「mrcImagePrint」の版間の差分

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(同じ利用者による、間の11版が非表示)
行20: 行20:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>出力ファイル: テキスト</td>  
+
<td>出力ファイル: psファイル</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
<td>stdout</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行86: 行86:
 
<td>-C</td>  
 
<td>-C</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>ContourLevel</td>  
+
<td>[[可変入力]]: コンターレベル</td>  
−
<td>1.0</td>  
+
<td>1.0 ...</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Black is High Density</td>  
+
<td>反転</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行122: 行122:
 
<td>-Y</td>  
 
<td>-Y</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Y-axis expanding</td>  
+
<td>y軸の拡大率</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行194: 行194:
 
<td>-ReverseOrder</td>  
 
<td>-ReverseOrder</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Reverse Print Order</td>  
+
<td>ページを逆順にする</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行212: 行212:
 
<td>-Centre</td>  
 
<td>-Centre</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Image Centre is at the centre of paper.</td>  
+
<td>画像の中心をページの中心に合わせる</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行276: 行276:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>16</td>  
 
<td>16</td>  
−
<td>Scale</td>  
+
<td>目盛りの表示</td>  
 
</tr>   
 
</tr>   
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>32</td>  
 
<td>32</td>  
−
<td>Centre Mark</td>  
+
<td>中心点の表示</td>  
 
</tr>   
 
</tr>   
 
<tr>  
 
<tr>  
行298: 行298:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルの画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-mrcImagePrint.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
5 (34, 41, 36)<br>
 +
0.00471829<br>
 +
0.0933498<br>
 +
0.000162869<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata(s)-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-S===
 +
====S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-S-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-H===
 +
====H=1, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-H-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-L===
 +
====L=1.5, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-L-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-Section===
 +
====Section=x, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-Section-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-x, -y, -z===
 +
====x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-xyz-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>11/21ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-AS===
 +
====AS=1で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-AS-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-center===
 +
====center=(30, 30), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-center-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-I===
 +
====I, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-I-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-A===
 +
====A, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-A-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-Y===
 +
====Y=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-Y-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-ReverseOrder===
 +
====ReverseOrder, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-ReverseOrder-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>31/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-ReverseOrder-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-untwist===
 +
====untwist=0.1, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-untwist-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-untwist-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-UpsideDown===
 +
====UpsideDown, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-UpsideDown-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>31/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-UpsideDown-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-Centre===
 +
====Centre, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-Centre-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-Centre-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m1-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=17, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m17-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m2-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m6-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m10-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m34-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-m62-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-AC===
 +
====AC=3, m=62, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-AC-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-PC===
 +
====PC=1, m=62, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-PC-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-AC2===
 +
====AC2=4, m=62, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-AC2-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-CircleRadius===
 +
====CircleRadius=0.75, m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-CircleRadius-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>

2014年7月29日 (火) 03:44時点における最新版

mrcImagePrintとはEosのコマンドである。


目次

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: psファイル stdout
-H 選択 High Threshold 0.0
-L 選択 Low Threshold 1.0
-Section 選択 [z|x|y]Section z
-x 選択 x section:(xMin, xMax) (0, 0)
-y 選択 y section:(yMin, yMax) (0, 0)
-z 選択 z section:(zMin, zMax) (0, 0)
-S 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel 1.0
-AS 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) 1.0
-E 選択 Enlargement(image center is center) 1.0
-center 選択 Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) (0.0, 0.0)
-C 選択 可変入力: コンターレベル 1.0 ...
-I 選択 反転
-A 選択 HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD
-AC 選択 Auto Contour(thresHigh <-> mean) 10
-PC 選択 Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 10
-AC2 選択 Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) 10
-Y 選択 y軸の拡大率 1
-RGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) (0, 0, 0)
-RGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-HSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) (0, 0, 0)
-HSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourRGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) (0, 0, 0)
-LineColourRGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourHSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) (0, 0, 0)
-LineColourHSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineChange 選択 Contour Color Change 0.1
-LineWidthStart 選択 Contour Line Width Start 0.1
-LineWidthStep 選択 Contour Line Width Step 0.05
-ReverseOrder 選択 ページを逆順にする
-Untwist 選択 Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 0.0
-UpsideDown 選択 Upside Down
-Centre 選択 画像の中心をページの中心に合わせる
-CircleRadius 選択 Radius of circles in the case of imageCircles 0.5
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 49
-h 選択 ヘルプを表示 　 
				-C  option is stronger than -AC and -PC
				-PC option is stronger than -AC
					-AC: (i+1)*(max-maen)  /(AC+1) + mean 
					-PC: (i  )*(max+mean)/2)/AC     + (max+mean)/2
				-AS option is stronger than -S option
				The default value of -AS option is ignored.
				The default value of -S option is used.
				Both options are applied to y-axis.

モードの詳細

モード 説明
1 ImageDensity
2 Contour(DiffrentLineWidth)
4 Contour(SameLineWidth)
8 BlackCircles
16 目盛りの表示
32 中心点の表示
16777216 Amplitude by AsciiFile
33554432 Log of Amplitude by AsciiFile
67108864 Phase by AsciiFile


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImagePrint.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

5 (34, 41, 36)
0.00471829
0.0933498

0.000162869

オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata(s)-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-S

S=2で実行

Outdata-S-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata2-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-H

H=1, S=2で実行

Outdata-H-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-L

L=1.5, S=2で実行

Outdata-L-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-Section

Section=x, S=2で実行

Outdata-Section-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-x, -y, -z

x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行

Outdata-xyz-mrcImagePrint.png
11/21ページ

オプション　-AS

AS=1で実行

Outdata-AS-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-center

center=(30, 30), S=2で実行

Outdata-center-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-I

I, S=2で実行

Outdata-I-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-A

A, S=2で実行

Outdata-A-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-Y

Y=2で実行

Outdata-Y-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-ReverseOrder

ReverseOrder, S=2で実行

Outdata-ReverseOrder-mrcImagePrint.png
31/69ページ
Outdata2-ReverseOrder-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-untwist

untwist=0.1, S=2で実行

Outdata-untwist-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata2-untwist-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-UpsideDown

UpsideDown, S=2で実行

Outdata-UpsideDown-mrcImagePrint.png
31/69ページ
Outdata2-UpsideDown-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-Centre

Centre, S=2で実行

Outdata-Centre-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata2-Centre-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-m

m=1, S=2で実行

Outdata-m1-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=17, S=2で実行

Outdata-m17-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-m2-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-m6-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-m10-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-m34-mrcImagePrint.png
39/69ページ

m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-m62-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-AC

AC=3, m=62, S=2で実行

Outdata-AC-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-PC

PC=1, m=62, S=2で実行

Outdata-PC-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-AC2

AC2=4, m=62, S=2で実行

Outdata-AC2-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-CircleRadius

CircleRadius=0.75, m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行

Outdata-CircleRadius-mrcImagePrint.png
39/69ページ

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