「pdbMove」の版間の差分
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[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode | [-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode | ||
----- Additional Usage ----- | ----- Additional Usage ----- | ||
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| + | ===------入力ファイルの詳細------=== | ||
| + | <div>[[画像:121p.pdb-pdbMove.png]]</div> | ||
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| + | ===------オプション必須項目のみの場合の出力結果------=== | ||
| + | <div>[[画像:121p-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない</div> | ||
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| + | ===------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------=== | ||
| + | ====移動の幅をすべて1に設定==== | ||
| + | [[画像:121p.1xyz-pdbMove.png]]<br> | ||
| + | <br> | ||
| + | ====移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定==== | ||
| + | [[画像:121p.-xyz-pdbMove.png]]<br> | ||
2013年10月16日 (水) 05:50時点における版
pdbMoveとはPDBファイルの原子モデルを平行移動するためのEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル:ＰＤＢ | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル：ＰＤＢ | NULL |
| -x | 選択 | x軸方向の移動量 | 0 |
| -y | 選択 | y軸方向の移動量 | 0 |
| -z | 選択 | z軸方向の移動量 | 0 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|
実行例
ヘルプ実行
$ pdbMove -h
Usage: /Applications/Eos.app/Eos/bin/X86MAC64/pdbMove
Options:
[-i[nput] In (NULL )] :Essential :InputDataFile
[-o[utput] Out (NULL )] :Essential :OutputDataFile
[-x X (0.0 )] :Optional :Move X[A]
[-y Y (0.0 )] :Optional :Move Y[A]
[-z Z (0.0 )] :Optional :Move Z[A]
[-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile
[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode
Additional Usage -----
------入力ファイルの詳細------
------オプション必須項目のみの場合の出力結果------
オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない
------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------
移動の幅をすべて1に設定
移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定
