR -3.226391e-02 FNCF  0.869994 FNCN  0.815638
 +
  0.843750  0.824257        288 FSC  0.028007 SNR  5.762863e-02 FNCF  0.880944 FNCN  0.824954
 +
  0.847656  0.821916        392 FSC  0.011526 SNR  2.331998e-02 FNCF  0.899626 FNCN  0.837368
 +
  0.851562  0.765112        200 FSC  -0.271800 SNR -4.274263e-01 FNCF  0.925513 FNCN  0.800424
 +
  0.855469  0.812369        72 FSC  -0.050561 SNR -9.625498e-02 FNCF  0.902540 FNCN  0.779785
 +
  0.859375  0.777638          8 FSC  -0.223864 SNR -3.658316e-01 FNCF  0.774510 FNCN  0.868126
 +
  0.863281  0.000000          0 FSC  -0.847425 SNR -9.174121e-01 FNCF  0.000000 FNCN  0.000000
 +
</pre>
 +
FSC, SNR, FNCF, FNCNの結果が表示される。<br>
 +
<br>
 +
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSC<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
SNR<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCF<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCN<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
グラフでは最初と最後の10点を除いていて表示している。<br>
 +
<br>
 +
 +
以降は-mask, maskBackにて同様のファイルを使用する。<br>
 +
<br>
 +
 +
===== -FSCfull, -Cref, NoiseWeighted=-100で実行 =====
 +
出力結果<br>
 +
<pre>
 +
FNCF 0.893745 FNCN 0.820252
 +
  0.000000  0.991796          1 FSC  -6.985231 SNR -1.749538e+00 FNCF  0.704805 FNCN  0.391308 FSCfull  2.334156 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.003906  0.982392        18 FSC -10.699472 SNR -1.829052e+00 FNCF  0.821228 FNCN  0.684129 FSCfull  2.206197 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.007812  0.963411        62 FSC  37.413739 SNR -2.054924e+00 FNCF  0.884407 FNCN  0.773688 FSCfull  1.947935 Cref  1.395685 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.011719  0.934883        98 FSC  3.542894 SNR -2.786505e+00 FNCF  0.896445 FNCN  0.837667 FSCfull  1.559752 Cref  1.248900 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.015625  0.902410        210 FSC  1.267348 SNR -9.480880e+00 FNCF  0.879666 FNCN  0.865827 FSCfull  1.117912 Cref  1.057314 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.019531  0.864067        350 FSC  0.424680 SNR  1.476325e+00 FNCF  0.881884 FNCN  0.835433 FSCfull  0.596176 Cref  0.772124 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.023438  0.841587        450 FSC  0.169793 SNR  4.090381e-01 FNCF  0.901388 FNCN  0.806285 FSCfull  0.290296 Cref  0.538791 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.027344  0.856990        602 FSC  0.333237 SNR  9.995687e-01 FNCF  0.897467 FNCN  0.819184 FSCfull  0.499892 Cref  0.707031 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.031250  0.887424        762 FSC  0.841616 SNR  1.062755e+01 FNCF  0.888027 FNCN  0.826006 FSCfull  0.913997 Cref  0.956032 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.035156  0.887318      1142 FSC  0.839175 SNR  1.043589e+01 FNCF  0.885703 FNCN  0.827937 FSCfull  0.912556 Cref  0.955278 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.039062  0.879608      1250 FSC  0.677353 SNR  4.198725e+00 FNCF  0.886124 FNCN  0.821982 FSCfull  0.807645 Cref  0.898691 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.042969  0.874892      1458 FSC  0.591685 SNR  2.898177e+00 FNCF  0.893947 FNCN  0.826635 FSCfull  0.743470 Cref  0.862247 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.046875  0.874435      1814 FSC  0.583850 SNR  2.805960e+00 FNCF  0.893287 FNCN  0.825939 FSCfull  0.737254 Cref  0.858635 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.050781  0.877405      2178 FSC  0.636213 SNR  3.497730e+00 FNCF  0.891071 FNCN  0.829329 FSCfull  0.777666 Cref  0.881854 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.054688  0.875931      2498 FSC  0.609808 SNR  3.125677e+00 FNCF  0.882848 FNCN  0.823179 FSCfull  0.757616 Cref  0.870411 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.058594  0.876247      2622 FSC  0.615393 SNR  3.200107e+00 FNCF  0.884282 FNCN  0.810449 FSCfull  0.761911 Cref  0.872875 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.062500  0.884193      3338 FSC  0.769958 SNR  6.694059e+00 FNCF  0.889011 FNCN  0.809316 FSCfull  0.870030 Cref  0.932754 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.066406  0.890079      3722 FSC  0.904980 SNR  1.904823e+01 FNCF  0.895025 FNCN  0.809225 FSCfull  0.950120 Cref  0.974741 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.070312  0.888096      4170 FSC  0.857243 SNR  1.200983e+01 FNCF  0.899517 FNCN  0.816330 FSCfull  0.923135 Cref  0.960799 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.074219  0.881947      4358 FSC  0.723358 SNR  5.229561e+00 FNCF  0.896087 FNCN  0.821250 FSCfull  0.839475 Cref  0.916229 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.789062  0.821038      8592 FSC  0.005374 SNR  1.080707e-02 FNCF  0.889648 FNCN  0.823173 FSCfull  0.010692 Cref  0.103400 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.792969  0.813430      7208 FSC  -0.044355 SNR -8.494283e-02 FNCF  0.891566 FNCN  0.824518 FSCfull  -0.092828 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.796875  0.813393      6296 FSC  -0.044580 SNR -8.535559e-02 FNCF  0.891161 FNCN  0.818115 FSCfull  -0.093321 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.800781  0.812815      5544 FSC  -0.048161 SNR -9.189702e-02 FNCF  0.892987 FNCN  0.824486 FSCfull  -0.101197 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.804688  0.814086      5360 FSC  -0.040262 SNR -7.740746e-02 FNCF  0.893581 FNCN  0.822037 FSCfull  -0.083902 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.808594  0.814528      4344 FSC  -0.037483 SNR -7.225678e-02 FNCF  0.896030 FNCN  0.823916 FSCfull  -0.077884 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.812500  0.813960      3272 FSC  -0.041049 SNR -7.886156e-02 FNCF  0.895996 FNCN  0.815310 FSCfull  -0.085613 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.816406  0.816745      3096 FSC  -0.023301 SNR -4.554071e-02 FNCF  0.903188 FNCN  0.808224 FSCfull  -0.047714 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.820312  0.823611      2840 FSC  0.023389 SNR  4.789782e-02 FNCF  0.892511 FNCN  0.822457 FSCfull  0.045708 Cref  0.213795 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.824219  0.810629      2240 FSC  -0.061448 SNR -1.157814e-01 FNCF  0.894149 FNCN  0.805167 FSCfull  -0.130942 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.828125  0.811470      1320 FSC  -0.056380 SNR -1.067427e-01 FNCF  0.895955 FNCN  0.802224 FSCfull  -0.119498 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.832031  0.812934      1352 FSC  -0.047426 SNR -9.055756e-02 FNCF  0.913658 FNCN  0.815504 FSCfull  -0.099575 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.835938  0.823354      1152 FSC  0.021557 SNR  4.406357e-02 FNCF  0.917390 FNCN  0.826730 FSCfull  0.042204 Cref  0.205436 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.839844  0.817772        800 FSC  -0.016595 SNR -3.264812e-02 FNCF  0.886657 FNCN  0.834540 FSCfull  -0.033750 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.843750  0.824257        288 FSC  0.028009 SNR  5.763305e-02 FNCF  0.847956 FNCN  0.782642 FSCfull  0.054492 Cref  0.233436 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.847656  0.821916        392 FSC  0.011451 SNR  2.316754e-02 FNCF  0.862911 FNCN  0.801126 FSCfull  0.022643 Cref  0.150476 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.851562  0.765112        200 FSC  -0.272800 SNR -4.286612e-01 FNCF  0.888032 FNCN  0.840993 FSCfull  -0.750275 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.855469  0.812369        72 FSC  -0.050901 SNR -9.687171e-02 FNCF  0.851466 FNCN  0.740952 FSCfull  -0.107262 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.859375  0.777638          8 FSC  -0.224759 SNR -3.670256e-01 FNCF  0.680124 FNCN  0.689641 FSCfull  -0.579843 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.863281  0.000000          0 FSC  -0.848036 SNR -9.177697e-01 FNCF  0.000000 FNCN  0.000000 FSCfull -11.160973 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
</pre>
 +
FNCfull, Cref, NoiseWeightedの結果が表示される。<br>
 +
R=0にてCrefが負で0に補正されるため、全てのNoiseWeightedが0となる。<br>
 +
<br>
 +
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSCfull<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
Cref<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
NoiseWeighted<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
グラフでは最後の1点を除いていて表示している。<br>
 +
<br>
 +
 +
===== -FSCfull, -Cref, d=0.025, NoiseWeighted=-100 で実行 =====
 +
出力結果<br>
 +
<pre>
 +
  0.000000  0.961060        147 FSC  19.604071 SNR -2.107503e+00 FNCF  0.881653 FNCN  0.813775 FSCfull  1.902932 Cref  1.379468 NoiseWeighted  1.379468
 +
  0.025000  0.884961      3596 FSC  0.778687 SNR  7.036960e+00 FNCF  0.890538 FNCN  0.819820 FSCfull  0.875575 Cref  0.935722 NoiseWeighted  0.950457
 +
  0.050000  0.876699      13334 FSC  0.618184 SNR  3.238129e+00 FNCF  0.901366 FNCN  0.819141 FSCfull  0.764047 Cref  0.874098 NoiseWeighted  0.930472
 +
  0.075000  0.884583      30012 FSC  0.770666 SNR  6.720909e+00 FNCF  0.893296 FNCN  0.821043 FSCfull  0.870482 Cref  0.932996 NoiseWeighted  1.073872
 +
  0.100000  0.888691      53048 FSC  0.862079 SNR  1.250108e+01 FNCF  0.894515 FNCN  0.820477 FSCfull  0.925932 Cref  0.962254 NoiseWeighted  1.235558
 +
  0.125000  0.873868      82634 FSC  0.569634 SNR  2.647204e+00 FNCF  0.893251 FNCN  0.822256 FSCfull  0.725817 Cref  0.851949 NoiseWeighted  1.259099
 +
  0.150000  0.860938    118688 FSC  0.380513 SNR  1.228478e+00 FNCF  0.892919 FNCN  0.822140 FSCfull  0.551263 Cref  0.742471 NoiseWeighted  1.303077
 +
  0.175000  0.862499    161322 FSC  0.400894 SNR  1.338309e+00 FNCF  0.895633 FNCN  0.819697 FSCfull  0.572341 Cref  0.756532 NoiseWeighted  1.626799
 +
  0.200000  0.875542    211496 FSC  0.597988 SNR  2.974978e+00 FNCF  0.892626 FNCN  0.820726 FSCfull  0.748426 Cref  0.865116 NoiseWeighted  2.351630
 +
  0.225000  0.882194    266468 FSC  0.721495 SNR  5.181196e+00 FNCF  0.893766 FNCN  0.819388 FSCfull  0.838219 Cref  0.915543 NoiseWeighted  3.245882
 +
  0.250000  0.874374    330126 FSC  0.578097 SNR  2.740421e+00 FNCF  0.892148 FNCN  0.819562 FSCfull  0.732650 Cref  0.855950 NoiseWeighted  4.083509
 +
  0.275000  0.868385    398912 FSC  0.483453 SNR  1.871867e+00 FNCF  0.893360 FNCN  0.818555 FSCfull  0.651794 Cref  0.807338 NoiseWeighted  5.347409
 +
  0.300000  0.861123    473858 FSC  0.382903 SNR  1.240984e+00 FNCF  0.894373 FNCN  0.819237 FSCfull  0.553767 Cref  0.744156 NoiseWeighted  7.060352
 +
  0.325000  0.852294    557496 FSC  0.277607 SNR  7.685764e-01 FNCF  0.894332 FNCN  0.820382 FSCfull  0.434573 Cref  0.659222 NoiseWeighted  9.243587
 +
  0.350000  0.846181    647132 FSC  0.213624 SNR  5.433115e-01 FNCF  0.893565 FNCN  0.819353 FSCfull  0.352043 Cref  0.593332 NoiseWeighted  12.685995
 +
  0.375000  0.842054    739454 FSC  0.173934 SNR  4.211135e-01 FNCF  0.894578 FNCN  0.820175 FSCfull  0.296326 Cref  0.544359 NoiseWeighted  18.310566
 +
  0.400000  0.836904    845340 FSC  0.127900 SNR  2.933142e-01 FNCF  0.895293 FNCN  0.819759 FSCfull  0.226793 Cref  0.476228 NoiseWeighted  26.001148
 +
  0.425000  0.836800    950870 FSC  0.127013 SNR  2.909839e-01 FNCF  0.894829 FNCN  0.820387 FSCfull  0.225397 Cref  0.474760 NoiseWeighted  43.409539
 +
  0.450000  0.834607    1068284 FSC  0.108519 SNR  2.434566e-01 FNCF  0.894605 FNCN  0.819227 FSCfull  0.195790 Cref  0.442482 NoiseWeighted  69.905495
 +
  0.475000  0.831828    1190048 FSC  0.085938 SNR  1.880360e-01 FNCF  0.893867 FNCN  0.819873 FSCfull  0.158275 Cref  0.397838 NoiseWeighted 112.046453
 +
  0.500000  0.829300    1284690 FSC  0.066183 SNR  1.417471e-01 FNCF  0.893855 FNCN  0.821343 FSCfull  0.124149 Cref  0.352348 NoiseWeighted 182.520960
