「mrcImageInfo」の版間の差分
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| (同じ利用者による、間の5版が非表示) | |||
| 行1: | 行1: | ||
| − | '''mrcImageInfo'''とは[[ | + | '''mrcImageInfo'''とは[[mrcImage]]ファイルの画像の情報を表示するための[[Eos]]の[[コマンド]]である。 | 
| == オプション一覧 == | == オプション一覧 == | ||
| 行14: | 行14: | ||
| 				<td>-i</td>   | 				<td>-i</td>   | ||
| 				<td>必須</td>   | 				<td>必須</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>   | 
| 				<td>NULL</td>   | 				<td>NULL</td>   | ||
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 行20: | 行20: | ||
| 				<td>-o</td>   | 				<td>-o</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>出力ファイル: [[ASCII]]</td>   | 
| 				<td>stdout(設定しなければ標準出力)</td>   | 				<td>stdout(設定しなければ標準出力)</td>   | ||
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				<td>-I | + | 				<td>-I</td>   | 
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>このオプションが設定された場合には、<br> | 
| + | 					画像の一般的な統計情報が出力される</td>   | ||
| 				<td></td> | 				<td></td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行32: | 行33: | ||
| 				<td>-X</td>   | 				<td>-X</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>出力: x=Xの値: [[ASCII]]</td>   | 
| 				<td>0.0</td> | 				<td>0.0</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行38: | 行39: | ||
| 				<td>-Y</td>   | 				<td>-Y</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>出力: y=Yの値: [[ASCII]]</td>   | 
| 				<td>0.0</td> | 				<td>0.0</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行44: | 行45: | ||
| 				<td>-x</td>   | 				<td>-x</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>出力: x軸への投影: [[ASCII]]</td>   | 
| 				<td></td> | 				<td></td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行50: | 行51: | ||
| 				<td>-y</td>   | 				<td>-y</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>出力: y軸への投影: [[ASCII]]</td>   | 
| 				<td></td> | 				<td></td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行56: | 行57: | ||
| 				<td>-H</td>   | 				<td>-H</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Normalize): 分割数設定</td>   | 
| 				<td>256</td> | 				<td>256</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行62: | 行63: | ||
| 				<td>-H2</td>   | 				<td>-H2</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Normalize): 幅設定</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行68: | 行69: | ||
| 				<td>-H3</td>   | 				<td>-H3</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Count): 分割数設定</td>   | 
| 				<td>256</td> | 				<td>256</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行74: | 行75: | ||
| 				<td>-H4</td>   | 				<td>-H4</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Count): 幅設定</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行80: | 行81: | ||
| 				<td>-H5</td>   | 				<td>-H5</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 分割数設定</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行86: | 行87: | ||
| 				<td>-H6</td>   | 				<td>-H6</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 幅設定</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行92: | 行93: | ||
| 				<td>-Low</td>   | 				<td>-Low</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>閾値(出力の開始点)</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行98: | 行99: | ||
| 				<td>-High</td>   | 				<td>-High</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td> | + | 				<td>閾値(出力の終了点)</td>   | 
| 				<td>1</td> | 				<td>1</td> | ||
| 			</tr> | 			</tr> | ||
| 行110: | 行111: | ||
| 				<td>-c</td>   | 				<td>-c</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td></td>   | + | 				<td>コンフィグファイル設定</td>   | 
| − | 				<td>NULL</td> | + | 				<td>NULL</td>   | 
| − | 			</tr> | + | 			</tr>   | 
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| 				<td>-m</td>   | 				<td>-m</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td></td>   | + | 				<td>モードを設定</td>   | 
| − | 				<td>0</td> | + | 				<td>0</td>   | 
| − | 			</tr> | + | 			</tr>   | 
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| 				<td>-h</td>   | 				<td>-h</td>   | ||
| 				<td>選択</td>   | 				<td>選択</td>   | ||
| − | 				<td></td>   | + | 				<td>ヘルプを表示</td>   | 
| − | 				<td></td> | + | 				<td> </td>   | 
| − | 			</tr> | + | 			</tr>   | 
|   			</div>   |   			</div>   | ||
| 		</table>   | 		</table>   | ||
| + | <br> | ||
| ===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行136: | 行138: | ||
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>0</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of all density</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>1</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of sphere surface density at rmax</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>2</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of cylinder surface density at rmax</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>3</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of edge pixels</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>4</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of Centre: 未実装</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>5</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of Sparse: 未実装</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>6</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>mean of 2DEdge: 未実装</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 			<tr>   | 			<tr>   | ||
