「mrcImageCircumferentialProjection」の版間の差分

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<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
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<td>Out Put Added    Density (dataSum = dataSum / nang *(2*PI*r))</td>  
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<td>加重密度を出力 (dataSum = dataSum / nang *(2*PI*r))</td>  
 
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== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
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===入力ファイルの画像===
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<td>[[画像:Input-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td>
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<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
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60.6 (44, 46, 0)<br>
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26.9463<br>
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22.1197<br>
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</td>
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===オプション必須項目のみの場合===
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<div>上記の入力ファイルの場合、デフォルトの範囲(rmax=200)では出力できない。 </div>
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===オプション　-rmin, -rmax, dr===
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====rmin=0, rmax=170, dr=10で実行====
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<td>[[画像:Outdata-rmax-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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2 (0, 9, 0)<br>
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0.421405<br>
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0.0414572<br></p>
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</td>
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====rmin=20, rmax=100, dr=5で実行====
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<td>[[画像:Outdata-rminrmaxdr-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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<td><p align="left">0 (12, 0, 0)<br>
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2 (0, 9, 0)<br>
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0.624596<br>
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===オプション　-dang===
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====dang=1, rmax=170で実行====
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<td>[[画像:Outdata-dang-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td>
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<td><p align="left">0 (8, 0, 0)<br>
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2 (0, 9, 0)<br>
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0.4202<br>
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0.581967<br>
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</td>
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===オプション　-zmin, -zmax, dz===
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====zmin=100, zmax=500, dz=5, rmax=170で実行====
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<td>[[画像:Outdata-zminzmaxdz-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
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最大<br>
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平均値<br>
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標準偏差<br>
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標準誤差<br></p>
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</td>
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<td><p align="left">0 (16, 0, 0)<br>
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2 (1, 58, 0)<br>
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0.78124<br>
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0.533959<br>
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0.0139839<br></p>
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</td>
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</tr>
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===オプション　-threshold===
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====threshold=1.5, rmax=170で実行====
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-threshold-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
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<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
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平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
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</td>
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<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
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2 (0, 9, 0)<br>
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0.0838489<br>
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0.28814<br>
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0.0204772<br></p>
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</td>
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</tr>
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===オプション　-m===
 +
====m=1, rmax=170で実行====
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<table>
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-m1-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
742.872 (9, 5, 0)<br>
 +
104.954<br>
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177.669<br>
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12.6264<br></p>
 +
</td>
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</tr>
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====m=2, rmax=170で実行====
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<table>
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<tr>
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<td>[[画像:Outdata-m2-mrcImageCircumferentialProjection.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (8, 0, 0)<br>
 +
1.94595 (0, 9, 0)<br>
 +
0.410016<br>
 +
0.567588<br>
 +
0.0403367<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
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</table>

2013年11月19日 (火) 07:13時点における版

mrcImageCircumferentialProjectionとは３D画像から円筒座標系に変換し、特定範囲のみを表示する。Eosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-dang 選択 角度の加算値: [deree] 10
-zmin 選択 Zの最小値: [A] 0
-zmax 選択 Zの最大値: [A] 100
-dz 選択 Zの加算値: [A] 10
-rmin 選択 半径の最小値: [A] 0
-rmax 選択 半径の最大値: [A] 200
-dr 選択 半径の加算値: [A] 10
-threshold 選択 閾値を設定(平均密度が閾値以上) 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0 平均密度を出力 (dataSum = dataSum / nang)
1 加重密度を出力 (dataSum = dataSum / nang *(2*PI*r))
2 閾値以上の平均密度を出力 (dataSum = dataSum / [nang number more than threshold value] *(2*PI*r))


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

60.6 (44, 46, 0)
26.9463
22.1197

0.264381

オプション必須項目のみの場合

上記の入力ファイルの場合、デフォルトの範囲(rmax=200)では出力できない。

オプション　-rmin, -rmax, dr

rmin=0, rmax=170, dr=10で実行

Outdata-rmax-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (8, 0, 0)

2 (0, 9, 0)
0.421405
0.583354

0.0414572

rmin=20, rmax=100, dr=5で実行

Outdata-rminrmaxdr-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (12, 0, 0)

2 (0, 9, 0)
0.624596
0.598075

0.0437356

オプション　-dang

dang=1, rmax=170で実行

Outdata-dang-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (8, 0, 0)

2 (0, 9, 0)
0.4202
0.581967

0.0413586

オプション　-zmin, -zmax, dz

zmin=100, zmax=500, dz=5, rmax=170で実行

Outdata-zminzmaxdz-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (16, 0, 0)

2 (1, 58, 0)
0.78124
0.533959

0.0139839

オプション　-threshold

threshold=1.5, rmax=170で実行

Outdata-threshold-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2 (0, 9, 0)
0.0838489
0.28814

0.0204772

オプション　-m

m=1, rmax=170で実行

Outdata-m1-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

742.872 (9, 5, 0)
104.954
177.669

12.6264

m=2, rmax=170で実行

Outdata-m2-mrcImageCircumferentialProjection.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (8, 0, 0)

1.94595 (0, 9, 0)
0.410016
0.567588

0.0403367

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