 +
  0.525000  0.827369    1227836 FSC  0.051568 SNR  1.087446e-01 FNCF  0.894786 FNCN  0.820592 FSCfull  0.098079 Cref  0.313176 NoiseWeighted 307.856690
 +
  0.550000  0.824926    1141760 FSC  0.033639 SNR  6.962054e-02 FNCF  0.893119 FNCN  0.820052 FSCfull  0.065089 Cref  0.255125 NoiseWeighted 491.027655
 +
  0.575000  0.824884    1043124 FSC  0.033335 SNR  6.896969e-02 FNCF  0.894419 FNCN  0.819959 FSCfull  0.064520 Cref  0.254007 NoiseWeighted 987.556329
 +
  0.600000  0.823838    930008 FSC  0.025857 SNR  5.308599e-02 FNCF  0.894395 FNCN  0.819809 FSCfull  0.050410 Cref  0.224522 NoiseWeighted 1819.317450
 +
  0.625000  0.822523    803708 FSC  0.016596 SNR  3.375260e-02 FNCF  0.894275 FNCN  0.820134 FSCfull  0.032651 Cref  0.180695 NoiseWeighted 3148.491102
 +
  0.650000  0.821119    663864 FSC  0.006894 SNR  1.388304e-02 FNCF  0.894622 FNCN  0.820588 FSCfull  0.013693 Cref  0.117017 NoiseWeighted 4523.596884
 +
  0.675000  0.820229    512012 FSC  0.000838 SNR  1.678337e-03 FNCF  0.893624 FNCN  0.820495 FSCfull  0.001676 Cref  0.040933 NoiseWeighted 3622.105778
 +
  0.700000  0.819524    348596 FSC  -0.003899 SNR -7.768473e-03 FNCF  0.894646 FNCN  0.819049 FSCfull  -0.007829 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.725000  0.818723    217808 FSC  -0.009236 SNR -1.830228e-02 FNCF  0.893341 FNCN  0.820796 FSCfull  -0.018643 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.750000  0.820472    135048 FSC  0.002487 SNR  4.985434e-03 FNCF  0.891864 FNCN  0.822416 FSCfull  0.004961 Cref  0.070432 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.775000  0.825089      77288 FSC  0.034817 SNR  7.214486e-02 FNCF  0.895766 FNCN  0.818517 FSCfull  0.067290 Cref  0.259404 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.800000  0.815167      38120 FSC  -0.032256 SNR -6.249550e-02 FNCF  0.898301 FNCN  0.823939 FSCfull  -0.066662 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.825000  0.816419      13488 FSC  -0.024276 SNR -4.740110e-02 FNCF  0.894416 FNCN  0.824161 FSCfull  -0.049760 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.850000  0.814605      1760 FSC  -0.035796 SNR -6.911783e-02 FNCF  0.894095 FNCN  0.806454 FSCfull  -0.074250 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
</pre>
 +
R=0.675000までNoiseweightedが出力されている。<br>
 +
<br>
 +
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCF<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCN<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNC<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSC<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
SNR<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSCfull<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
Cref<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata-d-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
NoiseWeighted<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata1-d-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNC, FNCF, FNCNの比較<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata1-d-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
NoiseWeighted(R=0.375000まで表示)<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
グラフでは最初の1点を除いていて表示している。<br>
 +
<br>
 +
このようにFNCがFNCF, FNCNの間にある場合はSNR, FSC, FSCfullの推定値が正となり、Cref, NoiseWeightの値を実数として求めることができる。<br>
 +
<br>
 +
 +
==== -FSCと-mask, -maskBack ファイルを指定して実行2 ====
 +
[[#-FSCと-mask, -maskBack ファイルを指定して実行|上記の例]]では、maskファイルの作成にてローパスフィルタを掛けるときにhalf value point=0.0125(80Å)とかなり粗めにしていたために、ほとんど楕円に近い画像となっていました。<br>
 +
次はhalf value point=0.05(20Å)としてmaskファイルを用意します。<br>
 +
-maskのファイル: このファイルは[[チュートリアル一覧#mrcImage]]にて作成できます。<br>
 +
<br>
 +
Makefile内の設定<br>
 +
<pre>
 +
MASK_VALUE=0.05
 +
</pre>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-Mask1-P.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-Mask1-P.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
1 (114, 141, 82)<br>
 +
0.00774205<br>
 +
0.0876476<br>
 +
2.13983e-05<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
-maskBack: 同じファイルを使用します。<br>
 +
<br>
 +
 +
===== NoiseWeighted=-100, -FSCfull, -Cref =====
 +
<pre>
 +
FNCF 0.914907 FNCN 0.819953
 +
  0.000000  0.991796          1 FSC  9.512511 SNR -2.234948e+00 FNCF  0.982818 FNCN  0.771068 FSCfull  1.809750 Cref  1.345270 NoiseWeighted  1.345270
 +
  0.003906  0.982392        18 FSC  5.913521 SNR -2.407040e+00 FNCF  0.979065 FNCN  0.796796 FSCfull  1.710712 Cref  1.307942 NoiseWeighted  1.308441
 +
  0.007812  0.963411        62 FSC  3.088481 SNR -2.957634e+00 FNCF  0.971746 FNCN  0.760178 FSCfull  1.510821 Cref  1.229154 NoiseWeighted  1.231031
 +
  0.011719  0.934883        98 FSC  1.532837 SNR -5.753490e+00 FNCF  0.963111 FNCN  0.803158 FSCfull  1.210372 Cref  1.100169 NoiseWeighted  1.103953
 +
  0.015625  0.902410        210 FSC  0.767399 SNR  6.598402e+00 FNCF  0.955381 FNCN  0.827784 FSCfull  0.868393 Cref  0.931876 NoiseWeighted  0.937581
 +
  0.019531  0.864067        350 FSC  0.302572 SNR  8.676784e-01 FNCF  0.940646 FNCN  0.801457 FSCfull  0.464576 Cref  0.681598 NoiseWeighted  0.688129
 +
  0.023438  0.841587        450 FSC  0.128559 SNR  2.950497e-01 FNCF  0.929146 FNCN  0.807370 FSCfull  0.227829 Cref  0.477314 NoiseWeighted  0.483914
 +
  0.027344  0.856990        602 FSC  0.242277 SNR  6.394883e-01 FNCF  0.922377 FNCN  0.819179 FSCfull  0.390054 Cref  0.624543 NoiseWeighted  0.636326
 +
  0.031250  0.887424        762 FSC  0.551068 SNR  2.455017e+00 FNCF  0.922938 FNCN  0.811850 FSCfull  0.710566 Cref  0.842951 NoiseWeighted  0.863784
 +
  0.035156  0.887318      1142 FSC  0.549727 SNR  2.441751e+00 FNCF  0.924502 FNCN  0.804822 FSCfull  0.709450 Cref  0.842289 NoiseWeighted  0.868721
 +
  0.039062  0.879608      1250 FSC  0.457992 SNR  1.689984e+00 FNCF  0.927185 FNCN  0.798498 FSCfull  0.628251 Cref  0.792623 NoiseWeighted  0.823443
 +
  0.042969  0.874892      1458 FSC  0.407043 SNR  1.372928e+00 FNCF  0.927562 FNCN  0.809349 FSCfull  0.578580 Cref  0.760644 NoiseWeighted  0.796577
 +
  0.046875  0.874435      1814 FSC  0.402297 SNR  1.346145e+00 FNCF  0.920495 FNCN  0.820928 FSCfull  0.573769 Cref  0.757475 NoiseWeighted  0.800249
 +
  0.050781  0.877405      2178 FSC  0.433740 SNR  1.531945e+00 FNCF  0.907902 FNCN  0.804488 FSCfull  0.605047 Cref  0.777848 NoiseWeighted  0.829646
 +
  0.054688  0.875931      2498 FSC  0.417965 SNR  1.436221e+00 FNCF  0.903627 FNCN  0.813420 FSCfull  0.589528 Cref  0.767807 NoiseWeighted  0.827416
 +
  0.058594  0.876247      2622 FSC  0.421315 SNR  1.456114e+00 FNCF  0.912572 FNCN  0.826763 FSCfull  0.592853 Cref  0.769969 NoiseWeighted  0.838975
 +
  0.062500  0.884193      3338 FSC  0.511185 SNR  2.091527e+00 FNCF  0.916913 FNCN  0.821846 FSCfull  0.676535 Cref  0.822518 NoiseWeighted  0.906895
 +
  0.066406  0.890079      3722 FSC  0.585445 SNR  2.824450e+00 FNCF  0.917732 FNCN  0.820012 FSCfull  0.738524 Cref  0.859374 NoiseWeighted  0.959536
 +
  0.070312  0.888096      4170 FSC  0.559622 SNR  2.541557e+00 FNCF  0.918467 FNCN  0.831005 FSCfull  0.717638 Cref  0.847135 NoiseWeighted  0.958583
 +
  0.074219  0.881947      4358 FSC  0.484656 SNR  1.880902e+00 FNCF  0.920695 FNCN  0.829698 FSCfull  0.652886 Cref  0.808014 NoiseWeighted  0.927312
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.644531  0.822764    109556 FSC  0.015021 SNR  3.049937e-02 FNCF  0.914710 FNCN  0.819465 FSCfull  0.029597 Cref  0.172037 NoiseWeighted 5571.763528
 +
  0.648438  0.820426    104768 FSC  0.002494 SNR  5.000113e-03 FNCF  0.916695 FNCN  0.818935 FSCfull  0.004975 Cref  0.070535 NoiseWeighted 2591.879420
 +
  0.652344  0.820764    101724 FSC  0.004285 SNR  8.606361e-03 FNCF  0.915339 FNCN  0.815352 FSCfull  0.008533 Cref  0.092374 NoiseWeighted 3854.118436
 +
  0.656250  0.821992      98396 FSC  0.010851 SNR  2.194065e-02 FNCF  0.914227 FNCN  0.817587 FSCfull  0.021470 Cref  0.146525 NoiseWeighted 6946.843637
 +
  0.660156  0.820556      94632 FSC  0.003182 SNR  6.384020e-03 FNCF  0.912940 FNCN  0.820474 FSCfull  0.006344 Cref  0.079646 NoiseWeighted 4294.096180
 +
  0.664062  0.819228      90908 FSC  -0.003806 SNR -7.583799e-03 FNCF  0.912924 FNCN  0.819343 FSCfull  -0.007642 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.667969  0.819197      86684 FSC  -0.003967 SNR -7.901843e-03 FNCF  0.914583 FNCN  0.817105 FSCfull  -0.007965 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.671875  0.820568      82776 FSC  0.003245 SNR  6.510316e-03 FNCF  0.915174 FNCN  0.819274 FSCfull  0.006468 Cref  0.080425 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.675781  0.820683      80372 FSC  0.003858 SNR  7.746611e-03 FNCF  0.913751 FNCN  0.818000 FSCfull  0.007687 Cref  0.087676 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.679688  0.821076      75108 FSC  0.005946 SNR  1.196247e-02 FNCF  0.913970 FNCN  0.815727 FSCfull  0.011821 Cref  0.108725 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
  0.828125  0.811470      1320 FSC  -0.042763 SNR -8.201861e-02 FNCF  0.917130 FNCN  0.825454 FSCfull  -0.089347 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.832031  0.812934      1352 FSC  -0.035646 SNR -6.883734e-02 FNCF  0.920492 FNCN  0.823277 FSCfull  -0.073926 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.835938  0.823354      1152 FSC  0.018231 SNR  3.713860e-02 FNCF  0.925875 FNCN  0.800023 FSCfull  0.035809 Cref  0.189232 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.839844  0.817772        800 FSC  -0.011359 SNR -2.246248e-02 FNCF  0.931022 FNCN  0.818680 FSCfull  -0.022979 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.843750  0.824257        288 FSC  0.023185 SNR  4.747129e-02 FNCF  0.926149 FNCN  0.862458 FSCfull  0.045320 Cref  0.212885 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.847656  0.821916        392 FSC  0.010442 SNR  2.110497e-02 FNCF  0.912921 FNCN  0.826884 FSCfull  0.020669 Cref  0.143766 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.851562  0.765112        200 FSC  -0.224072 SNR -3.661096e-01 FNCF  0.904654 FNCN  0.721120 FSCfull  -0.577560 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.855469  0.812369        72 FSC  -0.038404 SNR -7.396801e-02 FNCF  0.878913 FNCN  0.789634 FSCfull  -0.079876 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.859375  0.777638          8 FSC  -0.182221 SNR -3.082684e-01 FNCF  0.792984 FNCN  0.764045 FSCfull  -0.445647 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.863281  0.000000          0 FSC  -0.811947 SNR -8.962150e-01 FNCF  0.000000 FNCN  0.000000 FSCfull  -8.635308 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
</pre>
 +
刻み幅dがデフォルトの場合でも、R=0.660156のデータまでを見えるようになりました。<br>
 +
<br>
 +
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCF<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCN<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNC<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSC<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
SNR<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSCfull<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
Cref<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata2-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
NoiseWeighted<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
グラフでは最初の4点と最後の1点を除いていて表示している。<br>
 +
<br>
 +
 +
=== SN比毎のデータ比較 ===
 +
下記のようにSN比が異なる入力ファイルについての結果を比較します。<br>
 +
[[チュートリアル一覧#mrcImage]]を利用したコマンドでも実行できます。<br>
 +
<br>
 +
Makefileの設定<br>
 +
<pre>
 +
#### Definition ####
 +
# Path of Input File
 +
INPUT_PATH=${EOS_HOME}/tutorial/SampleData/1VOM.mrc
 +
#INPUT_PATH=${EOS_HOME}/tutorial/SampleData/1VOM-N.mrc
 +
 +
### SN or NS for Input file
 +
INI_SN=0.3 1 3 10 100