| − | 				< | + | 				<td>7</td>   | 
| − | 				< | + | 				<td>RMS of all pixels</td>   | 
| 			</tr>   | 			</tr>   | ||
| 		</div>   | 		</div>   | ||
| 	</table> | 	</table> | ||
| − | + | <br> | |
| == 実行例 == | == 実行例 == | ||
| ===入力ファイルの画像=== | ===入力ファイルの画像=== | ||
| [[画像:B120-2-mrcImageInfo.png]] | [[画像:B120-2-mrcImageInfo.png]] | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>以下の画像はm=1, m=2で使用する</div> | ||
| + | [[画像:Input(3D)-mrcImageInfo.png]] | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <div>オプションなしでは何も出力されない。 </div> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -I=== | ||
| + | <pre> | ||
| + | Min:               0 (41, 10, 0)	最小値(最小を取る座標) | ||
| + | Max:             255 (42, 36, 0)	最大値(最大を取る座標) | ||
| + | Mean:         111.211		平均値 | ||
| + | SD:          32.7239			標準偏差 | ||
| + | SE:         0.409049			標準誤差 | ||
| + | Sum:          711751			 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -X=== | ||
| + | ====X=40で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |     0             117 | ||
| + |     1             118 | ||
| + |     2             128 | ||
| + |     3             100 | ||
| + |     4             133 | ||
| + |     5              70 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |    74             118 | ||
| + |    75              73 | ||
| + |    76              83 | ||
| + |    77              97 | ||
| + |    78              79 | ||
| + |    79              96 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -Y=== | ||
| + | ====Y=40で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |     0             105 | ||
| + |     1             130 | ||
| + |     2              76 | ||
| + |     3              98 | ||
| + |     4             113 | ||
| + |     5              86 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |    74             131 | ||
| + |    75             111 | ||
| + |    76              97 | ||
| + |    77              79 | ||
| + |    78              71 | ||
| + |    79             128 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -x===  | ||
| + | <pre> | ||
| + |     0             230 | ||
| + |     1               2 | ||
| + |     2              23 | ||
| + |     3             157 | ||
| + |     4             107 | ||
| + |     5             108 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |    74             197 | ||
| + |    75              57 | ||
| + |    76             118 | ||
| + |    77             157 | ||
| + |    78              49 | ||
| + |    79             102 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -y===  | ||
| + | <pre> | ||
| + |     0              66 | ||
| + |     1             116 | ||
| + |     2             223 | ||
| + |     3             135 | ||
| + |     4             185 | ||
| + |     5             231 | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |    74             154 | ||
| + |    75             158 | ||
| + |    76             177 | ||
| + |    77             189 | ||
| + |    78             244 | ||
| + |    79               5 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H=== | ||
| + | ====H=256で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0      0.00990099 | * | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               2               0 |* | ||
| + |               3               0 |* | ||
| + |               4               0 |* | ||
| + |               5               0 |* | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |              62        0.217822 |    * | ||
| + |              63        0.326733 |      * | ||
| + |              64        0.306931 |     * | ||
| + |              65        0.267327 |     * | ||
| + |              66        0.326733 |      * | ||
| + |              67        0.336634 |      * | ||
| + |              68        0.287129 |     * | ||
| + |              69        0.356436 |      * | ||
| + |              70        0.356436 |      * | ||
| + |              71        0.386139 |       * | ||
| + |              72         0.39604 |       * | ||
| + |              73        0.386139 |       * | ||
| + |              74        0.415842 |       * | ||
| + |              75        0.386139 |       * | ||
| + |              76        0.465347 |        * | ||
| + |              77        0.475248 |        * | ||
| + |              78        0.475248 |        * | ||
| + |              79        0.584158 |          * | ||
