「CommonLineCalculation」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
行1: 行1:
−
'''CommonLineCalculation'''とは[[Eos]]の[[コマンド]]である。
+
'''CommonLineCalculation'''とは角度情報からコモンラインを算出する[[Eos]]の[[コマンド]]である。
  
  
行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイル設定</td>  
+
<td>入力ファイル: [[ASCII]](m=0で使用)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>入力ファイルリスト設定</td>  
+
<td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>出力ファイル設定</td>  
+
<td>出力ファイル: [[ASCII]]</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行54: 行54:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
−
===モードの詳細===
+
===-m の詳細===
 
<table border="1">
 
<table border="1">
 
<tr>  
 
<tr>  
行70: 行71:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
−
===入力モードの詳細===
+
===-Im の詳細===
 
<table border="1">
 
<table border="1">
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<th>モード</th>  
 
<th>モード</th>  
−
<th>説明</th>  
+
<th>-i のフォーマット</th>
 +
<th>-I のフォーマット</th>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行81: 行84:
 
<td>
 
<td>
 
<pre>
 
<pre>
−
RotationalMode1 angle1 angle2 angle3 RotationalMode2 angle1 angle2 angle3
 
 
RotationalMode1 angle1 angle2 angle3 RotationalMode2 angle1 angle2 angle3
 
RotationalMode1 angle1 angle2 angle3 RotationalMode2 angle1 angle2 angle3
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
 
           .                  .          .          .                .                  .          .          .
−
          .                   .          .          .                .                  .          .          .
+
</pre>
−
          .                  .          .          .                .                  .          .          .
+
</td>
 +
<td>
 +
<pre>
 +
filename
 +
    .
 +
    .
 +
    .
 
</pre>
 
</pre>
 
</td>  
 
</td>  
行93: 行101:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 +
<td>使用しない</td>
 
<td>
 
<td>
 
<pre>
 
<pre>
 
filename RotationalMode angle1 angle2 angle3
 
filename RotationalMode angle1 angle2 angle3
−
    .                  .                .          .          .
 
−
    .                  .                .          .          .
 
 
     .                  .                .          .          .
 
     .                  .                .          .          .
 
     .                  .                .          .          .
 
     .                  .                .          .          .
行105: 行112:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
−
 
+
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 
===入力ファイルのデータ===
 
===入力ファイルのデータ===
−
====-I のデータ====
+
<div>-i のデータ</div>
−
=====Im=1で使用するデータ=====
+
<pre>
 +
YOYS 90 0 0 YOYS 30 5 120
 +
YOYS 90 0 0 YOYS 30 85 60
 +
YOYS 90 0 0 YOYS 60 175 120
 +
YOYS 90 0 0 ZOYS 0 90 0
 +
YOYS 30 5 120 YOYS 30 85 60
 +
YOYS 30 5 120 YOYS 60 175 120
 +
YOYS 30 5 120 ZOYS 0 90 0
 +
YOYS 30 85 60 YOYS 60 175 120
 +
YOYS 30 85 60 ZOYS 0 90 0
 +
YOYS 60 175 120 ZOYS 0 90 0
 +
 
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 
 +
<div>-I のデータ</div>
 
<pre>
 
<pre>
 
/Eos/img/Input0.mrc YOYS 90 0 0
 
/Eos/img/Input0.mrc YOYS 90 0 0
行119: 行141:
  
 
</pre>
 
</pre>
 +
<br>
  
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<pre>
 +
    275.77      152.88 1
 +
    355.67      239.91 1
 +
      80.08      158.58 1
 +
      0.00        0.00 z-rotation
 +
    240.00      300.00 1
 +
    168.02      311.98 1
 +
    332.88      95.77 1
 +
    270.12      242.50 1
 +
      59.91      175.67 1
 +
    338.58      260.08 1
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=0で実行====
 +
<pre>
 +
      32.88      95.77 1
 +
    179.91      175.67 1
 +
      38.58      80.08 1
 +
      0.00        0.00 z-rotation
 +
      60.00      120.00 1
 +
      11.98      48.02 1
 +
      95.77      32.88 1
 +
    122.50      30.12 1
 +
    175.67      179.91 1
 +
      80.08      38.58 1
 +
</pre>
 +
<br>
  