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
それぞれの入力画像(パディング前)<br>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">SN比<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">SN=0.3<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">SN=1<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">SN=3<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">SN=10<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">SN=100<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-SN0.3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]</p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-SN1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]</p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-SN3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]</p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-SN10-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]</p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input-SN100-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]</p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input1-SN0.3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input1-SN1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input1-SN3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input1-SN10-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Input1-SN100-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-7489.39 (57, 54, 75)<br>
 +
8066.02 (17, 29, 46)<br>
 +
68.7388<br>
 +
1679.17<br>
 +
2.09896<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2225.59 (26, 40, 83)<br>
 +
4567.91 (28, 50, 50)<br>
 +
72.5953<br>
 +
578.119<br>
 +
0.722649<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-784.63 (44, 6, 70)<br>
 +
3724.44 (41, 60, 31)<br>
 +
72.3035<br>
 +
337.846<br>
 +
0.422308<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-246.726 (17, 25, 16)<br>
 +
3406.43 (20, 24, 29)<br>
 +
72.1722<br>
 +
299.081<br>
 +
0.373851<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-22.8638 (79, 41, 2)<br>
 +
3399.86 (23, 55, 41)<br>
 +
72.133<br>
 +
294.848<br>
 +
0.368559<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
==== [[:Media:Outdata-mrcImageFourierNeighborCorrelation.zip|出力ファイル]]の比較 ====
 +
<br>
 +
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCF<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNCN<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FNC<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSC<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
SNR<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
FSCfull<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
Cref<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="center">[[画像:Outdata3-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png]]<br>
 +
NoiseWeighted<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
==== Crefが最初に0になるデータ付近の出力結果 ====
 +
SN=0.3<br>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
  0.125000  0.830285      12606 FSC  0.056542 SNR  1.198620e-01 FNCF  0.905793 FNCN  0.820589 FSCfull  0.107033 Cref  0.327159 NoiseWeighted  0.483509
 +
  0.128906  0.835033      13802 FSC  0.085415 SNR  1.867837e-01 FNCF  0.907524 FNCN  0.814605 FSCfull  0.157386 Cref  0.396720 NoiseWeighted  0.601033
 +
  0.132812  0.831848      14754 FSC  0.065877 SNR  1.410450e-01 FNCF  0.913083 FNCN  0.824672 FSCfull  0.123610 Cref  0.351583 NoiseWeighted  0.546440
 +
  0.136719  0.831254      15194 FSC  0.062310 SNR  1.329021e-01 FNCF  0.916913 FNCN  0.827674 FSCfull  0.117311 Cref  0.342507 NoiseWeighted  0.546532
 +
  0.140625  0.826966      16454 FSC  0.037254 SNR  7.739025e-02 FNCF  0.915416 FNCN  0.821369 FSCfull  0.071831 Cref  0.268013 NoiseWeighted  0.439405
 +
  0.144531  0.820016      17154 FSC  -0.000933 SNR -1.863673e-03 FNCF  0.913586 FNCN  0.824382 FSCfull  -0.001867 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.148438  0.821502      18266 FSC  0.006992 SNR  1.408213e-02 FNCF  0.913122 FNCN  0.829752 FSCfull  0.013887 Cref  0.117841 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.152344  0.822031      18750 FSC  0.009847 SNR  1.989009e-02 FNCF  0.911698 FNCN  0.824485 FSCfull  0.019502 Cref  0.139650 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.156250  0.826508      20234 FSC  0.034651 SNR  7.179050e-02 FNCF  0.913992 FNCN  0.817147 FSCfull  0.066982 Cref  0.258808 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.160156  0.829598      21450 FSC  0.052491 SNR  1.107982e-01 FNCF  0.915240 FNCN  0.817627 FSCfull  0.099746 Cref  0.315827 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
SN=1<br>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
  0.625000  0.821968    125484 FSC  0.008655 SNR  1.746116e-02 FNCF  0.915959 FNCN  0.820807 FSCfull  0.017161 Cref  0.131002 NoiseWeighted 2282.625528
 +
  0.628906  0.822126    123668 FSC  0.009510 SNR  1.920304e-02 FNCF  0.915730 FNCN  0.818373 FSCfull  0.018841 Cref  0.137263 NoiseWeighted 2703.284812
 +
  0.632812  0.822135    118752 FSC  0.009556 SNR  1.929710e-02 FNCF  0.916420 FNCN  0.817706 FSCfull  0.018932 Cref  0.137593 NoiseWeighted 3065.097206
 +
  0.636719  0.822268    115748 FSC  0.010276 SNR  2.076605e-02 FNCF  0.916453 FNCN  0.821218 FSCfull  0.020344 Cref  0.142631 NoiseWeighted 3596.708750
 +
  0.640625  0.821682    111732 FSC  0.007114 SNR  1.432974e-02 FNCF  0.916046 FNCN  0.819347 FSCfull  0.014127 Cref  0.118858 NoiseWeighted 3395.432939
 +
  0.644531  0.819634    109556 FSC  -0.003778 SNR -7.527926e-03 FNCF  0.915582 FNCN  0.818883 FSCfull  -0.007585 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.648438  0.820647    104768 FSC  0.001581 SNR  3.167601e-03 FNCF  0.915830 FNCN  0.819727 FSCfull  0.003158 Cref  0.056193 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.652344  0.820390    101724 FSC  0.000214 SNR  4.288445e-04 FNCF  0.914391 FNCN  0.820488 FSCfull  0.000429 Cref  0.020704 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.656250  0.821091      98396 FSC  0.003947 SNR  7.925782e-03 FNCF  0.913665 FNCN  0.822480 FSCfull  0.007863 Cref  0.088676 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.660156  0.821039      94632 FSC  0.003669 SNR  7.364323e-03 FNCF  0.913751 FNCN  0.819652 FSCfull  0.007310 Cref  0.085501 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
SN=3<br>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
  0.765625  0.821757      15104 FSC  0.009515 SNR  1.921255e-02 FNCF  0.922342 FNCN  0.820350 FSCfull  0.018850 Cref  0.137297 NoiseWeighted 317721.373090
 +
  0.769531  0.822221      13472 FSC  0.011996 SNR  2.428272e-02 FNCF  0.922754 FNCN  0.817671 FSCfull  0.023707 Cref  0.153971 NoiseWeighted 413936.197088
 +
  0.773438  0.821217      12312 FSC  0.006642 SNR  1.337191e-02 FNCF  0.918091 FNCN  0.817507 FSCfull  0.013195 Cref  0.114871 NoiseWeighted 359043.192167
 +
  0.777344  0.827075      11528 FSC  0.038716 SNR  8.055134e-02 FNCF  0.915129 FNCN  0.819965 FSCfull  0.074547 Cref  0.273032 NoiseWeighted 992931.202359
 +
  0.781250  0.824370      10056 FSC  0.023654 SNR  4.845502e-02 FNCF  0.915417 FNCN  0.814779 FSCfull  0.046216 Cref  0.214978 NoiseWeighted 910337.354456
 +
  0.785156  0.818701      8936 FSC  -0.006536 SNR -1.298769e-02 FNCF  0.913984 FNCN  0.830604 FSCfull  -0.013159 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.789062  0.819627      8592 FSC  -0.001726 SNR -3.446727e-03 FNCF  0.906964 FNCN  0.823014 FSCfull  -0.003459 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.792969  0.820210      7208 FSC  0.001325 SNR  2.654493e-03 FNCF  0.903543 FNCN  0.818116 FSCfull  0.002647 Cref  0.051454 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.796875  0.815899      6296 FSC  -0.020810 SNR -4.077152e-02 FNCF  0.908125 FNCN  0.817338 FSCfull  -0.042504 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.800781  0.823119      5544 FSC  0.016835 SNR  3.424612e-02 FNCF  0.914006 FNCN  0.817025 FSCfull  0.033112 Cref  0.181967 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
SN=10<br>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
  0.828125  0.844910      1320 FSC  0.149342 SNR  3.511221e-01 FNCF  0.912374 FNCN  0.803915 FSCfull  0.259874 Cref  0.509779 NoiseWeighted 14231907.761588
 +
  0.832031  0.837728      1352 FSC  0.101517 SNR  2.259737e-01 FNCF  0.902768 FNCN  0.811758 FSCfull  0.184322 Cref  0.429327 NoiseWeighted 14095470.163758
 +
  0.835938  0.836067      1152 FSC  0.091023 SNR  2.002756e-01 FNCF  0.913173 FNCN  0.800848 FSCfull  0.166858 Cref  0.408483 NoiseWeighted 15783593.638134
 +
  0.839844  0.831098        800 FSC  0.060772 SNR  1.294080e-01 FNCF  0.910829 FNCN  0.797062 FSCfull  0.114580 Cref  0.338497 NoiseWeighted 15404941.069368
 +
  0.843750  0.829879        288 FSC  0.053609 SNR  1.132924e-01 FNCF  0.886515 FNCN  0.824411 FSCfull  0.101763 Cref  0.319004 NoiseWeighted 17112149.322272
 +
  0.847656  0.852127        392 FSC  0.201767 SNR  5.055348e-01 FNCF  0.880805 FNCN  0.817034 FSCfull  0.335784 Cref  0.579469 NoiseWeighted 36666886.878487
 +
  0.851562  0.819553        200 FSC  -0.003419 SNR -6.815128e-03 FNCF  0.916154 FNCN  0.829615 FSCfull  -0.006862 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.855469  0.816624        72 FSC  -0.018488 SNR -3.630448e-02 FNCF  0.925319 FNCN  0.796666 FSCfull  -0.037672 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.859375  0.917138          8 FSC  1.040065 SNR -5.191875e+01 FNCF  0.853931 FNCN  0.697182 FSCfull  1.019639 Cref  1.009772 NoiseWeighted  0.000000
 +
  0.863281  0.000000          0 FSC  -0.811813 SNR -8.961335e-01 FNCF  0.000000 FNCN  0.000000 FSCfull  -8.627743 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
SN=100<br>
 +
<pre>
 +
-前略-
 +
 +
  0.828125  0.901847      1320 FSC  0.756211 SNR  6.203817e+00 FNCF  0.919589 FNCN  0.822237 FSCfull  0.861185 Cref  0.928000 NoiseWeighted 25907738.220224
 +
  0.832031  0.903973      1352 FSC  0.791551 SNR  7.594690e+00 FNCF  0.914005 FNCN  0.814800 FSCfull  0.883649 Cref  0.940026 NoiseWeighted 30862499.462702
 +
  0.835938  0.908114      1152 FSC  0.864634 SNR  1.277477e+01 FNCF  0.893985 FNCN  0.804227 FSCfull  0.927403 Cref  0.963018 NoiseWeighted 37210603.792030
 +
  0.839844  0.915035        800 FSC  1.001069 SNR -1.872989e+03 FNCF  0.903230 FNCN  0.814543 FSCfull  1.000534 Cref  1.000267 NoiseWeighted 45521947.697260
 +
  0.843750  0.918614        288 FSC  1.079756 SNR -2.707648e+01 FNCF  0.924216 FNCN  0.803353 FSCfull  1.038349 Cref  1.018994 NoiseWeighted 54661348.443263
 +
  0.847656  0.914517        392 FSC  0.990177 SNR  2.016063e+02 FNCF  0.929501 FNCN  0.780177 FSCfull  0.995064 Cref  0.997529 NoiseWeighted 63120364.126596
 +
  0.851562  0.898429        200 FSC  0.702229 SNR  4.716581e+00 FNCF  0.931254 FNCN  0.802611 FSCfull  0.825070 Cref  0.908334 NoiseWeighted 67850948.494955
 +
  0.855469  0.877008        72 FSC  0.427280 SNR  1.492108e+00 FNCF  0.926600 FNCN  0.805094 FSCfull  0.598733 Cref  0.773779 NoiseWeighted 68284951.426467
 +
  0.859375  0.899341          8 FSC  0.716309 SNR  5.049935e+00 FNCF  0.841373 FNCN  0.745881 FSCfull  0.834709 Cref  0.913624 NoiseWeighted 95324620.998659
 +
  0.863281  0.000000          0 FSC  -0.812524 SNR -8.965661e-01 FNCF  0.000000 FNCN  0.000000 FSCfull  -8.668008 Cref  0.000000 NoiseWeighted  0.000000
 +
 +
-後略-
 +
</pre>
 +
<br>
 +
データやグラフによりSNが良くなるほど、分解能が良くなることが分かります。<br>
 +
<br>
 +
 +
== 参考文献 ==
 +
[http://grigoriefflab.janelia.org/node/55 Ab initio resolution measurement for single particle structures] (FNC, FNCF, FNCNを求めてSNR、FSCを推定する)<br>
 +
[http://nramm.scripps.edu/wp-content/seminars/2004/dlecture/ Single particle electron microscopy] (FSCからCref, NoiseWeightedを求める)

