「mrcFETnormalizeBySD」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行14: | 行14: | ||
<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイルリスト</td> | + | <td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行32: | 行32: | ||
<td>-rSD</td> | <td>-rSD</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>FETSDfile読み出し</td> | + | <td>FETSDfile読み出し: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行38: | 行38: | ||
<td>-wSD</td> | <td>-wSD</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>FETSDfile書き込み</td> | + | <td>FETSDfile書き込み: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行70: | 行70: | ||
do not use when the inputFileList is large | do not use when the inputFileList is large | ||
</pre> | </pre> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行82: | 行83: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | ===-i のフォーマット=== | ||
| + | <pre> | ||
| + | FETファイル1 | ||
| + | FETファイル2 | ||
| + | . | ||
| + | . | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===入力ファイル=== | ||
| + | <div>-i のデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | Input-1VOM-2D-FET.radon | ||
| + | Input-1VOM-Rot-2D-FET.radon | ||
| + | Input-1VOM-Rot3-2D-FET.radon | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0.046142 0.011605 | ||
| + | 0.176595 0.159164 | ||
| + | 2.266799 0.193134 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -o, -wSD=== | ||
| + | <div>-o のファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0 0 0.604928 | ||
| + | 1 0 0.786169 | ||
| + | 2 0 0.817027 | ||
| + | 0 1 -1.40951 | ||
| + | 1 1 -1.41115 | ||
| + | 2 1 -1.40819 | ||
| + | 0 2 0.80458 | ||
| + | 1 2 0.624979 | ||
| + | 2 2 0.591161 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>-wSD のファイルを[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 0 0 0.0461423 | ||
| + | 1 0 0.176595 | ||
| + | 2 0 2.2668 | ||
| + | 0 1 0.0116049 | ||
| + | 1 1 0.159164 | ||
| + | 2 1 0.193134 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
2014年3月12日 (水) 05:04時点における版
mrcFETnormalizeBySDとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイルリスト: ASCII | NULL |
| -is | 選択 | 入力ファイルリスト: [SDcalc用] | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -rSD | 選択 | FETSDfile読み出し: mrcImage | NULL |
| -wSD | 選択 | FETSDfile書き込み: mrcImage | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-is :[inputsample] is FileList for SDcalculation.
use when the inputFileList is large
-rSD : to use SDdata(without calculate) mrc format
-wSD : write out the SDdata as mrc format
this file can be used next normalize with "-rSD"command.
-o : save all normalized data into one mrcImage.
do not use when the inputFileList is large
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
-i のフォーマット
FETファイル1 FETファイル2 . .
実行例
入力ファイル
-i のデータ
Input-1VOM-2D-FET.radon Input-1VOM-Rot-2D-FET.radon Input-1VOM-Rot3-2D-FET.radon
オプション必須項目のみの場合
出力結果
0.046142 0.011605 0.176595 0.159164 2.266799 0.193134
オプション -o, -wSD
-o のファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0.604928 1 0 0.786169 2 0 0.817027 0 1 -1.40951 1 1 -1.41115 2 1 -1.40819 0 2 0.80458 1 2 0.624979 2 2 0.591161
-wSD のファイルをmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0.0461423 1 0 0.176595 2 0 2.2668 0 1 0.0116049 1 1 0.159164 2 1 0.193134
