「pdbCAOnly」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行28: | 行28: | ||
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-c</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>コンフィグファイル設定</td> | ||
| + | <td>NULL</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-m</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>モードを設定</td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-h</td> | <td>-h</td> | ||
2014年1月28日 (火) 01:32時点における版
pdbCAOnlyとはＰＤＢからα炭素だけを抜き出すEosのコマンドである。
オプション一覧
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定: PDB | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル設定: PDB | NULL |
| -oCoord | 選択 | 出力ファイル設定: 座標(x, y, z) | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
実行例
------ 入力ファイルの詳細------
------実行結果------
-o の画像
-oCoord のデータ
-5.913, 31.928, -6.676 -4.759, 28.930, -4.751 -4.531, 29.674, -1.062 -2.465, 27.513, 1.336 -3.586, 27.580, 4.978 -0.458, 26.983, 7.005 -0.267, 26.691, 10.787 2.893, 27.179, 12.917 2.792, 25.223, 16.192 5.273, 24.275, 18.922 -中略- 8.007, 26.321, 0.697 8.752, 22.660, 1.449 5.506, 22.633, 3.471 3.622, 24.164, 0.512 5.079, 21.428, -1.780 3.951, 18.742, 0.732 0.404, 20.135, 0.490 0.711, 20.050, -3.346 1.520, 16.308, -3.145 -1.217, 15.280, -0.638