2014年10月28日 (火) 09:03時点における最新版

mrcImageFourierNeighborCorrelationは、フーリエ空間の冗長性を利用した分解能をチェックする為のEosのコマンドです。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage(3D) NULL
-o 選択 出力ファイル: ASCII(FNC) stdout
-d 選択 delta(フーリエ空間) 0.0
-C 選択 CentreMode 0
-M 選択 補間モード 0
-FSC 選択 予測したFSCの出力フラグ
-Cref 選択 Crefの出力フラグ
-FSCfull 選択 FSC fullの出力フラグ
-NoiseWeighted 選択 NoiseWeighted: Cref*exp(-Brestore/(4*d^2) -100.0
-mask 選択 入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC) NULL
-maskBack 選択 入力ファイル: mrcImage(3D)(Mask for FSC Back) NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


-maskの詳細

-i のファイルと同じ形状の二値化ファイルを使用します。

(作成例)
-i のファイルを元にmrcImageLowPassFilterにて低周波成分を得て、
mrcImageBinalization(m=32)にて二値化する。

-maskBackの詳細

-i のファイルと同じサイズで全てのデータが1のファイルを使用します。
但し、-i のファイルがWindowingされている場合は同じ窓関数を掛けるようにします。

(作成例)
-iの入力ファイルをmrcInfoにてサイズを調べ、
mrcImageNullImageCreate(v=1)にて全てのファイルが1の画像を作成し、
mrcImageWindowingにて同じ窓関数を掛ける。

-Cの詳細

モード 説明
0 中心を画像の中心とする: (Nx/2.0, Ny/2.0, Nz/2.0 )
1 中心を原点(左下端)とする: (0, 0, 0 )
2 中心を画像のStartNとする: (StartNx,StartNy,StartNz)


-Mの詳細

補間モード参照。

-mの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像で実行

Input-1VOM-N.png
xy平面

Input1-1VOM-N.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2390.42 (77, 14, 69)

4374.62 (17, 62, 46)
72.1487
577.82

0.722275

 


  0.000000   0.863711          1 
  0.012500   0.553876         18 
  0.025000   0.170684         64 
  0.037500   0.221808        146 
  0.050000   0.230874        266 
  0.062500   0.280359        382 
  0.075000   0.269777        588 
  0.087500   0.280955        746 
  0.100000   0.322332       1002 
  0.112500   0.249747       1294 

-中略-

  0.750000  -0.005313       2256 
  0.762500   0.036957       1688 
  0.775000   0.021723       1264 
  0.787500   0.010364        864 
  0.800000  -0.026498        568 
  0.812500  -0.009259        312 
  0.825000  -0.009356        144 
  0.837500   0.030291         72 
  0.850000  -0.109028          8 
  0.862500   0.000000          0


Outdata-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
この画像は冗長性がほとんどないためにFNCがすぐに下がってしまっている。

入力ファイル(パディング)

上記のファイルを0でパディングして、冗長性を持たせます。
このファイルはチュートリアル一覧#mrcImageにて作成できます。

Input-1VOM-N-P.png
xy平面

Input1-1VOM-N-P.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2390.42 (165, 102, 147)

4374.62 (105, 150, 124)
2.75226
113.698

0.0277584


実行結果

  0.000000   0.991796          1
  0.003906   0.982392         18
  0.007812   0.963411         62
  0.011719   0.934883         98
  0.015625   0.902410        210
  0.019531   0.864067        350
  0.023438   0.841587        450
  0.027344   0.856990        602
  0.031250   0.887424        762
  0.035156   0.887318       1142

-中略-

  0.828125   0.811470       1320
  0.832031   0.812934       1352
  0.835938   0.823354       1152
  0.839844   0.817772        800
  0.843750   0.824257        288
  0.847656   0.821916        392
  0.851562   0.765112        200
  0.855469   0.812369         72
  0.859375   0.777638          8
  0.863281   0.000000          0


Outdata1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
冗長性を持つ画像の場合、FNCが高周波成分でも高い値になる。

オプション -d

d=0.025で実行
  0.000000   0.961060        147
  0.025000   0.884961       3596
  0.050000   0.876699      13334
  0.075000   0.884583      30012
  0.100000   0.888691      53048
  0.125000   0.873868      82634
  0.150000   0.860938     118688
  0.175000   0.862499     161322
  0.200000   0.875542     211496
  0.225000   0.882194     266468
  0.250000   0.874374     330126
  0.275000   0.868385     398912
  0.300000   0.861123     473858
  0.325000   0.852294     557496
  0.350000   0.846181     647132
  0.375000   0.842054     739454
  0.400000   0.836904     845340
  0.425000   0.836800     950870
  0.450000   0.834607    1068284
  0.475000   0.831828    1190048
  0.500000   0.829300    1284690
  0.525000   0.827369    1227836
  0.550000   0.824926    1141760
  0.575000   0.824884    1043124
  0.600000   0.823838     930008
  0.625000   0.822523     803708
  0.650000   0.821119     663864
  0.675000   0.820229     512012
  0.700000   0.819524     348596
  0.725000   0.818723     217808
  0.750000   0.820472     135048
  0.775000   0.825089      77288
  0.800000   0.815167      38120
  0.825000   0.816419      13488
  0.850000   0.814605       1760


