「pdbCAOnly」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
(Kinoshita がページ「PdbCAOnly」を「pdbCAOnly」に移動しました)
行40: 行40:
 
==実行例==
 
==実行例==
 
===------入力ファイルの詳細------===
 
===------入力ファイルの詳細------===
[[画像:inputdata-pdbCAOnly.png]]
+
[[画像:Inputdata-pdbCAOnly.png]]
 
<br>
 
<br>
 
<br>
 
<br>
[[画像:inputdata-Info-pdbCAOnly.png]]
+
[[画像:Inputdata-Info-pdbCAOnly.png]]
  
 
===------実行結果------===
 
===------実行結果------===
 
<div>-o の画像</div>
 
<div>-o の画像</div>
[[画像:outputdata-pdbCAOnly.png]]
+
[[画像:Outputdata-pdbCAOnly.png]]
 
<br>
 
<br>
 
<br>
 
<br>
[[画像:outputdata-Info-pdbCAOnly.png]]
+
[[画像:Outputdata-Info-pdbCAOnly.png]]
  
 
<div>-oCoord のデータ</div>
 
<div>-oCoord のデータ</div>

2013年12月10日 (火) 05:05時点における版

pdbCAOnlyとはPDBからα炭素だけを抜き出すEosコマンドである。

オプション一覧

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: PDB NULL
-o 選択 出力ファイル設定: PDB NULL
-oCoord 選択 出力ファイル設定: 座標(x, y, z) NULL
-h 選択 ヘルプを表示  


実行例

------入力ファイルの詳細------

Inputdata-pdbCAOnly.png

Inputdata-Info-pdbCAOnly.png

------実行結果------

-o の画像

Outputdata-pdbCAOnly.png

Outputdata-Info-pdbCAOnly.png

-oCoord のデータ
  -5.913,   31.928,   -6.676
  -4.759,   28.930,   -4.751
  -4.531,   29.674,   -1.062
  -2.465,   27.513,    1.336
  -3.586,   27.580,    4.978
  -0.458,   26.983,    7.005
  -0.267,   26.691,   10.787
   2.893,   27.179,   12.917
   2.792,   25.223,   16.192
   5.273,   24.275,   18.922

-中略-

   8.007,   26.321,    0.697
   8.752,   22.660,    1.449
   5.506,   22.633,    3.471
   3.622,   24.164,    0.512
   5.079,   21.428,   -1.780
   3.951,   18.742,    0.732
   0.404,   20.135,    0.490
   0.711,   20.050,   -3.346
   1.520,   16.308,   -3.145
  -1.217,   15.280,   -0.638