「mrcImageDensityInfo」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
(ページの作成:「'''mrcImageDensityInfo'''は、mrcImage型のファイルを保存するものです。」)
 
(→‎モードの詳細)
 
(2人の利用者による、間の8版が非表示)
行1: 行1:
−
'''mrcImageDensityInfo'''は、mrcImage型のファイルを保存するものです。
+
'''mrcImageDensityInfo'''は、[[mrcImage]]ファイルの密度情報（正の値をもつピクセルを指す）を得るための[[Eos]]の[[コマンド]]です。
 +
 
 +
==オプション一覧==
 +
===メインオプション===
 +
<table border="1">
 +
<div align="left">
 +
<tr>
 +
<th>オプション</th>
 +
<th>必須項目/選択項目</th>
 +
<th>NULL</th>
 +
<th>デフォルト</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-i</td>
 +
<td>必須</td>
 +
<td>入力ファイル設定: [[mrcImage]]</td>
 +
<td>NULL</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-o</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>出力ファイル設定: [[ASCII]]</td>
 +
<td>NULL</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-C</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>データの刻み幅を設定</td>
 +
<td>10</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-log</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>ログファイル出力</td>
 +
<td>NULL</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-m</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>モード</td>
 +
<td>0</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>-h</td>
 +
<td>選択</td>
 +
<td>ヘルプを表示</td>
 +
<td>　</td>
 +
</tr>
 +
</div>
 +
</table>
 +
 
 +
===モードの詳細===
 +
<table border="1">
 +
<div align="left">
 +
<tr>
 +
<th>モード</th>
 +
<th>説明</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+1</td>
 +
<td>体積百分率</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+2</td>
 +
<td>重心</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+4</td>
 +
<td>最大値</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+8</td>
 +
<td>重心の周りの標準偏差</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>+16</td>
 +
<td>最大値の周りの標準偏差</td>
 +
</tr>
 +
</div>
 +
</table>
 +
 
 +
==実行例==
 +
===------入力ファイルの画像------===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:B120-mrcImageDensityInfo.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0<br>
 +
65.5929<br>
 +
5.45036<br>
 +
12.3043<br>
 +
0.153804<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
===------オプション　-o------===
 +
<div>出力画面に表示された結果が指定したファイルに格納される<br></div>
 +
 +
===------オプション　-m------===
 +
 +
====モード：１====
 +
[[画像:B120.outdata-m1-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
<br>
 +
====モード：２====
 +
[[画像:B120.outdata-m2-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
<br>
 +
====モード：４====
 +
[[画像:B120.outdata-m4-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
<br>
 +
====モード：８====
 +
[[画像:B120.outdata-m8-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
<br>
 +
====モード：１６====
 +
[[画像:B120.outdata-m16-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
<br>
 +
<div>※モードを３で実行すると、１と２の両方の情報を出力する<br>
 +
例：<br>
 +
[[画像:B120.outdata-m3-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
</div>
 +
 +
===------オプション　-C------===
 +
====C=5で実行した場合====
 +
[[画像:B120.outdata-C5-mrcImageDensityInfo.png]]<br>
 +
====C=15で実行した場合====
 +
[[画像:B120.outdata-C15-mrcImageDensityInfo.png]]<br>

2014年7月24日 (木) 00:29時点における最新版

mrcImageDensityInfoは、mrcImageファイルの密度情報（正の値をもつピクセルを指す）を得るためのEosのコマンドです。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 NULL デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル設定: ASCII NULL
-C 選択 データの刻み幅を設定 10
-log 選択 ログファイル出力 NULL
-m 選択 モード 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
+1 体積百分率
+2 重心
+4 最大値
+8 重心の周りの標準偏差
+16 最大値の周りの標準偏差

実行例

------入力ファイルの画像------

B120-mrcImageDensityInfo.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

65.5929
5.45036
12.3043

0.153804

------オプション　-o------

出力画面に表示された結果が指定したファイルに格納される

------オプション　-m------

モード：１

B120.outdata-m1-mrcImageDensityInfo.png

モード：２

B120.outdata-m2-mrcImageDensityInfo.png

モード：４

B120.outdata-m4-mrcImageDensityInfo.png

モード：８

B120.outdata-m8-mrcImageDensityInfo.png

モード：１６

B120.outdata-m16-mrcImageDensityInfo.png

※モードを３で実行すると、１と２の両方の情報を出力する

例：
B120.outdata-m3-mrcImageDensityInfo.png

------オプション　-C------

C=5で実行した場合

B120.outdata-C5-mrcImageDensityInfo.png

C=15で実行した場合

B120.outdata-C15-mrcImageDensityInfo.png


「https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/index.php?title=mrcImageDensityInfo&oldid=10231」から取得