Outdata-d-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

-FSCと-mask, -maskBack ファイルを指定して実行

-maskのファイル: このファイルはチュートリアル一覧#mrcImageにて作成できます。

Makefile内の設定

MASK_VALUE=0.0125

Input-Noise1-P.png
xy平面

Input1-Noise1-P.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1 (111, 135, 84)
0.0158784
0.125005

3.05189e-05


-maskBackのファイル: このファイルはチュートリアル一覧#mrcImageにて作成できます。

Input-Null1-P.png
xy平面

Input1-Null1-P.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1 (0, 0, 0)

1 (88, 88, 78)
0.038147
0.191551

4.67654e-05


出力結果

FNCF 0.894073 FNCN 0.820233
  0.000000   0.991796          1 FSC  -7.183377 SNR -1.755602e+00 FNCF   0.951711 FNCN  -0.366379 
  0.003906   0.982392         18 FSC -11.199417 SNR -1.836058e+00 FNCF   0.903913 FNCN   0.595703 
  0.007812   0.963411         62 FSC  31.808857 SNR -2.064916e+00 FNCF   0.844130 FNCN   0.798653 
  0.011719   0.934883         98 FSC   3.471075 SNR -2.809364e+00 FNCF   0.845211 FNCN   0.799688 
  0.015625   0.902410        210 FSC   1.254576 SNR -9.856209e+00 FNCF   0.886035 FNCN   0.734901 
  0.019531   0.864067        350 FSC   0.422099 SNR  1.460802e+00 FNCF   0.893608 FNCN   0.787841 
  0.023438   0.841587        450 FSC   0.169033 SNR  4.068355e-01 FNCF   0.889512 FNCN   0.827210 
  0.027344   0.856990        602 FSC   0.331378 SNR  9.912261e-01 FNCF   0.873868 FNCN   0.811905 
  0.031250   0.887424        762 FSC   0.834791 SNR  1.010589e+01 FNCF   0.889606 FNCN   0.818398 
  0.035156   0.887318       1142 FSC   0.832380 SNR  9.931723e+00 FNCF   0.897804 FNCN   0.824152 
  0.039062   0.879608       1250 FSC   0.672387 SNR  4.104771e+00 FNCF   0.894009 FNCN   0.803585 
  0.042969   0.874892       1458 FSC   0.587592 SNR  2.849572e+00 FNCF   0.887004 FNCN   0.803368 
  0.046875   0.874435       1814 FSC   0.579834 SNR  2.760026e+00 FNCF   0.884325 FNCN   0.816900 
  0.050781   0.877405       2178 FSC   0.631676 SNR  3.429994e+00 FNCF   0.896430 FNCN   0.821318 
  0.054688   0.875931       2498 FSC   0.605536 SNR  3.070172e+00 FNCF   0.908684 FNCN   0.828866 
  0.058594   0.876247       2622 FSC   0.611065 SNR  3.142250e+00 FNCF   0.910457 FNCN   0.831098 
  0.062500   0.884193       3338 FSC   0.763974 SNR  6.473637e+00 FNCF   0.898597 FNCN   0.823882 
  0.066406   0.890079       3722 FSC   0.897373 SNR  1.748804e+01 FNCF   0.888997 FNCN   0.820916 
  0.070312   0.888096       4170 FSC   0.850229 SNR  1.135368e+01 FNCF   0.896541 FNCN   0.822739 
  0.074219   0.881947       4358 FSC   0.717896 SNR  5.089588e+00 FNCF   0.897502 FNCN   0.819764 

-中略-

  0.789062   0.821038       8592 FSC   0.005476 SNR  1.101324e-02 FNCF   0.888864 FNCN   0.821332 
  0.792969   0.813430       7208 FSC  -0.044041 SNR -8.436653e-02 FNCF   0.889662 FNCN   0.818472 
  0.796875   0.813393       6296 FSC  -0.044265 SNR -8.477789e-02 FNCF   0.890629 FNCN   0.815216 
  0.800781   0.812815       5544 FSC  -0.047832 SNR -9.129702e-02 FNCF   0.894048 FNCN   0.808839 
  0.804688   0.814086       5360 FSC  -0.039964 SNR -7.685736e-02 FNCF   0.892404 FNCN   0.813711 
  0.808594   0.814528       4344 FSC  -0.037196 SNR -7.172486e-02 FNCF   0.886577 FNCN   0.828553 
  0.812500   0.813960       3272 FSC  -0.040749 SNR -7.830638e-02 FNCF   0.887005 FNCN   0.826397 
  0.816406   0.816745       3096 FSC  -0.023074 SNR -4.510691e-02 FNCF   0.895393 FNCN   0.818955 
  0.820312   0.823611       2840 FSC   0.023408 SNR  4.793880e-02 FNCF   0.898811 FNCN   0.825501 
  0.824219   0.810629       2240 FSC  -0.061066 SNR -1.151032e-01 FNCF   0.895444 FNCN   0.827601 
  0.828125   0.811470       1320 FSC  -0.056018 SNR -1.060935e-01 FNCF   0.903966 FNCN   0.820170 
  0.832031   0.812934       1352 FSC  -0.047100 SNR -8.996210e-02 FNCF   0.908462 FNCN   0.826379 
  0.835938   0.823354       1152 FSC   0.021585 SNR  4.412220e-02 FNCF   0.887402 FNCN   0.824615 
  0.839844   0.817772        800 FSC  -0.016396 SNR -3.226391e-02 FNCF   0.869994 FNCN   0.815638 
  0.843750   0.824257        288 FSC   0.028007 SNR  5.762863e-02 FNCF   0.880944 FNCN   0.824954 
  0.847656   0.821916        392 FSC   0.011526 SNR  2.331998e-02 FNCF   0.899626 FNCN   0.837368 
  0.851562   0.765112        200 FSC  -0.271800 SNR -4.274263e-01 FNCF   0.925513 FNCN   0.800424 
  0.855469   0.812369         72 FSC  -0.050561 SNR -9.625498e-02 FNCF   0.902540 FNCN   0.779785 
  0.859375   0.777638          8 FSC  -0.223864 SNR -3.658316e-01 FNCF   0.774510 FNCN   0.868126 
  0.863281   0.000000          0 FSC  -0.847425 SNR -9.174121e-01 FNCF   0.000000 FNCN   0.000000

FSC, SNR, FNCF, FNCNの結果が表示される。

Outdata-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSC

Outdata-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
SNR

Outdata-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCF

Outdata-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCN

グラフでは最初と最後の10点を除いていて表示している。

以降は-mask, maskBackにて同様のファイルを使用する。

-FSCfull, -Cref, NoiseWeighted=-100で実行

出力結果

FNCF 0.893745 FNCN 0.820252
  0.000000   0.991796          1 FSC  -6.985231 SNR -1.749538e+00 FNCF   0.704805 FNCN   0.391308 FSCfull   2.334156 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.003906   0.982392         18 FSC -10.699472 SNR -1.829052e+00 FNCF   0.821228 FNCN   0.684129 FSCfull   2.206197 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.007812   0.963411         62 FSC  37.413739 SNR -2.054924e+00 FNCF   0.884407 FNCN   0.773688 FSCfull   1.947935 Cref   1.395685 NoiseWeighted   0.000000 
  0.011719   0.934883         98 FSC   3.542894 SNR -2.786505e+00 FNCF   0.896445 FNCN   0.837667 FSCfull   1.559752 Cref   1.248900 NoiseWeighted   0.000000 
  0.015625   0.902410        210 FSC   1.267348 SNR -9.480880e+00 FNCF   0.879666 FNCN   0.865827 FSCfull   1.117912 Cref   1.057314 NoiseWeighted   0.000000 
  0.019531   0.864067        350 FSC   0.424680 SNR  1.476325e+00 FNCF   0.881884 FNCN   0.835433 FSCfull   0.596176 Cref   0.772124 NoiseWeighted   0.000000 
  0.023438   0.841587        450 FSC   0.169793 SNR  4.090381e-01 FNCF   0.901388 FNCN   0.806285 FSCfull   0.290296 Cref   0.538791 NoiseWeighted   0.000000 
  0.027344   0.856990        602 FSC   0.333237 SNR  9.995687e-01 FNCF   0.897467 FNCN   0.819184 FSCfull   0.499892 Cref   0.707031 NoiseWeighted   0.000000 
  0.031250   0.887424        762 FSC   0.841616 SNR  1.062755e+01 FNCF   0.888027 FNCN   0.826006 FSCfull   0.913997 Cref   0.956032 NoiseWeighted   0.000000 
  0.035156   0.887318       1142 FSC   0.839175 SNR  1.043589e+01 FNCF   0.885703 FNCN   0.827937 FSCfull   0.912556 Cref   0.955278 NoiseWeighted   0.000000 
  0.039062   0.879608       1250 FSC   0.677353 SNR  4.198725e+00 FNCF   0.886124 FNCN   0.821982 FSCfull   0.807645 Cref   0.898691 NoiseWeighted   0.000000 
  0.042969   0.874892       1458 FSC   0.591685 SNR  2.898177e+00 FNCF   0.893947 FNCN   0.826635 FSCfull   0.743470 Cref   0.862247 NoiseWeighted   0.000000 
  0.046875   0.874435       1814 FSC   0.583850 SNR  2.805960e+00 FNCF   0.893287 FNCN   0.825939 FSCfull   0.737254 Cref   0.858635 NoiseWeighted   0.000000 
  0.050781   0.877405       2178 FSC   0.636213 SNR  3.497730e+00 FNCF   0.891071 FNCN   0.829329 FSCfull   0.777666 Cref   0.881854 NoiseWeighted   0.000000 
  0.054688   0.875931       2498 FSC   0.609808 SNR  3.125677e+00 FNCF   0.882848 FNCN   0.823179 FSCfull   0.757616 Cref   0.870411 NoiseWeighted   0.000000 
  0.058594   0.876247       2622 FSC   0.615393 SNR  3.200107e+00 FNCF   0.884282 FNCN   0.810449 FSCfull   0.761911 Cref   0.872875 NoiseWeighted   0.000000 
  0.062500   0.884193       3338 FSC   0.769958 SNR  6.694059e+00 FNCF   0.889011 FNCN   0.809316 FSCfull   0.870030 Cref   0.932754 NoiseWeighted   0.000000 
  0.066406   0.890079       3722 FSC   0.904980 SNR  1.904823e+01 FNCF   0.895025 FNCN   0.809225 FSCfull   0.950120 Cref   0.974741 NoiseWeighted   0.000000 
  0.070312   0.888096       4170 FSC   0.857243 SNR  1.200983e+01 FNCF   0.899517 FNCN   0.816330 FSCfull   0.923135 Cref   0.960799 NoiseWeighted   0.000000 
  0.074219   0.881947       4358 FSC   0.723358 SNR  5.229561e+00 FNCF   0.896087 FNCN   0.821250 FSCfull   0.839475 Cref   0.916229 NoiseWeighted   0.000000 

