「pdbCrystalCreate」の版間の差分
提供: Eospedia
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル: [ | + | <td>入力ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル: [ | + | <td>出力ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行57: | 行57: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
| − | <td> | + | <td></td> |
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
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CellLengthとAxisは依存している。<br> | CellLengthとAxisは依存している。<br> | ||
axisは単位ベクトルでなければならない。<br> | axisは単位ベクトルでなければならない。<br> | ||
| − | HelixInfo t u n</div> | + | HelixInfo: t u n<br> |
| + | CrystalSpaceGroup: 0: P1, 1: らせん対称</div> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
2014年1月28日 (火) 08:23時点における版
pdbCrystalCreateとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -I | 必須 | 入力ファイル: [Crystal Information] | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: PDB | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
-I のフォーマット
aAxis %15.6g %15.6g %15.6g bAxis %15.6g %15.6g %15.6g cAxis %15.6g %15.6g %15.6g CellLength %15.6g %15.6g %15.6g Origin %15.6g %15.6g %15.6g N %15d %15d %15d StartN %15d %15d %15d SpaceGroup %15d HelixInfo %10d %10d %10d
パラメータ設定が重要
CellLengthとAxisは依存している。
axisは単位ベクトルでなければならない。
HelixInfo: t u n
