「mrcImageModelSubfilamentsCreate」の版間の差分

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行128: 行128:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
59.7531<br>  
+
2.09707 (58, 41, 0)<br>  
−
2.23188<br>  
+
0.00306044<br>  
−
10.0142<br>  
+
0.0749793<br>  
−
0.598462<br></p>  
+
0.00108666<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
  
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
xy平面<br></p>  
−
最大<br>
+
−
平均値<br>
+
−
標準偏差<br>  
+
−
標準誤差<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
10.5248<br>  
+
yz平面<br></p>  
−
0.294771<br>
+
−
1.04365<br>
+
−
0.00146993<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
 
−
===オプション　-nx===
 
−
====nx=35で実行====
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>[[画像:Outdata-nx35-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行167: 行153:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
10.5248<br>  
+
1.98112 (31, 52, 0)<br>  
−
0.477951<br>  
+
0.00741447<br>  
−
1.3255<br>  
+
0.0893007<br>  
−
0.00265899<br></p>  
+
0.000125776<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
−
</table>
+
</table>  
  
−
===オプション　-ny===
+
 
−
====ny=19で実行====  
+
===オプション　-nx, -ny, -nz===
 +
====nx=99, ny=99, nz=99で実行====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-ny19-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
xy平面<br></p>  
−
最大<br>
+
−
平均値<br>
+
−
標準偏差<br>  
+
−
標準誤差<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
10.5248<br>  
+
yz平面<br></p>  
−
0.682039<br>
+
−
1.56<br>
+
−
0.00424737<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
 
−
===オプション　-nz===
 
−
====nz=200で実行====
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>[[画像:Outdata-nz200-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行207: 行179:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
10.5248<br>  
+
2.09707 (87, 56, 0)<br>  
−
0.294954<br>  
+
0.00445187<br>  
−
1.04288<br>  
+
0.0691579<br>  
−
0.00103863<br></p>  
+
5.70376e-05<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
  
−
===オプション　-lx===
+
 
−
====lx=2で実行====  
+
===オプション　-lx, -ly, lz===
 +
====lx=8, ly=8, lz=8で実行====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-lx2-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
<td><p align="left">最小<br>
+
xy平面<br></p>  
−
最大<br>
+
−
平均値<br>
+
−
標準偏差<br>  
+
−
標準誤差<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
−
10.4376<br>  
+
yz平面<br></p>  
−
0.320059<br>
+
−
1.0121<br>
+
−
0.0014255<br></p>  
+
 
</td>  
 
</td>  
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
 
−
===オプション　-ly===
 
−
====ly=3で実行====
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>[[画像:Outdata-ly3-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>
 
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行247: 行205:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
10.5572<br>  
+
2.02889 (41, 2, 20)<br>  
−
0.285985<br>  
+
0.00867218<br>  
−
0.985501<br>  
+
0.0969264<br>  
−
0.00138803<br></p>  
+
0.000136516<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
 +
  
 
===オプション　-position===
 
===オプション　-position===
行260: 行219:
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-position35-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行267: 行231:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
16.0514<br>  
+
2.09707 (66, 42, 0)<br>  
−
0.296075<br>  
+
0.00869178<br>  
−
1.14438<br>  
+
0.0977788<br>  
−
0.00161181<br></p>  
+
0.000137717<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行280: 行244:
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-n6-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行287: 行256:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
19.1903<br>  
+
1.98112 (31, 52, 0)<br>  
−
0.589651<br>  
+
0.0148289<br>  
−
1.5579<br>  
+
0.125854<br>  
−
0.00219422<br></p>  
+
0.000177259<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行300: 行269:
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-dphi2-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行307: 行281:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
10.1935<br>  
+
1.98112 (31, 52, 0)<br>  
−
0.294779<br>  
+
0.00741588<br>  
−
1.01354<br>  
+
0.0894188<br>  
−
0.00142752<br></p>  
+
0.000125942<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行320: 行294:
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>[[画像:Outdata-sphi90-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行327: 行306:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
−
11.2071<br>  
+
1.98112 (18, 31, 0)<br>  
−
0.292996<br>  
+
0.00741446<br>  
−
1.04152<br>  
+
0.0893007<br>  
−
0.00146694<br></p>  
+
0.000125776<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2013年12月12日 (木) 05:51時点における最新版

mrcImageModelSubfilamentsCreateとはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-nx 選択 Real length = nx * lx 71
-ny 選択 Real length = ny * ly 71
-nz 選択 Real length = nz * lz 100
-lx 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-ly 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-lz 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-position 選択 subfilaments position from center [A] 70
-n 選択 n-helix 3
-dphi 選択 回転角度 [degree] 1.395348837
-sphi 選択 start angle [degree] 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　
※nx, nyは奇数でなければならない

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (58, 41, 0)
0.00306044
0.0749793

0.00108666


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.00741447
0.0893007

0.000125776


オプション　-nx, -ny, -nz

nx=99, ny=99, nz=99で実行

Outdata-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (87, 56, 0)
0.00445187
0.0691579

5.70376e-05


オプション　-lx, -ly, lz

lx=8, ly=8, lz=8で実行

Outdata-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.02889 (41, 2, 20)
0.00867218
0.0969264

0.000136516


オプション　-position

position=35で実行

Outdata-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (66, 42, 0)
0.00869178
0.0977788

0.000137717

オプション　-n

n=6で実行

Outdata-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.0148289
0.125854

0.000177259

オプション　-dphi

dphi=2で実行

Outdata-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.00741588
0.0894188

0.000125942

オプション　-sphi

sphi=90で実行

Outdata-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (18, 31, 0)
0.00741446
0.0893007

0.000125776

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