「mrcRefSmoothing」の版間の差分
| (同じ利用者による、間の2版が非表示) | |||
| 行87: | 行87: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| − | === | + | ===[[Media:Input-121P1-R.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Input- | + | <td><p align="center">[[画像:Input-121P1-R163.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行97: | 行101: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | |
| − | + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | |
| − | + | 6082.23<br> | |
| + | 6479.76<br> | ||
| + | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション -m=== | ===オプション -m=== | ||
| 行110: | 行117: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-m1-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m1-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行117: | 行128: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | |
| − | + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | |
| − | + | 6082.23<br> | |
| + | 6479.76<br> | ||
| + | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
====m=2で実行==== | ====m=2で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-m2-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m2-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行136: | 行154: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1410.88 (15, 26, 132)<br> | |
| − | + | 29742.1 (33, 26, 4)<br> | |
| − | + | 2238.05<br> | |
| + | 2466.5<br> | ||
| + | 3.51315<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
====m=3で実行==== | ====m=3で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-m3-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m3-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行155: | 行180: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1410.88 (15, 26, 132)<br> | |
| − | + | 29742.1 (33, 26, 4)<br> | |
| − | + | 844.502<br> | |
| + | 1886.37<br> | ||
| + | 2.68684<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
====m=4で実行==== | ====m=4で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-m4-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m4-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行174: | 行206: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1503.16 (13, 25, 131)<br> | |
| − | + | 36873.4 (27, 20, 158)<br> | |
| − | + | 6082.23<br> | |
| + | 6479.76<br> | ||
| + | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | |||
===オプション -sx, -sy, -sz=== | ===オプション -sx, -sy, -sz=== | ||
| − | ====sx= | + | ====sx=19, sy=29, m=2で実行==== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Outdata-sxsysz-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-sxsy-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
| − | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> | ||
| + | mrcFloatImage <br> | ||
| + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | ||
| + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | ||
| + | 4559.66<br> | ||
| + | 5500.61<br> | ||
| + | 7.83477<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ====sx=19, sy=29, sz=1, m=2で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-sxsysz-mrcRefSmoothing.png]]<br> | ||
| + | z=163<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
| 行194: | 行259: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
| − | + | mrcFloatImage <br> | |
| − | + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | |
| − | + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | |
| − | + | 5582.97<br> | |
| + | 5734.53<br> | ||
| + | 8.16794<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
2013年12月25日 (水) 05:47時点における最新版
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -sx | 選択 | カーネルサイズ x: 奇数 | 3 |
| -sy | 選択 | カーネルサイズ y: 奇数 | 3 |
| -sz | 選択 | カーネルサイズ z: 奇数 | 3 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0: 未定義 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 1 | Median filter |
| 2 | Mean filter |
| 3 | Surface Fit filter |
| 4 | Lee-Sigma filter |
実行例
入力ファイルの画像
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション -m
m=1で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=2で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=3で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=4で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション -sx, -sy, -sz
sx=19, sy=29, m=2で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
sx=19, sy=29, sz=1, m=2で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |