「mrcImageMakeSphere」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル: | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]](テンプレート)</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
<td>中心半径(ピクセル): モード１でのみ使用</td> | <td>中心半径(ピクセル): モード１でのみ使用</td> | ||
| − | <td></td> | + | <td>0</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
| 行97: | 行97: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===入力ファイルの画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 2 (35, 35, 5)<br> | ||
| + | 0.384947<br> | ||
| + | 0.605556<br> | ||
| + | 0.00086508<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | ====or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (31, 0, 0)<br> | ||
| + | 310 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 21.7371<br> | ||
| + | 67.4353<br> | ||
| + | 0.806006<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -C=== | ||
| + | ====C=(35, 35, 50), or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-C-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 610 (35, 50, 0)<br> | ||
| + | 161.544<br> | ||
| + | 215.939<br> | ||
| + | 2.58096<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -ir=== | ||
| + | ====ir=15, C=(35, 35, 50), or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-ir-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 510 (31, 34, 0)<br> | ||
| + | 141.549<br> | ||
| + | 185.58<br> | ||
| + | 2.21811<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -v=== | ||
| + | ====v=20, C=(35, 35, 50), or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-v-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 1220 (35, 50, 0)<br> | ||
| + | 323.089<br> | ||
| + | 431.878<br> | ||
| + | 5.16193<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -m=== | ||
| + | ====m=1, C=(35, 35, 50), or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-m1-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0.0246775 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 503.861 (31, 42, 0)<br> | ||
| + | 154.591<br> | ||
| + | 170.165<br> | ||
| + | 2.03386<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -r=== | ||
| + | ====r=5, m=1, C=(35, 35, 50), or=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-m1r-mrcImageMakeSphere.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">2.86426 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 495.602 (35, 46, 0)<br> | ||
| + | 165.528<br> | ||
| + | 140.716<br> | ||
| + | 1.68187<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
2013年12月10日 (火) 01:50時点における最新版
mrcImageMakeSphereとは球/円の作成（多機能、位置の指定）を行うEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage(テンプレート) | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -C | 選択 | 球体の中心座標 (Cx, Cy, Cz) | (0, 0, 0) |
| -or | 必須 | 外半径(ピクセル) | 1 |
| -ir | 選択 | 内半径(ピクセル) | 0 |
| -r | 選択 | 中心半径(ピクセル): モード１でのみ使用 | 0 |
| -v | 選択 | 球体の値 | 10.0 |
| -Other | 選択 | Other acceptors. For FRET Calculation. | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Constant |
| 1 | Gaussian |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 2 (35, 35, 5) |
オプション必須項目のみの場合
or=30で実行
 |
最小 最大 |
0 (31, 0, 0) 310 (0, 0, 0) |
オプション -C
C=(35, 35, 50), or=30で実行
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 610 (35, 50, 0) |
オプション -ir
ir=15, C=(35, 35, 50), or=30で実行
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 510 (31, 34, 0) |
オプション -v
v=20, C=(35, 35, 50), or=30で実行
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1220 (35, 50, 0) |
オプション -m
m=1, C=(35, 35, 50), or=30で実行
 |
最小 最大 |
0.0246775 (0, 0, 0) 503.861 (31, 42, 0) |
オプション -r
r=5, m=1, C=(35, 35, 50), or=30で実行
 |
最小 最大 |
2.86426 (0, 0, 0) 495.602 (35, 46, 0) |
