「mrcImage3DPad」の版間の差分
(→-M の詳細) |
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| 行117: | 行117: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
| − | <td>フィラメント用(半径を軸から算出する)</td> | + | <td>フィラメント用(半径を軸から算出する: ｚ軸方向にはずれてしまう)</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
| − | <td>粒子用( | + | <td>粒子用(半径を中心から算出する：球)</td> |
</tr> | </tr> | ||
| − | </table> | + | <tr> |
| − | + | <td>2</td> | |
| + | <td>粒子用(半径を中心から算出する：楕円)</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>3</td> | ||
| + | <td>粒子用(半径を中心から算出する：直方体)</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
2015年8月24日 (月) 00:04時点における最新版
mrcImage3DPadとはフィラメントまたは粒子のmrcImage(3D)に対してパディングを行うEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -r | 選択 | 境界の半径(-M 参照) | Nx |
| -w | 選択 | スロープの幅(m=1で使用) | 1 |
| -v | 選択 | パディング値 | 0 |
| -Nx | 選択 | 出力ファイルのNx | 入力ファイルのNx |
| -Ny | 選択 | 出力ファイルのNy | 入力ファイルのNy |
| -Nz | 選択 | 出力ファイルのNz | 入力ファイルのNz |
| -Floating | 選択 | フローティング | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | パディング値の算出方法を設定 | 0 |
| -M | 選択 | -r の算出方法を設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 平均値でパディングする |
| 1 | 余弦関数を掛ける |
-M の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | フィラメント用(半径を軸から算出する: ｚ軸方向にはずれてしまう) |
| 1 | 粒子用(半径を中心から算出する：球) |
| 2 | 粒子用(半径を中心から算出する：楕円) |
| 3 | 粒子用(半径を中心から算出する：直方体) |
実行例
入力ファイルの画像
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最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
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最小 最大 |
-2255.49 (1, 42, 21) 4032.8 (49, 53, 30) |
オプション必須項目のみの場合
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 34
|
|
最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -Nx, -Ny, -Nz
Nx=50, Ny=50, Nz=75で実行
Tailer: 0 Program Start N: 50 50 75 TailerNum 0 r: 34
|
|
最小 最大 |
-0.295151 (23, 12, 71) 1.52145 (38, 32, 47) |
オプション -r
r=20で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 20
|
|
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -v
v=0.1で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0
|
|
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -Floating
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 20 Floating avg:-0.000912
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最小 最大 |
-0.294238 (32, 21, 71) 1.52236 (47, 41, 47) |
オプション -m
m=1で実行
その他のオプションなし
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: -0.000245498 av: -0.000245498
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最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
w=2で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: -0.000162708 av: -0.000162708
|
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最小 最大 |
-0.255166 (37, 36, 69) 1.06472 (47, 41, 47) |
オプション -M
M=1, r=30で実行
Tailer: 0 Program Start N: 99 99 99 99 99 99
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最小 最大 |
-1991.84 (41, 38, 29) 4032.8 (49, 53, 30) |
