「mrcImagePrint」の版間の差分
提供: Eospedia
行86: | 行86: | ||
<td>-C</td> | <td>-C</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td>コンターレベル</td> | + | <td>可変入力: コンターレベル</td> |
− | <td>1.0</td> | + | <td>1.0 ...</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
行276: | 行276: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>16</td> | <td>16</td> | ||
− | <td> | + | <td>目盛りの表示</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>32</td> | <td>32</td> | ||
− | <td> | + | <td>中心点の表示</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
行517: | 行517: | ||
</table> | </table> | ||
− | ===オプション -=== | + | ===オプション -m=== |
− | ====, S=2で実行==== | + | ====m=1, S=2で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <th>[[画像:Outdata--mrcImagePrint.png]]</th> | + | <th>[[画像:Outdata-m1-mrcImagePrint.png]]</th> |
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=17, S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m17-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m2-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m6-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m10-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m34-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>39/69ページ</th> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
+ | |||
+ | ====m=, S=2で実行==== | ||
+ | <table> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <th>[[画像:Outdata-m-mrcImagePrint.png]]</th> | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> |
2013年11月27日 (水) 05:42時点における版
目次
- 1 オプション一覧
- 2 実行例
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 選択 | 出力ファイル: psファイル | stdout |
-H | 選択 | High Threshold | 0.0 |
-L | 選択 | Low Threshold | 1.0 |
-Section | 選択 | [z|x|y]Section | z |
-x | 選択 | x section:(xMin, xMax) | (0, 0) |
-y | 選択 | y section:(yMin, yMax) | (0, 0) |
-z | 選択 | z section:(zMin, zMax) | (0, 0) |
-S | 選択 | Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel | 1.0 |
-AS | 選択 | Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) | 1.0 |
-E | 選択 | Enlargement(image center is center) | 1.0 |
-center | 選択 | Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) | (0.0, 0.0) |
-C | 選択 | 可変入力: コンターレベル | 1.0 ... |
-I | 選択 | 反転 | |
-A | 選択 | HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD | |
-AC | 選択 | Auto Contour(thresHigh <-> mean) | 10 |
-PC | 選択 | Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 | 10 |
-AC2 | 選択 | Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) | 10 |
-Y | 選択 | y軸の拡大率 | 1 |
-RGB | 選択 | Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) | (0, 0, 0) |
-RGBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-HSB | 選択 | Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) | (0, 0, 0) |
-HSBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourRGB | 選択 | Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) | (0, 0, 0) |
-LineColourRGBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourHSB | 選択 | Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) | (0, 0, 0) |
-LineColourHSBGradient | 選択 | Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) | (0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineChange | 選択 | Contour Color Change | 0.1 |
-LineWidthStart | 選択 | Contour Line Width Start | 0.1 |
-LineWidthStep | 選択 | Contour Line Width Step | 0.05 |
-ReverseOrder | 選択 | ページを逆順にする | |
-Untwist | 選択 | Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 | 0.0 |
-UpsideDown | 選択 | Upside Down | |
-Centre | 選択 | 画像の中心をページの中心に合わせる | |
-CircleRadius | 選択 | Radius of circles in the case of imageCircles | 0.5 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 49 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-C option is stronger than -AC and -PC -PC option is stronger than -AC -AC: (i+1)*(max-maen) /(AC+1) + mean -PC: (i )*(max+mean)/2)/AC + (max+mean)/2 -AS option is stronger than -S option The default value of -AS option is ignored. The default value of -S option is used. Both options are applied to y-axis.
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | ImageDensity |
2 | Contour(DiffrentLineWidth) |
4 | Contour(SameLineWidth) |
8 | BlackCircles |
16 | 目盛りの表示 |
32 | 中心点の表示 |
16777216 | Amplitude by AsciiFile |
33554432 | Log of Amplitude by AsciiFile |
67108864 | Phase by AsciiFile |
実行例
入力ファイルの画像
![]() |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 5 (34, 41, 36) |
オプション必須項目のみの場合
![]() |
---|
39/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -S
S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -H
H=1, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -L
L=1.5, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -Section
Section=x, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -x, -y, -z
x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行
![]() |
---|
11/21ページ |
オプション -AS
AS=1で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -center
center=(30, 30), S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -I
I, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -A
A, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -Y
Y=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
オプション -ReverseOrder
ReverseOrder, S=2で実行
![]() |
---|
31/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -untwist
untwist=0.1, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -UpsideDown
UpsideDown, S=2で実行
![]() |
---|
31/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -Centre
Centre, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
![]() |
サムネイル |
オプション -m
m=1, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=17, S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行
![]() |
---|
39/69ページ |
m=, S=2で実行
ファイル:Outdata-m-mrcImagePrint.png |
---|
39/69ページ |