| + |              80         0.50495 |         * | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             116        0.920792 |               * | ||
| + |             117        0.920792 |               * | ||
| + |             118        0.683168 |           * | ||
| + |             119               1 |                * | ||
| + |             120        0.782178 |             * | ||
| + |             121        0.712871 |            * | ||
| + |             122        0.623762 |          * | ||
| + |             123        0.594059 |          * | ||
| + |             124        0.653465 |           * | ||
| + |             125         0.70297 |            * | ||
| + |             126         0.70297 |            * | ||
| + |             127        0.653465 |           * | ||
| + |             128        0.613861 |          * | ||
| + |             129        0.633663 |           * | ||
| + |             130        0.485149 |        * | ||
| + |             131        0.564356 |          * | ||
| + |             132        0.514851 |         * | ||
| + |             133        0.475248 |        * | ||
| + |             134        0.405941 |       * | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             250               0 |* | ||
| + |             251               0 |* | ||
| + |             252               0 |* | ||
| + |             253               0 |* | ||
| + |             254               0 |* | ||
| + |             255      0.00990099 | * | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ====H=16で実行==== | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0      0.00213068 | * | ||
| + |              17      0.00497159 | * | ||
| + |              34       0.0326705 | * | ||
| + |              51        0.139915 |   * | ||
| + |              68         0.40625 |       * | ||
| + |              85        0.796165 |             * | ||
| + |             102               1 |                * | ||
| + |             119        0.922585 |               * | ||
| + |             136        0.585227 |          * | ||
| + |             153        0.319602 |      * | ||
| + |             170        0.176847 |   * | ||
| + |             187       0.0852273 |  * | ||
| + |             204       0.0539773 | * | ||
| + |             221       0.0106534 | * | ||
| + |             238       0.0078125 | * | ||
| + |             255      0.00142045 | * | ||
| + | </pre>  | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H2=== | ||
| + | ====H2=2で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0      0.00540541 | * | ||
| + |               2               0 |* | ||
| + |               4               0 |* | ||
| + |               6               0 |* | ||
| + |               8       0.0108108 | * | ||
| + |              10               0 |* | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |              62        0.259459 |     * | ||
| + |              64        0.345946 |      * | ||
| + |              66        0.324324 |      * | ||
| + |              68        0.340541 |      * | ||
| + |              70        0.389189 |       * | ||
| + |              72        0.427027 |       * | ||
| + |              74        0.437838 |        * | ||
| + |              76        0.464865 |        * | ||
| + |              78        0.518919 |         * | ||
| + |              80        0.594595 |          * | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             116        0.989189 |                * | ||
| + |             118        0.875676 |               * | ||
| + |             120        0.972973 |                * | ||
| + |             122         0.72973 |            * | ||
| + |             124        0.681081 |           * | ||
| + |             126        0.767568 |             * | ||
| + |             128        0.691892 |            * | ||
| + |             130        0.610811 |          * | ||
| + |             132        0.589189 |          * | ||
| + |             134        0.481081 |        * | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             244      0.00540541 | * | ||
| + |             246       0.0108108 | * | ||
| + |             248      0.00540541 | * | ||
| + |             250               0 |* | ||
| + |             252               0 |* | ||
| + |             254               0 |* | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H3=== | ||
| + | ====H3=256で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0               1  | ||
| + |               1               0  | ||
| + |               2               0  | ||
| + |               3               0  | ||
| + |               4               0  | ||
| + |               5               0  | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             125              71  | ||
| + |             126              71  | ||
| + |             127              66  | ||
| + |             128              62  | ||