-中略-

  0.789062   0.821038       8592 FSC   0.005374 SNR  1.080707e-02 FNCF   0.889648 FNCN   0.823173 FSCfull   0.010692 Cref   0.103400 NoiseWeighted   0.000000 
  0.792969   0.813430       7208 FSC  -0.044355 SNR -8.494283e-02 FNCF   0.891566 FNCN   0.824518 FSCfull  -0.092828 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.796875   0.813393       6296 FSC  -0.044580 SNR -8.535559e-02 FNCF   0.891161 FNCN   0.818115 FSCfull  -0.093321 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.800781   0.812815       5544 FSC  -0.048161 SNR -9.189702e-02 FNCF   0.892987 FNCN   0.824486 FSCfull  -0.101197 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.804688   0.814086       5360 FSC  -0.040262 SNR -7.740746e-02 FNCF   0.893581 FNCN   0.822037 FSCfull  -0.083902 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.808594   0.814528       4344 FSC  -0.037483 SNR -7.225678e-02 FNCF   0.896030 FNCN   0.823916 FSCfull  -0.077884 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.812500   0.813960       3272 FSC  -0.041049 SNR -7.886156e-02 FNCF   0.895996 FNCN   0.815310 FSCfull  -0.085613 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.816406   0.816745       3096 FSC  -0.023301 SNR -4.554071e-02 FNCF   0.903188 FNCN   0.808224 FSCfull  -0.047714 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.820312   0.823611       2840 FSC   0.023389 SNR  4.789782e-02 FNCF   0.892511 FNCN   0.822457 FSCfull   0.045708 Cref   0.213795 NoiseWeighted   0.000000 
  0.824219   0.810629       2240 FSC  -0.061448 SNR -1.157814e-01 FNCF   0.894149 FNCN   0.805167 FSCfull  -0.130942 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.828125   0.811470       1320 FSC  -0.056380 SNR -1.067427e-01 FNCF   0.895955 FNCN   0.802224 FSCfull  -0.119498 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.832031   0.812934       1352 FSC  -0.047426 SNR -9.055756e-02 FNCF   0.913658 FNCN   0.815504 FSCfull  -0.099575 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.835938   0.823354       1152 FSC   0.021557 SNR  4.406357e-02 FNCF   0.917390 FNCN   0.826730 FSCfull   0.042204 Cref   0.205436 NoiseWeighted   0.000000 
  0.839844   0.817772        800 FSC  -0.016595 SNR -3.264812e-02 FNCF   0.886657 FNCN   0.834540 FSCfull  -0.033750 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.843750   0.824257        288 FSC   0.028009 SNR  5.763305e-02 FNCF   0.847956 FNCN   0.782642 FSCfull   0.054492 Cref   0.233436 NoiseWeighted   0.000000 
  0.847656   0.821916        392 FSC   0.011451 SNR  2.316754e-02 FNCF   0.862911 FNCN   0.801126 FSCfull   0.022643 Cref   0.150476 NoiseWeighted   0.000000 
  0.851562   0.765112        200 FSC  -0.272800 SNR -4.286612e-01 FNCF   0.888032 FNCN   0.840993 FSCfull  -0.750275 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.855469   0.812369         72 FSC  -0.050901 SNR -9.687171e-02 FNCF   0.851466 FNCN   0.740952 FSCfull  -0.107262 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.859375   0.777638          8 FSC  -0.224759 SNR -3.670256e-01 FNCF   0.680124 FNCN   0.689641 FSCfull  -0.579843 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.863281   0.000000          0 FSC  -0.848036 SNR -9.177697e-01 FNCF   0.000000 FNCN   0.000000 FSCfull -11.160973 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000

FNCfull, Cref, NoiseWeightedの結果が表示される。
R=0にてCrefが負で0に補正されるため、全てのNoiseWeightedが0となる。

Outdata-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSCfull

Outdata-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
Cref

Outdata-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
NoiseWeighted

グラフでは最後の1点を除いていて表示している。

-FSCfull, -Cref, d=0.025, NoiseWeighted=-100 で実行

出力結果

  0.000000   0.961060        147 FSC  19.604071 SNR -2.107503e+00 FNCF   0.881653 FNCN   0.813775 FSCfull   1.902932 Cref   1.379468 NoiseWeighted   1.379468 
  0.025000   0.884961       3596 FSC   0.778687 SNR  7.036960e+00 FNCF   0.890538 FNCN   0.819820 FSCfull   0.875575 Cref   0.935722 NoiseWeighted   0.950457 
  0.050000   0.876699      13334 FSC   0.618184 SNR  3.238129e+00 FNCF   0.901366 FNCN   0.819141 FSCfull   0.764047 Cref   0.874098 NoiseWeighted   0.930472 
  0.075000   0.884583      30012 FSC   0.770666 SNR  6.720909e+00 FNCF   0.893296 FNCN   0.821043 FSCfull   0.870482 Cref   0.932996 NoiseWeighted   1.073872 
  0.100000   0.888691      53048 FSC   0.862079 SNR  1.250108e+01 FNCF   0.894515 FNCN   0.820477 FSCfull   0.925932 Cref   0.962254 NoiseWeighted   1.235558 
  0.125000   0.873868      82634 FSC   0.569634 SNR  2.647204e+00 FNCF   0.893251 FNCN   0.822256 FSCfull   0.725817 Cref   0.851949 NoiseWeighted   1.259099 
  0.150000   0.860938     118688 FSC   0.380513 SNR  1.228478e+00 FNCF   0.892919 FNCN   0.822140 FSCfull   0.551263 Cref   0.742471 NoiseWeighted   1.303077 
  0.175000   0.862499     161322 FSC   0.400894 SNR  1.338309e+00 FNCF   0.895633 FNCN   0.819697 FSCfull   0.572341 Cref   0.756532 NoiseWeighted   1.626799 
  0.200000   0.875542     211496 FSC   0.597988 SNR  2.974978e+00 FNCF   0.892626 FNCN   0.820726 FSCfull   0.748426 Cref   0.865116 NoiseWeighted   2.351630 
  0.225000   0.882194     266468 FSC   0.721495 SNR  5.181196e+00 FNCF   0.893766 FNCN   0.819388 FSCfull   0.838219 Cref   0.915543 NoiseWeighted   3.245882 
  0.250000   0.874374     330126 FSC   0.578097 SNR  2.740421e+00 FNCF   0.892148 FNCN   0.819562 FSCfull   0.732650 Cref   0.855950 NoiseWeighted   4.083509 
  0.275000   0.868385     398912 FSC   0.483453 SNR  1.871867e+00 FNCF   0.893360 FNCN   0.818555 FSCfull   0.651794 Cref   0.807338 NoiseWeighted   5.347409 
  0.300000   0.861123     473858 FSC   0.382903 SNR  1.240984e+00 FNCF   0.894373 FNCN   0.819237 FSCfull   0.553767 Cref   0.744156 NoiseWeighted   7.060352 
  0.325000   0.852294     557496 FSC   0.277607 SNR  7.685764e-01 FNCF   0.894332 FNCN   0.820382 FSCfull   0.434573 Cref   0.659222 NoiseWeighted   9.243587 
  0.350000   0.846181     647132 FSC   0.213624 SNR  5.433115e-01 FNCF   0.893565 FNCN   0.819353 FSCfull   0.352043 Cref   0.593332 NoiseWeighted  12.685995 
  0.375000   0.842054     739454 FSC   0.173934 SNR  4.211135e-01 FNCF   0.894578 FNCN   0.820175 FSCfull   0.296326 Cref   0.544359 NoiseWeighted  18.310566 
  0.400000   0.836904     845340 FSC   0.127900 SNR  2.933142e-01 FNCF   0.895293 FNCN   0.819759 FSCfull   0.226793 Cref   0.476228 NoiseWeighted  26.001148 
  0.425000   0.836800     950870 FSC   0.127013 SNR  2.909839e-01 FNCF   0.894829 FNCN   0.820387 FSCfull   0.225397 Cref   0.474760 NoiseWeighted  43.409539 
  0.450000   0.834607    1068284 FSC   0.108519 SNR  2.434566e-01 FNCF   0.894605 FNCN   0.819227 FSCfull   0.195790 Cref   0.442482 NoiseWeighted  69.905495 
  0.475000   0.831828    1190048 FSC   0.085938 SNR  1.880360e-01 FNCF   0.893867 FNCN   0.819873 FSCfull   0.158275 Cref   0.397838 NoiseWeighted 112.046453 
  0.500000   0.829300    1284690 FSC   0.066183 SNR  1.417471e-01 FNCF   0.893855 FNCN   0.821343 FSCfull   0.124149 Cref   0.352348 NoiseWeighted 182.520960 
  0.525000   0.827369    1227836 FSC   0.051568 SNR  1.087446e-01 FNCF   0.894786 FNCN   0.820592 FSCfull   0.098079 Cref   0.313176 NoiseWeighted 307.856690 
  0.550000   0.824926    1141760 FSC   0.033639 SNR  6.962054e-02 FNCF   0.893119 FNCN   0.820052 FSCfull   0.065089 Cref   0.255125 NoiseWeighted 491.027655 
  0.575000   0.824884    1043124 FSC   0.033335 SNR  6.896969e-02 FNCF   0.894419 FNCN   0.819959 FSCfull   0.064520 Cref   0.254007 NoiseWeighted 987.556329 
  0.600000   0.823838     930008 FSC   0.025857 SNR  5.308599e-02 FNCF   0.894395 FNCN   0.819809 FSCfull   0.050410 Cref   0.224522 NoiseWeighted 1819.317450 
  0.625000   0.822523     803708 FSC   0.016596 SNR  3.375260e-02 FNCF   0.894275 FNCN   0.820134 FSCfull   0.032651 Cref   0.180695 NoiseWeighted 3148.491102 
  0.650000   0.821119     663864 FSC   0.006894 SNR  1.388304e-02 FNCF   0.894622 FNCN   0.820588 FSCfull   0.013693 Cref   0.117017 NoiseWeighted 4523.596884 
  0.675000   0.820229     512012 FSC   0.000838 SNR  1.678337e-03 FNCF   0.893624 FNCN   0.820495 FSCfull   0.001676 Cref   0.040933 NoiseWeighted 3622.105778 
  0.700000   0.819524     348596 FSC  -0.003899 SNR -7.768473e-03 FNCF   0.894646 FNCN   0.819049 FSCfull  -0.007829 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.725000   0.818723     217808 FSC  -0.009236 SNR -1.830228e-02 FNCF   0.893341 FNCN   0.820796 FSCfull  -0.018643 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.750000   0.820472     135048 FSC   0.002487 SNR  4.985434e-03 FNCF   0.891864 FNCN   0.822416 FSCfull   0.004961 Cref   0.070432 NoiseWeighted   0.000000 
  0.775000   0.825089      77288 FSC   0.034817 SNR  7.214486e-02 FNCF   0.895766 FNCN   0.818517 FSCfull   0.067290 Cref   0.259404 NoiseWeighted   0.000000 
  0.800000   0.815167      38120 FSC  -0.032256 SNR -6.249550e-02 FNCF   0.898301 FNCN   0.823939 FSCfull  -0.066662 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.825000   0.816419      13488 FSC  -0.024276 SNR -4.740110e-02 FNCF   0.894416 FNCN   0.824161 FSCfull  -0.049760 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.850000   0.814605       1760 FSC  -0.035796 SNR -6.911783e-02 FNCF   0.894095 FNCN   0.806454 FSCfull  -0.074250 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000

R=0.675000までNoiseweightedが出力されている。

Outdata-d-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCF

Outdata-d-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCN

Outdata-d-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNC

Outdata-d-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSC

Outdata-d-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
SNR

Outdata-d-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSCfull

Outdata-d-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
Cref

Outdata-d-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
NoiseWeighted

Outdata1-d-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNC, FNCF, FNCNの比較

Outdata1-d-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
NoiseWeighted(R=0.375000まで表示)

