「mrcImage1dShiftByCorrelation」の版間の差分
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| 行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル</td> | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行20: | 行20: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>参照ファイル</td> | + | <td>参照ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-range</td> | <td>-range</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>Search range of shift. | + | <td>Search range of shift.</td> |
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行32: | 行32: | ||
<td>-s</td> | <td>-s</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>File to define position of signal</td> | + | <td>File to define position of signal: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行66: | 行66: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行82: | 行83: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | ===-s のフォーマット=== | ||
| + | <pre> | ||
| + | sigpos0 sigval0 | ||
| + | sigpos1 sigval1 | ||
| + | . | ||
| + | . | ||
| + | . | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===[[:Media:Input-1VOM-Rot1-2D.mrc|入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-1VOM-Rot1-2D.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-2.31309e-06 (29, 7, 0)<br> | ||
| + | 49749.2 (52, 51, 0)<br> | ||
| + | 6572.32<br> | ||
| + | 8769.91<br> | ||
| + | 109.624<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===[[:Media:Input-1VOM-2D.mrc|参照ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-1VOM-2D.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 49749.7 (27, 28, 0)<br> | ||
| + | 7212.9<br> | ||
| + | 8827.15<br> | ||
| + | 110.339<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -range=== | ||
| + | ====range=40で実行==== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | start1 | ||
| + | corstart | ||
| + | 0 -1.3806 | ||
| + | 1 -1.51544 | ||
| + | 2 -1.50183 | ||
| + | 3 -1.50929 | ||
| + | 4 -1.56575 | ||
| + | |||
| + | 35 -1.70977 | ||
| + | 36 -1.65662 | ||
| + | 37 -1.64502 | ||
| + | 38 -1.66481 | ||
| + | 39 -1.70334 | ||
| + | Input-1VOM-Rot1-2D.mrc Input-1VOM-2D.mrc 0.000000 -1.3806 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
2014年3月5日 (水) 03:05時点における版
mrcImage1dShiftByCorrelationとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -r | 必須 | 参照ファイル: mrcImage | NULL |
| -range | 選択 | Search range of shift. | 0 |
| -s | 必須 | File to define position of signal: ASCII | NULL |
| -d | 選択 | Spacing of molecule(Pixel) | 1.0 |
| -norm | 選択 | Normalize before correlation | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Phase residual |
| 1 | Normal correlation |
-s のフォーマット
sigpos0 sigval0 sigpos1 sigval1 . . .
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
-2.31309e-06 (29, 7, 0) 49749.2 (52, 51, 0) |
参照ファイルの画像
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 49749.7 (27, 28, 0) |
オプション -range
range=40で実行
出力結果
start1 corstart 0 -1.3806 1 -1.51544 2 -1.50183 3 -1.50929 4 -1.56575 35 -1.70977 36 -1.65662 37 -1.64502 38 -1.66481 39 -1.70334 Input-1VOM-Rot1-2D.mrc Input-1VOM-2D.mrc 0.000000 -1.3806