| + |             129              64  | ||
| + |             130              49  | ||
| + |             131              57  | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             250               0  | ||
| + |             251               0  | ||
| + |             252               0  | ||
| + |             253               0  | ||
| + |             254               0  | ||
| + |             255               1  | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H4=== | ||
| + | ====H4=1で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0               1  | ||
| + |               1               0  | ||
| + |               2               0  | ||
| + |               3               0  | ||
| + |               4               0  | ||
| + |               5               0  | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             125              71  | ||
| + |             126              71  | ||
| + |             127              66  | ||
| + |             128              62  | ||
| + |             129              64  | ||
| + |             130              49  | ||
| + |             131              57  | ||
| + | |||
| + | -中略- | ||
| + | |||
| + |             250               0  | ||
| + |             251               0  | ||
| + |             252               0  | ||
| + |             253               0  | ||
| + |             254               0  | ||
| + |             255               1  | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H5=== | ||
| + | ====H5=16で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               1               1 |                * | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + |               1               0 |* | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ====H5=16, Low=0, High=255で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0      0.00213068 | * | ||
| + |              17      0.00497159 | * | ||
| + |              34       0.0326705 | * | ||
| + |              51        0.139915 |   * | ||
| + |              68         0.40625 |       * | ||
| + |              85        0.796165 |             * | ||
| + |             102               1 |                * | ||
| + |             119        0.922585 |               * | ||
| + |             136        0.585227 |          * | ||
| + |             153        0.319602 |      * | ||
| + |             170        0.176847 |   * | ||
| + |             187       0.0852273 |  * | ||
| + |             204       0.0539773 | * | ||
| + |             221       0.0106534 | * | ||
| + |             238       0.0078125 | * | ||
| + |             255      0.00142045 | * | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -H6=== | ||
| + | ====H6=16で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               1               1  | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ====H6=16, Low=0, High=255で実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + |               0      0.00213068  | ||
| + |              16      0.00497159  | ||
| + |              32       0.0326705  | ||
| + |              48        0.139915  | ||
| + |              64         0.40625  | ||
| + |              80        0.796165  | ||
| + |              96               1  | ||
| + |             112        0.922585  | ||
| + |             128        0.585227  | ||
| + |             144        0.319602  | ||
| + |             160        0.176847  | ||
| + |             176       0.0852273  | ||
| + |             192       0.0539773  | ||
| + |             208       0.0106534  | ||
| + |             224       0.0078125  | ||
| + |             240      0.00142045  | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -m=== | ||
| + | ====m=1, Iで実行==== | ||
| + | =====他のオプション設定なし===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | Mean:       0.616809 | ||
| + | SD:       0.673385 | ||
| + | SE:      0.0013199 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | =====rmax=50で実行===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | Mean:         1.1812 | ||
| + | SD:       0.106769 | ||
| + | SE:    0.000209277 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ====m=2, Iで実行==== | ||
| + | =====他のオプション設定なし===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | Mean:    -1.1766e-05 | ||
| + | SD:    0.000598326 | ||
| + | SE:    2.23951e-06 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | =====rmax=50で実行===== | ||
| + | <pre> | ||
| + | Mean:        1.01668 | ||
| + | SD:       0.477893 | ||
| + | SE:     0.00178873 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ====m=3, Iで実行====  | ||
| + | <pre> | ||
| + | Mean:         102.924 | ||
| + | SD:           25.5864 | ||
| + | SE:           1.43935 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| − | === | + | ====m=7, Iで実行====   | 
| <pre> | <pre> | ||
| − | + | RMS:         115.926 | |
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