グラフでは最初の1点を除いていて表示している。

このようにFNCがFNCF, FNCNの間にある場合はSNR, FSC, FSCfullの推定値が正となり、Cref, NoiseWeightの値を実数として求めることができる。

-FSCと-mask, -maskBack ファイルを指定して実行2

上記の例では、maskファイルの作成にてローパスフィルタを掛けるときにhalf value point=0.0125(80Å)とかなり粗めにしていたために、ほとんど楕円に近い画像となっていました。
次はhalf value point=0.05(20Å)としてmaskファイルを用意します。
-maskのファイル: このファイルはチュートリアル一覧#mrcImageにて作成できます。

Makefile内の設定

MASK_VALUE=0.05

Input-Mask1-P.png
xy平面

Input1-Mask1-P.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1 (114, 141, 82)
0.00774205
0.0876476

2.13983e-05


-maskBack: 同じファイルを使用します。

NoiseWeighted=-100, -FSCfull, -Cref
FNCF 0.914907 FNCN 0.819953
  0.000000   0.991796          1 FSC   9.512511 SNR -2.234948e+00 FNCF   0.982818 FNCN   0.771068 FSCfull   1.809750 Cref   1.345270 NoiseWeighted   1.345270 
  0.003906   0.982392         18 FSC   5.913521 SNR -2.407040e+00 FNCF   0.979065 FNCN   0.796796 FSCfull   1.710712 Cref   1.307942 NoiseWeighted   1.308441 
  0.007812   0.963411         62 FSC   3.088481 SNR -2.957634e+00 FNCF   0.971746 FNCN   0.760178 FSCfull   1.510821 Cref   1.229154 NoiseWeighted   1.231031 
  0.011719   0.934883         98 FSC   1.532837 SNR -5.753490e+00 FNCF   0.963111 FNCN   0.803158 FSCfull   1.210372 Cref   1.100169 NoiseWeighted   1.103953 
  0.015625   0.902410        210 FSC   0.767399 SNR  6.598402e+00 FNCF   0.955381 FNCN   0.827784 FSCfull   0.868393 Cref   0.931876 NoiseWeighted   0.937581 
  0.019531   0.864067        350 FSC   0.302572 SNR  8.676784e-01 FNCF   0.940646 FNCN   0.801457 FSCfull   0.464576 Cref   0.681598 NoiseWeighted   0.688129 
  0.023438   0.841587        450 FSC   0.128559 SNR  2.950497e-01 FNCF   0.929146 FNCN   0.807370 FSCfull   0.227829 Cref   0.477314 NoiseWeighted   0.483914 
  0.027344   0.856990        602 FSC   0.242277 SNR  6.394883e-01 FNCF   0.922377 FNCN   0.819179 FSCfull   0.390054 Cref   0.624543 NoiseWeighted   0.636326 
  0.031250   0.887424        762 FSC   0.551068 SNR  2.455017e+00 FNCF   0.922938 FNCN   0.811850 FSCfull   0.710566 Cref   0.842951 NoiseWeighted   0.863784 
  0.035156   0.887318       1142 FSC   0.549727 SNR  2.441751e+00 FNCF   0.924502 FNCN   0.804822 FSCfull   0.709450 Cref   0.842289 NoiseWeighted   0.868721 
  0.039062   0.879608       1250 FSC   0.457992 SNR  1.689984e+00 FNCF   0.927185 FNCN   0.798498 FSCfull   0.628251 Cref   0.792623 NoiseWeighted   0.823443 
  0.042969   0.874892       1458 FSC   0.407043 SNR  1.372928e+00 FNCF   0.927562 FNCN   0.809349 FSCfull   0.578580 Cref   0.760644 NoiseWeighted   0.796577 
  0.046875   0.874435       1814 FSC   0.402297 SNR  1.346145e+00 FNCF   0.920495 FNCN   0.820928 FSCfull   0.573769 Cref   0.757475 NoiseWeighted   0.800249 
  0.050781   0.877405       2178 FSC   0.433740 SNR  1.531945e+00 FNCF   0.907902 FNCN   0.804488 FSCfull   0.605047 Cref   0.777848 NoiseWeighted   0.829646 
  0.054688   0.875931       2498 FSC   0.417965 SNR  1.436221e+00 FNCF   0.903627 FNCN   0.813420 FSCfull   0.589528 Cref   0.767807 NoiseWeighted   0.827416 
  0.058594   0.876247       2622 FSC   0.421315 SNR  1.456114e+00 FNCF   0.912572 FNCN   0.826763 FSCfull   0.592853 Cref   0.769969 NoiseWeighted   0.838975 
  0.062500   0.884193       3338 FSC   0.511185 SNR  2.091527e+00 FNCF   0.916913 FNCN   0.821846 FSCfull   0.676535 Cref   0.822518 NoiseWeighted   0.906895 
  0.066406   0.890079       3722 FSC   0.585445 SNR  2.824450e+00 FNCF   0.917732 FNCN   0.820012 FSCfull   0.738524 Cref   0.859374 NoiseWeighted   0.959536 
  0.070312   0.888096       4170 FSC   0.559622 SNR  2.541557e+00 FNCF   0.918467 FNCN   0.831005 FSCfull   0.717638 Cref   0.847135 NoiseWeighted   0.958583 
  0.074219   0.881947       4358 FSC   0.484656 SNR  1.880902e+00 FNCF   0.920695 FNCN   0.829698 FSCfull   0.652886 Cref   0.808014 NoiseWeighted   0.927312 

-中略-

  0.644531   0.822764     109556 FSC   0.015021 SNR  3.049937e-02 FNCF   0.914710 FNCN   0.819465 FSCfull   0.029597 Cref   0.172037 NoiseWeighted 5571.763528 
  0.648438   0.820426     104768 FSC   0.002494 SNR  5.000113e-03 FNCF   0.916695 FNCN   0.818935 FSCfull   0.004975 Cref   0.070535 NoiseWeighted 2591.879420 
  0.652344   0.820764     101724 FSC   0.004285 SNR  8.606361e-03 FNCF   0.915339 FNCN   0.815352 FSCfull   0.008533 Cref   0.092374 NoiseWeighted 3854.118436 
  0.656250   0.821992      98396 FSC   0.010851 SNR  2.194065e-02 FNCF   0.914227 FNCN   0.817587 FSCfull   0.021470 Cref   0.146525 NoiseWeighted 6946.843637 
  0.660156   0.820556      94632 FSC   0.003182 SNR  6.384020e-03 FNCF   0.912940 FNCN   0.820474 FSCfull   0.006344 Cref   0.079646 NoiseWeighted 4294.096180 
  0.664062   0.819228      90908 FSC  -0.003806 SNR -7.583799e-03 FNCF   0.912924 FNCN   0.819343 FSCfull  -0.007642 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.667969   0.819197      86684 FSC  -0.003967 SNR -7.901843e-03 FNCF   0.914583 FNCN   0.817105 FSCfull  -0.007965 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.671875   0.820568      82776 FSC   0.003245 SNR  6.510316e-03 FNCF   0.915174 FNCN   0.819274 FSCfull   0.006468 Cref   0.080425 NoiseWeighted   0.000000 
  0.675781   0.820683      80372 FSC   0.003858 SNR  7.746611e-03 FNCF   0.913751 FNCN   0.818000 FSCfull   0.007687 Cref   0.087676 NoiseWeighted   0.000000 
  0.679688   0.821076      75108 FSC   0.005946 SNR  1.196247e-02 FNCF   0.913970 FNCN   0.815727 FSCfull   0.011821 Cref   0.108725 NoiseWeighted   0.000000 

-中略-

  0.828125   0.811470       1320 FSC  -0.042763 SNR -8.201861e-02 FNCF   0.917130 FNCN   0.825454 FSCfull  -0.089347 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.832031   0.812934       1352 FSC  -0.035646 SNR -6.883734e-02 FNCF   0.920492 FNCN   0.823277 FSCfull  -0.073926 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.835938   0.823354       1152 FSC   0.018231 SNR  3.713860e-02 FNCF   0.925875 FNCN   0.800023 FSCfull   0.035809 Cref   0.189232 NoiseWeighted   0.000000 
  0.839844   0.817772        800 FSC  -0.011359 SNR -2.246248e-02 FNCF   0.931022 FNCN   0.818680 FSCfull  -0.022979 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.843750   0.824257        288 FSC   0.023185 SNR  4.747129e-02 FNCF   0.926149 FNCN   0.862458 FSCfull   0.045320 Cref   0.212885 NoiseWeighted   0.000000 
  0.847656   0.821916        392 FSC   0.010442 SNR  2.110497e-02 FNCF   0.912921 FNCN   0.826884 FSCfull   0.020669 Cref   0.143766 NoiseWeighted   0.000000 
  0.851562   0.765112        200 FSC  -0.224072 SNR -3.661096e-01 FNCF   0.904654 FNCN   0.721120 FSCfull  -0.577560 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.855469   0.812369         72 FSC  -0.038404 SNR -7.396801e-02 FNCF   0.878913 FNCN   0.789634 FSCfull  -0.079876 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.859375   0.777638          8 FSC  -0.182221 SNR -3.082684e-01 FNCF   0.792984 FNCN   0.764045 FSCfull  -0.445647 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.863281   0.000000          0 FSC  -0.811947 SNR -8.962150e-01 FNCF   0.000000 FNCN   0.000000 FSCfull  -8.635308 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000

刻み幅dがデフォルトの場合でも、R=0.660156のデータまでを見えるようになりました。

Outdata2-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCF

Outdata2-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCN

Outdata2-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNC

Outdata2-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSC

Outdata2-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
SNR

Outdata2-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSCfull

Outdata2-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
Cref

Outdata2-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
NoiseWeighted

グラフでは最初の4点と最後の1点を除いていて表示している。

SN比毎のデータ比較

下記のようにSN比が異なる入力ファイルについての結果を比較します。
チュートリアル一覧#mrcImageを利用したコマンドでも実行できます。

Makefileの設定

#### Definition ####
# Path of Input File
INPUT_PATH=${EOS_HOME}/tutorial/SampleData/1VOM.mrc
#INPUT_PATH=${EOS_HOME}/tutorial/SampleData/1VOM-N.mrc

### SN or NS for Input file
INI_SN=0.3 1 3 10 100


それぞれの入力画像(パディング前)

SN比

SN=0.3

SN=1

SN=3

SN=10

SN=100

xy平面

Input-SN0.3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input-SN1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input-SN3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input-SN10-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input-SN100-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

yz平面

Input1-SN0.3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input1-SN1-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input1-SN3-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input1-SN10-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

Input1-SN100-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-7489.39 (57, 54, 75)

8066.02 (17, 29, 46)
68.7388
1679.17

2.09896

-2225.59 (26, 40, 83)

4567.91 (28, 50, 50)
72.5953
578.119

0.722649

-784.63 (44, 6, 70)

3724.44 (41, 60, 31)
72.3035
337.846

0.422308

-246.726 (17, 25, 16)

3406.43 (20, 24, 29)
72.1722
299.081

0.373851

-22.8638 (79, 41, 2)