 
===オプション　-Im===
 
===オプション　-Im===
行136: 行189:
 
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      338.58      260.08 1
 
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      338.58      260.08 1
 
</pre>
 
</pre>
 +
<br>
  
 
=====m=0で実行=====
 
=====m=0で実行=====
行150: 行204:
 
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      80.08      38.58 1
 
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      80.08      38.58 1
 
</pre>
 
</pre>
 +
<br>

2014年3月11日 (火) 01:06時点における版

CommonLineCalculationとは角度情報からコモンラインを算出するEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: ASCII(m=0で使用) NULL
-I 選択 入力ファイルリスト: ASCII NULL
-o 選択 出力ファイル: ASCII stdout
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 1
-Im 選択 入力モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


-m の詳細

モード 説明
0 in 2004/07/22
1 in 2004/09/23 (vector product)


-Im の詳細

モード -i のフォーマット -I のフォーマット
0 
RotationalMode1 angle1 angle2 angle3 RotationalMode2 angle1 angle2 angle3
           .                   .           .          .                 .                   .          .           .
           .                   .           .          .                 .                   .          .           .
           .                   .           .          .                 .                   .          .           .
					
filename
     .
     .
     .
1 使用しない 
filename RotationalMode angle1 angle2 angle3
     .                   .                 .          .           .
     .                   .                 .          .           .
     .                   .                 .          .           .


実行例

入力ファイルのデータ

-i のデータ
YOYS	90	0	0	YOYS	30	5	120
YOYS	90	0	0	YOYS	30	85	60
YOYS	90	0	0	YOYS	60	175	120
YOYS	90	0	0	ZOYS	0	90	0
YOYS	30	5	120	YOYS	30	85	60
YOYS	30	5	120	YOYS	60	175	120
YOYS	30	5	120	ZOYS	0	90	0
YOYS	30	85	60	YOYS	60	175	120
YOYS	30	85	60	ZOYS	0	90	0
YOYS	60	175	120	ZOYS	0	90	0


-I のデータ
/Eos/img/Input0.mrc	YOYS	90	0	0
/Eos/img/Input1.mrc	YOYS	30	5	120
/Eos/img/Input2.mrc	YOYS	30	85	60
/Eos/img/Input3.mrc	YOYS	60	175	120
/Eos/img/Input4.mrc	ZOYS	0	90	0


オプション必須項目のみの場合

     275.77      152.88 1
     355.67      239.91 1
      80.08      158.58 1
       0.00        0.00 z-rotation
     240.00      300.00 1
     168.02      311.98 1
     332.88       95.77 1
     270.12      242.50 1
      59.91      175.67 1
     338.58      260.08 1


オプション　-m

m=0で実行

      32.88       95.77 1
     179.91      175.67 1
      38.58       80.08 1
       0.00        0.00 z-rotation
      60.00      120.00 1
      11.98       48.02 1
      95.77       32.88 1
     122.50       30.12 1
     175.67      179.91 1
      80.08       38.58 1


オプション　-Im

Im=1で実行

その他のオプションなし
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input1.mrc      275.77      152.88 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input2.mrc      355.67      239.91 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input3.mrc       80.08      158.58 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input4.mrc        0.00        0.00 z-rotation
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input2.mrc      240.00      300.00 1
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input3.mrc      168.02      311.98 1
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input4.mrc      332.88       95.77 1
/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input3.mrc      270.12      242.50 1
/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input4.mrc       59.91      175.67 1
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc      338.58      260.08 1


m=0で実行
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input1.mrc       32.88       95.77 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input2.mrc      179.91      175.67 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input3.mrc       38.58       80.08 1
/Eos/img/Input0.mrc /Eos/img/Input4.mrc        0.00        0.00 z-rotation
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input2.mrc       60.00      120.00 1
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input3.mrc       11.98       48.02 1
/Eos/img/Input1.mrc /Eos/img/Input4.mrc       95.77       32.88 1
/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input3.mrc      122.50       30.12 1
/Eos/img/Input2.mrc /Eos/img/Input4.mrc      175.67      179.91 1
/Eos/img/Input3.mrc /Eos/img/Input4.mrc       80.08       38.58 1



「https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php?title=CommonLineCalculation&oldid=6854」から取得