| </pre> | </pre> | ||
| + | <br> | ||
2014年3月10日 (月) 06:58時点における最新版
mrcImageInfoとはmrcImageファイルの画像の情報を表示するためのEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト | 
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL | 
| -o | 選択 | 出力ファイル: ASCII | stdout(設定しなければ標準出力) | 
| -I | 選択 | このオプションが設定された場合には、 画像の一般的な統計情報が出力される | |
| -X | 選択 | 出力: x=Xの値: ASCII | 0.0 | 
| -Y | 選択 | 出力: y=Yの値: ASCII | 0.0 | 
| -x | 選択 | 出力: x軸への投影: ASCII | |
| -y | 選択 | 出力: y軸への投影: ASCII | |
| -H | 選択 | ヒストグラム出力(Normalize): 分割数設定 | 256 | 
| -H2 | 選択 | ヒストグラム出力(Normalize): 幅設定 | 1 | 
| -H3 | 選択 | ヒストグラム出力(Count): 分割数設定 | 256 | 
| -H4 | 選択 | ヒストグラム出力(Count): 幅設定 | 1 | 
| -H5 | 選択 | ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 分割数設定 | 1 | 
| -H6 | 選択 | ヒストグラム出力(Count: -Low, -Highを使用): 幅設定 | 1 | 
| -Low | 選択 | 閾値(出力の開始点) | 1 | 
| -High | 選択 | 閾値(出力の終了点) | 1 | 
| -rmax | 選択 | rmax [A] | 250 | 
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL | 
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 | 
| -h | 選択 | ヘルプを表示 | 
モードの詳細
| モード | 説明 | 
|---|---|
| 0 | mean of all density | 
| 1 | mean of sphere surface density at rmax | 
| 2 | mean of cylinder surface density at rmax | 
| 3 | mean of edge pixels | 
| 4 | mean of Centre: 未実装 | 
| 5 | mean of Sparse: 未実装 | 
| 6 | mean of 2DEdge: 未実装 | 
| 7 | RMS of all pixels | 
実行例
入力ファイルの画像
以下の画像はm=1, m=2で使用する
オプション必須項目のみの場合
オプションなしでは何も出力されない。 
オプション -I
Min: 0 (41, 10, 0) 最小値(最小を取る座標) Max: 255 (42, 36, 0) 最大値(最大を取る座標) Mean: 111.211 平均値 SD: 32.7239 標準偏差 SE: 0.409049 標準誤差 Sum: 711751
オプション -X
X=40で実行
    0             117
    1             118
    2             128
    3             100
    4             133
    5              70
-中略-
   74             118
   75              73
   76              83
   77              97
   78              79
   79              96
オプション -Y
Y=40で実行
    0             105
    1             130
    2              76
    3              98
    4             113
    5              86
-中略-
   74             131
   75             111
   76              97
   77              79
   78              71
   79             128
オプション -x
    0             230
    1               2
    2              23
    3             157
    4             107
    5             108
-中略-
   74             197
   75              57
   76             118
   77             157
   78              49
   79             102
オプション -y
    0              66
    1             116
    2             223
    3             135
    4             185
    5             231
-中略-
   74             154
   75             158
   76             177
   77             189
   78             244
   79               5
オプション -H
H=256で実行
              0      0.00990099 | *
              1               0 |*
              2               0 |*
              3               0 |*
              4               0 |*
              5               0 |*
-中略-
             62        0.217822 |    *
             63        0.326733 |      *
             64        0.306931 |     *
             65        0.267327 |     *
             66        0.326733 |      *
             67        0.336634 |      *
             68        0.287129 |     *
             69        0.356436 |      *
             70        0.356436 |      *
             71        0.386139 |       *
             72         0.39604 |       *
             73        0.386139 |       *
             74        0.415842 |       *
             75        0.386139 |       *
             76        0.465347 |        *
             77        0.475248 |        *
             78        0.475248 |        *
             79        0.584158 |          *
             80         0.50495 |         *
-中略-
            116        0.920792 |               *
            117        0.920792 |               *
            118        0.683168 |           *
            119               1 |                *
            120        0.782178 |             *
            121        0.712871 |            *
            122        0.623762 |          *
            123        0.594059 |          *
            124        0.653465 |           *
            125         0.70297 |            *
            126         0.70297 |            *
            127        0.653465 |           *
            128        0.613861 |          *
            129        0.633663 |           *
            130        0.485149 |        *
            131        0.564356 |          *
            132        0.514851 |         *
            133        0.475248 |        *
            134        0.405941 |       *
-中略-
            250               0 |*
            251               0 |*
            252               0 |*
            253               0 |*
            254               0 |*
            255      0.00990099 | *
H=16で実行
              0      0.00213068 | *
             17      0.00497159 | *
             34       0.0326705 | *
             51        0.139915 |   *