3399.86 (23, 55, 41)
72.133
294.848

0.368559


出力ファイルの比較


Outdata3-FNCF-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCF

Outdata3-FNCN-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNCN

Outdata3-FNC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FNC

Outdata3-FSC-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSC

Outdata3-SNR-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
SNR

Outdata3-FSCfull-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
FSCfull

Outdata3-Cref-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
Cref

Outdata3-NoiseWeighted-mrcImageFourierNeighborCorrelation.png
NoiseWeighted

Crefが最初に0になるデータ付近の出力結果

SN=0.3

-前略-

  0.125000   0.830285      12606 FSC   0.056542 SNR  1.198620e-01 FNCF   0.905793 FNCN   0.820589 FSCfull   0.107033 Cref   0.327159 NoiseWeighted   0.483509 
  0.128906   0.835033      13802 FSC   0.085415 SNR  1.867837e-01 FNCF   0.907524 FNCN   0.814605 FSCfull   0.157386 Cref   0.396720 NoiseWeighted   0.601033 
  0.132812   0.831848      14754 FSC   0.065877 SNR  1.410450e-01 FNCF   0.913083 FNCN   0.824672 FSCfull   0.123610 Cref   0.351583 NoiseWeighted   0.546440 
  0.136719   0.831254      15194 FSC   0.062310 SNR  1.329021e-01 FNCF   0.916913 FNCN   0.827674 FSCfull   0.117311 Cref   0.342507 NoiseWeighted   0.546532 
  0.140625   0.826966      16454 FSC   0.037254 SNR  7.739025e-02 FNCF   0.915416 FNCN   0.821369 FSCfull   0.071831 Cref   0.268013 NoiseWeighted   0.439405 
  0.144531   0.820016      17154 FSC  -0.000933 SNR -1.863673e-03 FNCF   0.913586 FNCN   0.824382 FSCfull  -0.001867 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.148438   0.821502      18266 FSC   0.006992 SNR  1.408213e-02 FNCF   0.913122 FNCN   0.829752 FSCfull   0.013887 Cref   0.117841 NoiseWeighted   0.000000 
  0.152344   0.822031      18750 FSC   0.009847 SNR  1.989009e-02 FNCF   0.911698 FNCN   0.824485 FSCfull   0.019502 Cref   0.139650 NoiseWeighted   0.000000 
  0.156250   0.826508      20234 FSC   0.034651 SNR  7.179050e-02 FNCF   0.913992 FNCN   0.817147 FSCfull   0.066982 Cref   0.258808 NoiseWeighted   0.000000 
  0.160156   0.829598      21450 FSC   0.052491 SNR  1.107982e-01 FNCF   0.915240 FNCN   0.817627 FSCfull   0.099746 Cref   0.315827 NoiseWeighted   0.000000 

-後略-


SN=1

-前略-

  0.625000   0.821968     125484 FSC   0.008655 SNR  1.746116e-02 FNCF   0.915959 FNCN   0.820807 FSCfull   0.017161 Cref   0.131002 NoiseWeighted 2282.625528 
  0.628906   0.822126     123668 FSC   0.009510 SNR  1.920304e-02 FNCF   0.915730 FNCN   0.818373 FSCfull   0.018841 Cref   0.137263 NoiseWeighted 2703.284812 
  0.632812   0.822135     118752 FSC   0.009556 SNR  1.929710e-02 FNCF   0.916420 FNCN   0.817706 FSCfull   0.018932 Cref   0.137593 NoiseWeighted 3065.097206 
  0.636719   0.822268     115748 FSC   0.010276 SNR  2.076605e-02 FNCF   0.916453 FNCN   0.821218 FSCfull   0.020344 Cref   0.142631 NoiseWeighted 3596.708750 
  0.640625   0.821682     111732 FSC   0.007114 SNR  1.432974e-02 FNCF   0.916046 FNCN   0.819347 FSCfull   0.014127 Cref   0.118858 NoiseWeighted 3395.432939 
  0.644531   0.819634     109556 FSC  -0.003778 SNR -7.527926e-03 FNCF   0.915582 FNCN   0.818883 FSCfull  -0.007585 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.648438   0.820647     104768 FSC   0.001581 SNR  3.167601e-03 FNCF   0.915830 FNCN   0.819727 FSCfull   0.003158 Cref   0.056193 NoiseWeighted   0.000000 
  0.652344   0.820390     101724 FSC   0.000214 SNR  4.288445e-04 FNCF   0.914391 FNCN   0.820488 FSCfull   0.000429 Cref   0.020704 NoiseWeighted   0.000000 
  0.656250   0.821091      98396 FSC   0.003947 SNR  7.925782e-03 FNCF   0.913665 FNCN   0.822480 FSCfull   0.007863 Cref   0.088676 NoiseWeighted   0.000000 
  0.660156   0.821039      94632 FSC   0.003669 SNR  7.364323e-03 FNCF   0.913751 FNCN   0.819652 FSCfull   0.007310 Cref   0.085501 NoiseWeighted   0.000000 

-後略-


SN=3

-前略-

  0.765625   0.821757      15104 FSC   0.009515 SNR  1.921255e-02 FNCF   0.922342 FNCN   0.820350 FSCfull   0.018850 Cref   0.137297 NoiseWeighted 317721.373090 
  0.769531   0.822221      13472 FSC   0.011996 SNR  2.428272e-02 FNCF   0.922754 FNCN   0.817671 FSCfull   0.023707 Cref   0.153971 NoiseWeighted 413936.197088 
  0.773438   0.821217      12312 FSC   0.006642 SNR  1.337191e-02 FNCF   0.918091 FNCN   0.817507 FSCfull   0.013195 Cref   0.114871 NoiseWeighted 359043.192167 
  0.777344   0.827075      11528 FSC   0.038716 SNR  8.055134e-02 FNCF   0.915129 FNCN   0.819965 FSCfull   0.074547 Cref   0.273032 NoiseWeighted 992931.202359 
  0.781250   0.824370      10056 FSC   0.023654 SNR  4.845502e-02 FNCF   0.915417 FNCN   0.814779 FSCfull   0.046216 Cref   0.214978 NoiseWeighted 910337.354456 
  0.785156   0.818701       8936 FSC  -0.006536 SNR -1.298769e-02 FNCF   0.913984 FNCN   0.830604 FSCfull  -0.013159 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.789062   0.819627       8592 FSC  -0.001726 SNR -3.446727e-03 FNCF   0.906964 FNCN   0.823014 FSCfull  -0.003459 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.792969   0.820210       7208 FSC   0.001325 SNR  2.654493e-03 FNCF   0.903543 FNCN   0.818116 FSCfull   0.002647 Cref   0.051454 NoiseWeighted   0.000000 
  0.796875   0.815899       6296 FSC  -0.020810 SNR -4.077152e-02 FNCF   0.908125 FNCN   0.817338 FSCfull  -0.042504 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.800781   0.823119       5544 FSC   0.016835 SNR  3.424612e-02 FNCF   0.914006 FNCN   0.817025 FSCfull   0.033112 Cref   0.181967 NoiseWeighted   0.000000 

-後略-


SN=10

-前略-

  0.828125   0.844910       1320 FSC   0.149342 SNR  3.511221e-01 FNCF   0.912374 FNCN   0.803915 FSCfull   0.259874 Cref   0.509779 NoiseWeighted 14231907.761588 
  0.832031   0.837728       1352 FSC   0.101517 SNR  2.259737e-01 FNCF   0.902768 FNCN   0.811758 FSCfull   0.184322 Cref   0.429327 NoiseWeighted 14095470.163758 
  0.835938   0.836067       1152 FSC   0.091023 SNR  2.002756e-01 FNCF   0.913173 FNCN   0.800848 FSCfull   0.166858 Cref   0.408483 NoiseWeighted 15783593.638134 
  0.839844   0.831098        800 FSC   0.060772 SNR  1.294080e-01 FNCF   0.910829 FNCN   0.797062 FSCfull   0.114580 Cref   0.338497 NoiseWeighted 15404941.069368 
  0.843750   0.829879        288 FSC   0.053609 SNR  1.132924e-01 FNCF   0.886515 FNCN   0.824411 FSCfull   0.101763 Cref   0.319004 NoiseWeighted 17112149.322272 
  0.847656   0.852127        392 FSC   0.201767 SNR  5.055348e-01 FNCF   0.880805 FNCN   0.817034 FSCfull   0.335784 Cref   0.579469 NoiseWeighted 36666886.878487 
  0.851562   0.819553        200 FSC  -0.003419 SNR -6.815128e-03 FNCF   0.916154 FNCN   0.829615 FSCfull  -0.006862 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.855469   0.816624         72 FSC  -0.018488 SNR -3.630448e-02 FNCF   0.925319 FNCN   0.796666 FSCfull  -0.037672 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 
  0.859375   0.917138          8 FSC   1.040065 SNR -5.191875e+01 FNCF   0.853931 FNCN   0.697182 FSCfull   1.019639 Cref   1.009772 NoiseWeighted   0.000000 
  0.863281   0.000000          0 FSC  -0.811813 SNR -8.961335e-01 FNCF   0.000000 FNCN   0.000000 FSCfull  -8.627743 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 

-後略-


SN=100

-前略-

  0.828125   0.901847       1320 FSC   0.756211 SNR  6.203817e+00 FNCF   0.919589 FNCN   0.822237 FSCfull   0.861185 Cref   0.928000 NoiseWeighted 25907738.220224 
  0.832031   0.903973       1352 FSC   0.791551 SNR  7.594690e+00 FNCF   0.914005 FNCN   0.814800 FSCfull   0.883649 Cref   0.940026 NoiseWeighted 30862499.462702 
  0.835938   0.908114       1152 FSC   0.864634 SNR  1.277477e+01 FNCF   0.893985 FNCN   0.804227 FSCfull   0.927403 Cref   0.963018 NoiseWeighted 37210603.792030 
  0.839844   0.915035        800 FSC   1.001069 SNR -1.872989e+03 FNCF   0.903230 FNCN   0.814543 FSCfull   1.000534 Cref   1.000267 NoiseWeighted 45521947.697260 
  0.843750   0.918614        288 FSC   1.079756 SNR -2.707648e+01 FNCF   0.924216 FNCN   0.803353 FSCfull   1.038349 Cref   1.018994 NoiseWeighted 54661348.443263 
  0.847656   0.914517        392 FSC   0.990177 SNR  2.016063e+02 FNCF   0.929501 FNCN   0.780177 FSCfull   0.995064 Cref   0.997529 NoiseWeighted 63120364.126596 
  0.851562   0.898429        200 FSC   0.702229 SNR  4.716581e+00 FNCF   0.931254 FNCN   0.802611 FSCfull   0.825070 Cref   0.908334 NoiseWeighted 67850948.494955 
  0.855469   0.877008         72 FSC   0.427280 SNR  1.492108e+00 FNCF   0.926600 FNCN   0.805094 FSCfull   0.598733 Cref   0.773779 NoiseWeighted 68284951.426467 
  0.859375   0.899341          8 FSC   0.716309 SNR  5.049935e+00 FNCF   0.841373 FNCN   0.745881 FSCfull   0.834709 Cref   0.913624 NoiseWeighted 95324620.998659 
  0.863281   0.000000          0 FSC  -0.812524 SNR -8.965661e-01 FNCF   0.000000 FNCN   0.000000 FSCfull  -8.668008 Cref   0.000000 NoiseWeighted   0.000000 

-後略-


データやグラフによりSNが良くなるほど、分解能が良くなることが分かります。

参考文献

Ab initio resolution measurement for single particle structures (FNC, FNCF, FNCNを求めてSNR、FSCを推定する)
Single particle electron microscopy (FSCからCref, NoiseWeightedを求める)


「https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php?title=mrcImageFourierNeighborCorrelation&oldid=12026」から取得