             68         0.40625 |       *
             85        0.796165 |             *
            102               1 |                *
            119        0.922585 |               *
            136        0.585227 |          *
            153        0.319602 |      *
            170        0.176847 |   *
            187       0.0852273 |  *
            204       0.0539773 | *
            221       0.0106534 | *
            238       0.0078125 | *
            255      0.00142045 | *
 
オプション -H2
H2=2で実行
              0      0.00540541 | *
              2               0 |*
              4               0 |*
              6               0 |*
              8       0.0108108 | *
             10               0 |*
-中略-
             62        0.259459 |     *
             64        0.345946 |      *
             66        0.324324 |      *
             68        0.340541 |      *
             70        0.389189 |       *
             72        0.427027 |       *
             74        0.437838 |        *
             76        0.464865 |        *
             78        0.518919 |         *
             80        0.594595 |          *
-中略-
            116        0.989189 |                *
            118        0.875676 |               *
            120        0.972973 |                *
            122         0.72973 |            *
            124        0.681081 |           *
            126        0.767568 |             *
            128        0.691892 |            *
            130        0.610811 |          *
            132        0.589189 |          *
            134        0.481081 |        *
-中略-
            244      0.00540541 | *
            246       0.0108108 | *
            248      0.00540541 | *
            250               0 |*
            252               0 |*
            254               0 |*
オプション -H3
H3=256で実行
              0               1 
              1               0 
              2               0 
              3               0 
              4               0 
              5               0 
-中略-
            125              71 
            126              71 
            127              66 
            128              62 
            129              64 
            130              49 
            131              57 
-中略-
            250               0 
            251               0 
            252               0 
            253               0 
            254               0 
            255               1 
オプション -H4
H4=1で実行
              0               1 
              1               0 
              2               0 
              3               0 
              4               0 
              5               0 
-中略-
            125              71 
            126              71 
            127              66 
            128              62 
            129              64 
            130              49 
            131              57 
-中略-
            250               0 
            251               0 
            252               0 
            253               0 
            254               0 
            255               1 
オプション -H5
H5=16で実行
              1               1 |                *
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
              1               0 |*
H5=16, Low=0, High=255で実行
              0      0.00213068 | *
             17      0.00497159 | *
             34       0.0326705 | *
             51        0.139915 |   *
             68         0.40625 |       *
             85        0.796165 |             *
            102               1 |                *
            119        0.922585 |               *
            136        0.585227 |          *
            153        0.319602 |      *
            170        0.176847 |   *
            187       0.0852273 |  *
            204       0.0539773 | *
            221       0.0106534 | *
            238       0.0078125 | *
            255      0.00142045 | *
オプション -H6
H6=16で実行
              1               1 
H6=16, Low=0, High=255で実行
              0      0.00213068 
             16      0.00497159 
             32       0.0326705 
             48        0.139915 
             64         0.40625 
             80        0.796165 
             96               1 
            112        0.922585 
            128        0.585227 
            144        0.319602 
            160        0.176847 
            176       0.0852273 
            192       0.0539773 
            208       0.0106534 
            224       0.0078125 
            240      0.00142045 
オプション -m
m=1, Iで実行
他のオプション設定なし
Mean: 0.616809 SD: 0.673385 SE: 0.0013199
rmax=50で実行
Mean: 1.1812 SD: 0.106769 SE: 0.000209277
m=2, Iで実行
他のオプション設定なし
Mean: -1.1766e-05 SD: 0.000598326 SE: 2.23951e-06
rmax=50で実行
Mean: 1.01668 SD: 0.477893 SE: 0.00178873
m=3, Iで実行
Mean: 102.924 SD: 25.5864 SE: 1.43935
m=7, Iで実行
RMS: 115.926


